| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 62785 = | 241 (1.180) | 13 (0.070) | 8/142 | NT | 6.6% | intergenic (‑252/+261) | USA300TCH1516_00053/speG | hypothetical protein/Spermidine N(1)‑acetyltransferase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 62819 = | 153 (0.850) | intergenic (‑286/+227) | USA300TCH1516_00053/speG | hypothetical protein/Spermidine N(1)‑acetyltransferase | |||||
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
AACAACGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTT > USA300TCH1516_ALE/62695‑62875 | acgctgtaacaacggtacttaataacgatttgcaaacaattattaatgactatctatcagaatgaagcttatattaatttcaacaaaaata > 2:1969681‑M1/91‑91 (MQ=255) cgctgtaacaacggtacttaataacgatttgcaaacaattattaatgactatctatcagaatgaagcttatattaatttcaacaaaaatag > 2:3825754‑M1/90‑91 (MQ=255) gctgtaacaacggtacttaataacgatttgcaaacaattattaatgactatctatcagaatgaagcttatattaatttcaacaaaaataga > 1:643111‑M1/89‑91 (MQ=255) aacGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGagag < 2:924805/91‑1 (MQ=255) aacGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGagag < 1:2397439/91‑1 (MQ=255) tgtaacaacggtacttaataacgatttgcaaacaattattaatgactatctatcagaatgaagcttatattaatttcaacaaaaatAGAGc > 1:2961828‑M1/87‑91 (MQ=255) gtaacaacggtacttaataacgatttgcaaacaattattaatgactatctatcagaatgaagcttatattaatttcaacaaaaatAGAGCa < 2:1329673‑M1/6‑1 (MQ=255) gtaacaacggtacttaataacgatttgcaaacaattattaatgactatctatcagaatgaagcttatattaatttcaacaaaaatAGAGCa < 1:814787‑M1/6‑1 (MQ=255) cGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAAGAAATTGAGAGCa < 1:3051331/91‑1 (MQ=255) taacaacggtacttaataacgatttgcaaacaattattaatgactatctatcagaatgaagcttatataaataaaaaaaaaaatAGAGCAt > 2:3306744‑M1/85‑91 (MQ=255) cAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATc > 2:1026545/1‑91 (MQ=255) acaacggtacttaataacgatttgcaaacaattattaatgactatctatcagattgaagcttatattaatttcaacaaaaatAGAGCATcc > 1:3319361‑M1/83‑91 (MQ=255) acaacggtacttaataacgatttgcaaacaattattaatgactatctatcagaatgaagcttatattaatttcaacaaaaatAGAGCATcc > 2:1252719‑M1/83‑91 (MQ=255) acaacggtacttaataacgatttgcaaacaattattaatgaatatctatcagaatgaagcttatattaaattcaacaaaaatAGAGCATcc > 2:656874‑M1/83‑91 (MQ=255) aaaCAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATcc > 2:2747569/1‑91 (MQ=255) aaaCAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATcc < 1:1538015/91‑1 (MQ=255) aaCAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATccc > 2:2047389/1‑91 (MQ=255) aaCAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATccc > 1:2587179/1‑91 (MQ=255) aaCAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATccc > 2:2937343/1‑91 (MQ=255) cAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCtt < 2:1469270/91‑1 (MQ=255) aaGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTa < 1:1724993/91‑1 (MQ=255) ggCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTAcc < 1:3456771/91‑1 (MQ=255) gCTTACTACAAACAATGTTTGTGTAATTCTGATACCGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACACAACTAAATTGCGAGCATCCCTTACCg < 2:2131309/91‑1 (MQ=255) gCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCg < 1:910011/91‑1 (MQ=255) gCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCg < 2:1106929/91‑1 (MQ=255) ttACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCa > 2:2533338/1‑91 (MQ=255) tactacAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCaa > 1:3746570/1‑91 (MQ=255) ctacAGAAAATGTTTGTGTAATTCTTATAACGTCCTATTGTGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAg < 1:3672326/91‑1 (MQ=255) ctacAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAg < 2:2624413/91‑1 (MQ=255) ctacAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAg < 2:1773425/91‑1 (MQ=255) ctacAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAg < 2:3703093/91‑1 (MQ=255) ctacAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAg < 1:1752852/91‑1 (MQ=255) cAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGa > 2:2876683/1‑91 (MQ=255) acgatttgcaaacaattattaatgactatctatcagaatgaagcttatattaatttcaacaaaaatAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGaa > 1:3115332‑M1/67‑91 (MQ=255) aaaaTGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAgg > 1:486346/1‑91 (MQ=255) aaaaTGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAgg < 1:2552845/91‑1 (MQ=255) aaaaTGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAgg > 2:1538887/1‑91 (MQ=255) aaTGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGAt > 1:3211608/1‑91 (MQ=255) aTGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATg < 1:3372346/91‑1 (MQ=255) tGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGc < 1:2152963/91‑1 (MQ=255) tGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGc < 1:2719453/91‑1 (MQ=255) gTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGct > 1:1513840/1‑91 (MQ=255) tttGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGctc < 1:3465679/91‑1 (MQ=255) tttGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGctc > 1:1620131/1‑91 (MQ=255) tttGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATCGCGACCCTCCCTTACCGCACAGTGAAGCACGctc > 2:1303817/1‑91 (MQ=255) ttGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGctct > 1:2664303/1‑91 (MQ=255) ttGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGctct < 2:351560/91‑1 (MQ=255) ttGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGctct > 2:341436/1‑91 (MQ=255) gtgtAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTAt < 2:448422/91‑1 (MQ=255) tgtAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTAtt < 1:736061/91‑1 (MQ=255) gtAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTAttt < 1:88186/91‑1 (MQ=255) tAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTAtttt < 1:1264805/91‑1 (MQ=255) ttCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTttgt < 1:994967/91‑1 (MQ=255) ttCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTttgt > 1:184391/1‑91 (MQ=255) tCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTttgtt < 2:2004740/91‑1 (MQ=255) cTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTttgttg > 1:1113244/1‑91 (MQ=255) tGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGa < 2:1644732/91‑1 (MQ=255) tGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGa < 2:1933014/91‑1 (MQ=255) gATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGaa > 2:315829/1‑91 (MQ=255) gATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGaa > 1:1404651/1‑91 (MQ=255) tAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAAt > 1:2043601/1‑91 (MQ=255) aCGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTa > 1:1017090/1‑91 (MQ=255) aCGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTa > 2:2834526/1‑91 (MQ=255) cGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTaa > 1:391294/1‑91 (MQ=255) cGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTaa < 2:3139016/91‑1 (MQ=255) ccTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAatat > 2:556639/1‑91 (MQ=255) cTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAAtata < 2:1906800/91‑1 (MQ=255) cTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAAtata < 2:2037409/91‑1 (MQ=255) cTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAAtata > 1:2778114/1‑91 (MQ=255) ttatGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGc > 2:2350064/1‑91 (MQ=255) ttatGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATCAATATAAGc > 2:84526/1‑91 (MQ=255) tatGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAATTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCt < 2:415510/91‑1 (MQ=255) tatGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCt < 1:44683/91‑1 (MQ=255) tGTTACTTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGCTGCTCTATTTTTGTTGAAGTTAATAGAAGCtta > 2:3954705/1‑90 (MQ=255) tGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTc < 2:882890/91‑1 (MQ=255) ttAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCAt < 2:118145/91‑1 (MQ=255) aaTTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTc < 1:3509314/91‑1 (MQ=255) ttGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTg > 1:576242/1‑91 (MQ=255) cttatattaatttcaacaaaaatAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTga > 2:2381822‑M1/24‑91 (MQ=255) aaTAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTgataga < 2:3555108/91‑1 (MQ=255) aTAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTgatagat > 1:2056800/1‑91 (MQ=255) aTAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTgatagat > 1:3015501/1‑91 (MQ=255) tAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAATGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTgatagata < 2:3917704/91‑1 (MQ=255) tAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTgatagata < 2:2789668/91‑1 (MQ=255) aGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGatagatag < 1:1586962/91‑1 (MQ=255) aGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATGCTTGTTGAAATTAATATAAGCGTCATTCTGatagatag > 2:2427752/1‑91 (MQ=255) gACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGt < 1:2330627/91‑1 (MQ=255) aCAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTc > 2:3361380/1‑91 (MQ=255) aaaaaTAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCAt > 1:3604286/1‑91 (MQ=255) aaataaatTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATta > 2:1382630/1‑91 (MQ=255) aaataaatTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATta < 2:2971085/91‑1 (MQ=255) ataagtTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATtaat < 1:3744290/91‑1 (MQ=255) ataaatTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATtaat < 1:1324005/91‑1 (MQ=255) ataaatTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATtaat < 1:980446/91‑1 (MQ=255) ataaatTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATtaat < 1:2783379/91‑1 (MQ=255) taaatTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATtaata > 2:363484/1‑91 (MQ=255) aaatTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATtaataa < 2:3204254/91‑1 (MQ=255) aatTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTaataat > 2:378436/1‑91 (MQ=255) AGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGttt > 1:710389‑M1/1‑91 (MQ=255) AGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGttt > 2:1076835‑M1/1‑91 (MQ=255) | AACAACGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTT > USA300TCH1516_ALE/62695‑62875 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |