| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 351315 | NA (NA) | 13 (0.070) | 6/146 | NT | 5.7% | coding (259/501 nt) | yezG_8 | putative antitoxin YezG |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 352313 | 238 (1.170) | coding (235/489 nt) | yezG_10 | putative antitoxin YezG | |||||
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
CCAGGAAGTGAAGATTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGAAAGGGAA > USA300TCH1516_ALE/352223‑352403 | cAGGAAGTGAAGATTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCACTGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTa > 2:1159204/1‑91 (MQ=255) cAGGAAGTGAACATTTGAATTATGATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAATATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTa < 2:3024870/91‑1 (MQ=255) aGGAAGTGAAGATTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTAt < 1:2426593/91‑1 (MQ=255) gAAGTGAAGATTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCg < 2:722364/91‑1 (MQ=255) aaGTGAAGATTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGa < 1:1112785/91‑1 (MQ=255) gTGAAGATTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAAt > 1:3562325/1‑91 (MQ=255) gAAGATTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGt > 1:520704/1‑91 (MQ=255) aaGATTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGtt > 2:927801/1‑91 (MQ=255) aaGATTTGAATTATTATTCAGACATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGtt < 2:3181539/91‑1 (MQ=255) gATTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTtg < 2:1808425/91‑1 (MQ=255) gATTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTtg > 2:1372738/1‑91 (MQ=255) aTTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTtga < 1:1478479/91‑1 (MQ=255) aTTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGATTTAAA‑GTTTATCGAATGTTtga < 2:3577364/91‑1 (MQ=255) tttGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTtgat < 1:3592424/91‑1 (MQ=255) tGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAAGTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTtgatga < 2:1739069/91‑1 (MQ=255) gAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAg < 1:3134391/91‑1 (MQ=39) attattattCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGtt > 2:1836405/1‑91 (MQ=39) attattattCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGtt > 2:2065217/1‑91 (MQ=39) ttattattCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTa > 1:11593/1‑91 (MQ=39) tattattCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTaa > 1:638980/1‑91 (MQ=39) tattattCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTaa > 1:2672317/1‑91 (MQ=39) attattCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAag < 1:1771953/91‑1 (MQ=39) ttattCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAaga < 2:648747/91‑1 (MQ=39) attCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTctcttaactcatcaaacattcgata > 1:2802904‑M2/1‑66 (MQ=255) attCAGACATACCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTctcttaactcatcaaacattcgata > 2:1205405‑M2/1‑66 (MQ=255) tCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTctcttaactcatcaaacattcgataaa > 2:2141701‑M2/1‑64 (MQ=255) tCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGaaa < 2:2253980/91‑1 (MQ=37) cAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAAc < 1:1901189/91‑1 (MQ=39) tatTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACtttt > 2:2767519/1‑91 (MQ=34) atTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTa < 1:1761514/91‑1 (MQ=33) ccTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTaaaa > 2:2493321/1‑91 (MQ=31) ccTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTaaaa < 1:167823/91‑1 (MQ=31) ccTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTaaaa > 2:687951/1‑91 (MQ=31) cTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTaaaaa < 1:264765/91‑1 (MQ=32) tAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTaaaaaa < 2:3328233/91‑1 (MQ=33) gATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAaagaag > 1:1623165/1‑91 (MQ=34) aTTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAagaaga < 2:2910643/91‑1 (MQ=34) ttGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGAt < 2:454714/91‑1 (MQ=35) gCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGAttt > 1:2735707/1‑91 (MQ=38) gCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGAttt < 2:2586586/91‑1 (MQ=38) aaTGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAg < 1:932933/91‑1 (MQ=40) aTGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATACATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGa > 1:2194013/1‑91 (MQ=255) tcAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTCAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGCACCGt > 2:287998/1‑91 (MQ=255) tcAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGt > 2:1124947/1‑91 (MQ=255) tcAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGt < 1:1006155/91‑1 (MQ=255) aaaaGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTgg > 1:806376/1‑91 (MQ=255) aaaaGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACATTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTgg < 2:2469533/91‑1 (MQ=255) atatTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGAcatc > 2:2271068/1‑91 (MQ=255) tttttAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCAtg > 2:3810961/1‑91 (MQ=255) ttttAAGAATTCATGGTTTAAAAGTTTctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagac > 1:2354797‑M2/1‑27 (MQ=255) tttAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCAtgtg > 1:1269049/1‑91 (MQ=255) aaGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAAt < 1:3031537/91‑1 (MQ=255) aGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAAtt < 1:2742145/91‑1 (MQ=255) aGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAAtt < 1:3098886/91‑1 (MQ=255) gAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAAttt < 1:2525656/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTg < 2:2972201/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTg > 2:1456589/1‑91 (MQ=255) aTTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGa > 2:657889/1‑91 (MQ=255) aTTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGa > 1:185966/1‑91 (MQ=255) ttCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGAc < 2:832003/91‑1 (MQ=255) ttCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGAc < 1:283203/91‑1 (MQ=255) cATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACtt > 1:21649/1‑91 (MQ=255) gTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACa < 2:1326377/91‑1 (MQ=255) gTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTATAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACa < 2:3473916/91‑1 (MQ=255) ttAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAg < 2:3747358/91‑1 (MQ=255) taata‑gttactcttaactgatcaaacagtcaataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtat > 2:404011‑M2/5‑9 (MQ=255) tAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGa < 1:2070832/91‑1 (MQ=255) tAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGa < 1:3716793/91‑1 (MQ=255) aaa‑GTTTctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgt > 2:3348197‑M2/1‑7 (MQ=255) aa‑GTTTctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgttacattgcaatctttaggtatgtc < 2:878622‑M2/91‑86 (MQ=255) aa‑GTTTctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtc < 1:2002765‑M2/91‑86 (MQ=255) aa‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGaaa > 1:2306538/1‑91 (MQ=255) aa‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGaaa > 1:2911342/1‑91 (MQ=255) a‑GTTTctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtct > 1:61249‑M2/1‑5 (MQ=255) a‑GTTTctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtct < 2:1414595‑M2/91‑87 (MQ=255) a‑GTTTctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattccaatctttaggtatgtct > 2:1462568‑M2/1‑5 (MQ=255) a‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGAAAg > 1:2482720/1‑91 (MQ=255) gTTTctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctg > 2:1279299‑M2/1‑4 (MQ=255) gTTTctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctg < 2:3768608‑M2/91‑88 (MQ=255) gTTTctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctg > 2:2362350‑M2/1‑4 (MQ=255) gTTTctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctg < 2:1784229‑M2/91‑88 (MQ=255) gTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTGAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGAAAgg < 2:3121827/91‑1 (MQ=255) gTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGAAAgg < 1:3814924/91‑1 (MQ=255) ttttTCGAAAATTTGATGATTTAAGAGAATGCTATAAAAAAGAAGATCTAGAACCGTGCACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGAAAggg < 2:3885465/91‑1 (MQ=17) tttctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctga < 1:2270508‑M2/91‑89 (MQ=255) tttctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctga > 2:3223950‑M2/1‑3 (MQ=255) tttctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctga < 1:3491352‑M2/91‑89 (MQ=255) tttctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctga < 1:2586201‑M2/91‑89 (MQ=255) tttctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctga < 2:1960032‑M2/91‑89 (MQ=255) tttctcttaactcatcaaacattcgataaacttcaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctga > 1:3239256‑M2/1‑3 (MQ=255) tttATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGAAAggg < 1:3927865/91‑1 (MQ=255) ttctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctgaa > 1:1929172‑M2/1‑2 (MQ=255) ttctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctgaa < 1:1374572‑M2/91‑90 (MQ=255) ttctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctgaa < 1:1828689‑M2/91‑90 (MQ=255) ttctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctgaa < 1:1738129‑M2/91‑90 (MQ=255) ttATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGAAAGGGa < 2:1997339/91‑1 (MQ=255) tctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctgaat > 2:1542920‑M2/1‑1 (MQ=255) tctcttaactcatcaaacattcgataaactttaaaccatgaattcttaaaaatatcttttgagacattgcaatctttaggtatgtctgaat < 1:388280‑M2/91‑91 (MQ=255) tATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGAAAGGGaa > 2:537065/1‑91 (MQ=255) tATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGAAAGGGaa > 1:755777/1‑91 (MQ=255) | CCAGGAAGTGAAGATTTGAATTATTATTCAGATATTCCTAAAGATTGCAATGTCTCAAAAGATATTTTTAAGAATTCATGGTTTAAA‑GTTTATCGAATGTTTGATGAGTTAAGAGAAACTTTTAAAAAAGAAGATTTAGAACCGTGGACATCATGTGAATTTGACTTTACAAGAAAGGGAA > USA300TCH1516_ALE/352223‑352403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |