| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2854319 | 183 (0.900) | 28 (0.150) | 12/150 | NT | 13.7% | intergenic (+17/+396) | yflS/USA300HOU_RS14625 | Putative malate transporter YflS/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2854338 | 181 (0.950) | intergenic (+36/+377) | yflS/USA300HOU_RS14625 | Putative malate transporter YflS/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
TATTAGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATCCT > USA300TCH1516_ALE/2854229‑2854409 | tatTAGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGC < 2:2471343‑M1/91‑1 (MQ=255) tAGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTCAAATATTTAAATTAGCGCTCg > 1:1076721/1‑91 (MQ=255) tAGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCg > 2:1312639/1‑91 (MQ=255) aGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGa > 1:3358919/1‑91 (MQ=255) aGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGa > 1:1872331/1‑91 (MQ=255) ggTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGT‑ATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAAt > 2:219675/1‑91 (MQ=255) gTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAAt < 2:714358/91‑1 (MQ=255) tttCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAAtc > 2:2291857/1‑91 (MQ=255) tCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAAtctc < 1:969248/91‑1 (MQ=255) cGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCa > 2:1482053/1‑91 (MQ=255) cGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCa < 1:3855733/91‑1 (MQ=255) cGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCa < 1:3525978/91‑1 (MQ=255) gTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCAt > 1:1242868/1‑91 (MQ=255) gTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCAt > 2:340120/1‑91 (MQ=255) gTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCAt > 1:1177624/1‑91 (MQ=255) tCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCAtt < 2:3906665/91‑1 (MQ=255) cTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCccaaatcaatgag < 2:1933057‑M1/91‑14 (MQ=255) cTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTg > 1:3021932/1‑91 (MQ=255) tACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCccaaatcaatgaga < 1:1352767‑M1/91‑15 (MQ=255) tACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCccaaatcaatgaga < 1:3934370‑M1/91‑15 (MQ=255) ttattgTCTGGATTGGTTTAGGATCTCTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCccaaatcaatgagattcg < 1:3669692‑M1/91‑19 (MQ=255) ttattaTCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTg > 1:2073237/1‑91 (MQ=255) tattatCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCccaaatcaatgagattcga < 1:1586532‑M1/91‑20 (MQ=255) tattatCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTgg > 1:3312142/1‑91 (MQ=255) attatCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGg < 1:3081575‑M2/91‑2 (MQ=255) ttatCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgc > 1:2277363‑M2/1‑89 (MQ=255) tatCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgcg < 1:3441147‑M2/91‑4 (MQ=255) atCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCccaaatcaatgagattcgagcgc < 1:565077‑M1/91‑24 (MQ=255) atCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCccaaatcaatgagattcgagcgc < 2:2857007‑M1/91‑24 (MQ=255) tCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgcgct > 2:2113570‑M2/1‑86 (MQ=255) cTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCtt > 1:2557117/1‑91 (MQ=255) cTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCtt < 2:1525280/91‑1 (MQ=255) tGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCttt < 2:787076/91‑1 (MQ=255) ggATTGGTTTAGGATCACTTTGGGTGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCccaaatcaatgagattcgagcgctaat < 2:1163863‑M1/91‑28 (MQ=255) gATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCttttt > 2:186169/1‑91 (MQ=255) gATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCttttt < 1:1837357/91‑1 (MQ=255) tGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaa < 2:2756122‑M1/91‑32 (MQ=255) tGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaa < 2:2755429‑M1/91‑32 (MQ=255) tGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaa < 2:3897078‑M1/91‑32 (MQ=255) gTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAAttt > 1:1483743/1‑91 (MQ=255) ttAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGt > 1:240737/1‑91 (MQ=255) tAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTa < 1:618898/91‑1 (MQ=255) tAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTa > 2:3711137/1‑91 (MQ=255) ggATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTAtt > 1:2672686/1‑91 (MQ=255) aTCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTa > 1:2013981/1‑91 (MQ=255) tCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTaa > 1:3191235/1‑91 (MQ=255) cACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATCAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTaaa > 2:3042689/1‑91 (MQ=255) aaCTTTGGATGAGAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTaaa < 2:1301636/90‑1 (MQ=255) cTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAAt < 1:3147764/91‑1 (MQ=255) cTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAAt < 1:3301278/91‑1 (MQ=255) tttGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATc < 2:2986633/91‑1 (MQ=255) ttGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCa > 2:2194008/1‑91 (MQ=255) gttGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAAcc > 2:659045/3‑91 (MQ=255) aTGAAAGTATTTGGTATATTTTAAAATAGTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTGTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCt < 2:2044036/91‑1 (MQ=255) aTGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCt > 2:3492759/1‑91 (MQ=255) aTGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCt > 2:3238638/1‑91 (MQ=255) tGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCtt < 2:3311066/91‑1 (MQ=255) aaaGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTg > 2:1858765/1‑91 (MQ=255) aaaGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTg > 1:2445335/1‑91 (MQ=255) aaaGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTg > 1:2927716/1‑91 (MQ=255) aaGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGc > 2:1157076/1‑91 (MQ=255) aaGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGc > 1:1257672/1‑91 (MQ=255) aaGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGc > 2:619250/1‑91 (MQ=255) aGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCATTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCt < 1:3507943/91‑1 (MQ=255) tAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTaa > 1:3394423/1‑91 (MQ=255) aTTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAAt < 2:3588040/91‑1 (MQ=255) gTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAg < 1:1124820/91‑1 (MQ=255) tataTTTTGAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGa < 2:2573393/91‑1 (MQ=255) tataTTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGa < 1:731215/91‑1 (MQ=255) atatTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGAc > 2:111791/1‑91 (MQ=255) ttttAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTcc > 1:1396743/1‑91 (MQ=255) ttttAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTcc < 1:2273340/91‑1 (MQ=255) tttAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTccc < 2:810159/91‑1 (MQ=255) tAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCtt > 1:1161544/1‑91 (MQ=255) aaaaTATTTAAATTCGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCttt > 2:3363598/1‑91 (MQ=255) aaaaTATTTAAATTAGTGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCttt > 2:1369907/1‑91 (MQ=255) aaaaTATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCttt > 1:1000004/1‑91 (MQ=255) aaaaTATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCttt > 1:32002/1‑91 (MQ=255) aaaaTATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCttt < 1:893980/91‑1 (MQ=255) aaTATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAAGCAAGACTCCCttttt < 2:1127646/91‑1 (MQ=255) atatTTATGTTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTa < 2:1813271/91‑1 (MQ=255) atatTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTa < 2:2363448/91‑1 (MQ=255) atatTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTa > 1:3440713/1‑91 (MQ=255) atTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTaaa < 2:2642065/91‑1 (MQ=255) atTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTCGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTaaa > 2:688835/1‑91 (MQ=255) tttAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTaaaa < 1:8418/91‑1 (MQ=255) tAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTATTTAATTTGTATTTAAAATCACCCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATa > 1:3178793/1‑91 (MQ=255) ttAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgcgctaatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatcctaaaccaatcca < 1:2421602‑M2/91‑66 (MQ=255) ttAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGtt > 2:3815410/1‑91 (MQ=255) tAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgcgctaatttaaatattttaaaatataccaagtactttcatccaaagtgatcctaaaccaatccag < 2:841983‑M2/91‑67 (MQ=255) tAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGttt > 2:1403543/1‑91 (MQ=255) aGCGCccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatcctaaaccaatccaga > 2:1075563‑M1/1‑5 (MQ=255) gcgcccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatcctaaaccaatccagat < 2:3704160‑M1/91‑88 (MQ=255) gcgcTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTAt < 1:2804494/91‑1 (MQ=255) cgcTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATc < 2:543479/91‑1 (MQ=255) cgcTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATc > 2:1211182/1‑91 (MQ=255) gcccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatcctaaaccaatccagataa > 2:8916‑M1/1‑2 (MQ=255) gcTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATcc > 2:217728/1‑91 (MQ=255) cccaaatcaatgagattcgagcgctgatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatcctaaaccaatccagataat < 1:178508‑M1/91‑91 (MQ=255) cTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATCCt > 1:3605532/1‑91 (MQ=255) | TATTAGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATCCT > USA300TCH1516_ALE/2854229‑2854409 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |