| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 351315 | NA (NA) | 13 (0.070) | 6/146 | NT | 5.7% | coding (259/501 nt) | yezG_8 | putative antitoxin YezG |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 352313 | 238 (1.170) | coding (235/489 nt) | yezG_10 | putative antitoxin YezG | |||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
ATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTGATTATA > USA300TCH1516_ALE/351244‑351405 | aTTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAgg < 1:3784322/91‑1 (MQ=31)aTTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAgg > 2:579421/1‑91 (MQ=31)aTTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAgg < 2:2577682/91‑1 (MQ=31)aTTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAgg < 1:1553640/91‑1 (MQ=31) ttGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAggg > 1:1334998/1‑91 (MQ=32) ttGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAggg > 1:606106/1‑91 (MQ=32) ttGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAggg > 2:202818/1‑91 (MQ=32) gCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCt < 2:3317742/91‑1 (MQ=34) gCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCt > 2:2722306/1‑91 (MQ=34) gCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCt > 2:2781871/1‑91 (MQ=33) gCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCt < 2:2810607/91‑1 (MQ=33) gCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCt > 1:1627396/1‑91 (MQ=34) gCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCt > 1:416893/1‑91 (MQ=34) gCAATATCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCt < 2:1175768/91‑1 (MQ=21) cAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCtt > 1:2643506/1‑91 (MQ=34) cAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCtt > 1:3446926/1‑91 (MQ=34) aaTGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTg > 2:1472192/1‑91 (MQ=34) aaTGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTg > 1:1940097/1‑91 (MQ=34) aaTGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTg > 2:725724/1‑91 (MQ=34) gTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAAc > 1:799231/1‑91 (MQ=34) gTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAAc > 1:2514358/1‑91 (MQ=34) tctcAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAAcc > 1:556064/1‑91 (MQ=34) ctcAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCa < 2:3708362/91‑1 (MQ=34) cAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATg < 1:500059/91‑1 (MQ=34) cAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATg < 1:3303081/91‑1 (MQ=34) cAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATg < 2:2192104/91‑1 (MQ=34) cAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATg < 2:77061/91‑1 (MQ=34) cAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATg < 1:1074524/91‑1 (MQ=34) aaaaGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCAtag > 2:1652884/1‑89 (MQ=21) aaaaGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATgg > 1:2517582/1‑91 (MQ=34) aaaaGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATgg > 1:1655833/1‑91 (MQ=34) aaaGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGa < 2:3268104/91‑1 (MQ=34) aaaGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGa > 2:3524998/1‑91 (MQ=34) aaaGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGa > 1:983944/1‑91 (MQ=34) aaGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGAc < 2:902156/91‑1 (MQ=34) gATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGAcat < 1:300796/91‑1 (MQ=34) atatTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGAcatc < 1:309403/91‑1 (MQ=34) atatTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGAcatc > 2:988388/1‑91 (MQ=33) atatTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGAcatc < 1:309043/91‑1 (MQ=34) tatTTTTAATTATTTTTGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGAcatca > 2:1993269/1‑91 (MQ=11) tatTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGAcatca < 2:285728/91‑1 (MQ=34) tatTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGAcatca > 1:918972/1‑91 (MQ=34) tttttAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATg < 2:151012/91‑1 (MQ=33) tttttAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATg < 2:2711771/91‑1 (MQ=34) tttttAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATg > 1:1338122/1‑91 (MQ=34) ttttAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGc > 1:2876425/1‑91 (MQ=34) ttAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGa < 2:3075541/91‑1 (MQ=34) aaGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAAt < 1:3283319/91‑1 (MQ=34) aGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAAtt < 2:2379867/91‑1 (MQ=34) gAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAAttt > 1:988209/1‑91 (MQ=34) aaTTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTg < 2:1489222/91‑1 (MQ=34) ttCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTACGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGAc > 1:2110590/1‑91 (MQ=18) ttCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGAc < 2:601854/91‑1 (MQ=34) ttCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGAc > 2:703797/1‑91 (MQ=33) ttCATGGGTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGTGAATTTGAc < 1:1975066/91‑1 (MQ=255) cATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACtt > 2:3292938/1‑91 (MQ=34) cATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACtt > 1:1032439/1‑91 (MQ=34) cATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACtt < 1:3027330/91‑1 (MQ=34) cATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACtt > 2:2142827/1‑91 (MQ=33) cATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACACCATGCGAATTTGACtt > 2:3780344/1‑91 (MQ=21) cATGGTTTAAACTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACtt < 1:3580148/91‑1 (MQ=21) aTGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACttt > 1:2068519/1‑91 (MQ=34) ggTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTAc > 1:3851478/1‑91 (MQ=34) ggTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTAc > 2:2345861/1‑91 (MQ=34) ggTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTAc < 1:583738/91‑1 (MQ=34) tttAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACaa > 2:1095281/1‑91 (MQ=34) aaGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAgaga < 2:1287326/91‑1 (MQ=34) aGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGAt < 2:913179/91‑1 (MQ=34) aGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGAt < 2:616704/91‑1 (MQ=33) gTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATg > 1:3032185/1‑91 (MQ=34) gTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATg < 1:1466334/91‑1 (MQ=34) tttATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATgg > 2:962035/1‑91 (MQ=34) tttATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATgg < 1:1162923/91‑1 (MQ=34) ttATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGc > 1:1253453/1‑91 (MQ=34) tCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCaaa < 2:1061703/91‑1 (MQ=33) cGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAAt < 2:294803/91‑1 (MQ=34) cGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAAt < 1:1485676/91‑1 (MQ=34) gAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAAtt < 1:2201306/91‑1 (MQ=34) gAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAAtt > 1:2925012/1‑91 (MQ=34) tttGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATg < 1:3936250/91‑1 (MQ=34) tttGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATg < 2:2100043/91‑1 (MQ=33) ttGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGt < 2:763515/91‑1 (MQ=33) tgatgaGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTa < 1:2087951/91‑1 (MQ=34) tgatgaGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTa < 1:2787031/91‑1 (MQ=34) atgaGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATc < 1:2908448/91‑1 (MQ=34) tgaGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCt < 2:3362034/91‑1 (MQ=34) aGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCttt < 1:20580/91‑1 (MQ=33) gTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCtttt > 1:1260852/1‑91 (MQ=34) ttAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTg > 2:1030633/1‑91 (MQ=34) ttAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTg > 2:2340068/1‑91 (MQ=34) tAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTGa > 2:18602/1‑91 (MQ=34) aaGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTGAt < 1:676092/91‑1 (MQ=34) aaGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTGAt > 2:1958582/1‑91 (MQ=34) agagAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTGAtt < 2:3557403/91‑1 (MQ=34) agagAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATCTGACTTGACAAGAGATGGCAAATTGAATGTAATTTTTGAtt > 2:2794778/1‑91 (MQ=11) gagaAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTGATta < 1:1613065/91‑1 (MQ=34) gagaAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTGATta < 2:391680/91‑1 (MQ=34) gagaAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTGATta < 1:632246/91‑1 (MQ=34) gaAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTGATtata < 1:648056/91‑1 (MQ=34) gaAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTGATtata < 1:2123845/91‑1 (MQ=33) | ATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAAGTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAGAAGAAGGGCTTGAACCATGGACATCATGCGAATTTGACTTTACAAGAGATGGCAAATTGAATGTATCTTTTGATTATA > USA300TCH1516_ALE/351244‑351405 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |