| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 681130 = | 223 (1.090) | 20 (0.120) | 9/136 | NT | 10.4% | intergenic (‑200/+8) | USA300HOU_RS03280/USA300TCH1516_00615 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 681182 = | 155 (0.900) | coding (310/354 nt) | USA300TCH1516_00615 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
ATAGTATGCTTCTTTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCT > USA300TCH1516_ALE/681040‑681220 | taaacaaattaatgcacggcctcgaatgatatttgactataaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgaa < 2:1324040‑M1/2‑1 (MQ=255) tAGTATGCTTCTTTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTaa > 2:1873515/1‑91 (MQ=255) aGTATGCTTCTTTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAAc < 2:16402/91‑1 (MQ=255) gTATGCTTCTTTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAAcc > 1:2954898/1‑91 (MQ=255) aacaaattaatgcacggcctcgaatgatatttgactataaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAAcc < 1:3658223‑M1/4‑1 (MQ=255) aacaaattaatgcacggcctcgaatgatatttgactataaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAAcc < 1:701685‑M1/4‑1 (MQ=255) aacaaattaatgcacggcctcgaatgatatttgactataaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAAcc > 2:2306821‑M1/88‑91 (MQ=255) tATGCTTCTTTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCt < 1:30962/91‑1 (MQ=255) acaaattaatgcacggcctcgaatgatatttgactataaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAACCt > 2:3738486‑M1/87‑91 (MQ=255) acaaattaatgcacggcctcgaatgatatttgactataaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAACCt < 1:2346424‑M1/5‑1 (MQ=255) aTGCTTCTTTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCta < 2:2001546/91‑1 (MQ=255) tGCTTCTTTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCtat > 2:835733/1‑91 (MQ=255) aaattaatgcacggcctcgaatgatatttgactataaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAACCtat > 1:3745763‑M1/85‑91 (MQ=255) aattaatgcacggcctcgaatgatatttgactataaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAACCtata > 1:240271‑M1/84‑91 (MQ=255) cttcttTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTatat > 2:1536104/1‑91 (MQ=255) attaatgcacggcctcgaatgatatttgactataaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAACCTatat < 2:3087366‑M1/9‑1 (MQ=255) ttcttTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATAtt < 2:2146371/91‑1 (MQ=255) ttcttTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATAtt < 1:2611876/91‑1 (MQ=255) ttaatgcacggcctcgaatgatattttactataaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaagtgtgAACCTATAtt < 2:178933‑M1/10‑1 (MQ=255) cttTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTaa > 1:3823997/1‑91 (MQ=255) cttTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTaa > 2:3299668/1‑91 (MQ=255) aatgcacggcctcgaatgatatttgactataaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAACCTATATTaa < 1:2255991‑M1/12‑1 (MQ=255) ttttAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAAtt > 2:2128717/1‑91 (MQ=255) tttAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTg > 2:2991824/1‑91 (MQ=255) tttAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTg > 2:1024569/1‑91 (MQ=255) tttAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTg > 1:1396051/1‑91 (MQ=255) tttAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTg < 1:2435309/91‑1 (MQ=255) ttATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGt < 1:961342/91‑1 (MQ=255) tATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGtt > 1:2991837/1‑91 (MQ=255) tGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCg < 1:1871705/91‑1 (MQ=255) tGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCg < 2:2417489/91‑1 (MQ=255) gCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGt > 2:719298/1‑91 (MQ=255) cATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTg > 1:3284258/1‑91 (MQ=255) ttttACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGcc > 1:1074278/1‑91 (MQ=255) ttttACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGcc < 1:3478550/91‑1 (MQ=255) tttACATACAAAATTTGTTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCt < 2:3780743/91‑1 (MQ=255) ttACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTc < 2:1677278/91‑1 (MQ=255) ttACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTc < 1:3866409/91‑1 (MQ=255) catacaAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTcaca < 1:2153759/91‑1 (MQ=255) catacaAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTcaca > 1:3403750/1‑91 (MQ=255) atacaAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTcacac < 1:2809461/91‑1 (MQ=255) atacaAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTcacac < 2:3659825/91‑1 (MQ=255) atacaAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCCCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCCTCCCTcaccc > 2:3604473/1‑89 (MQ=255) tacaAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTcacaca > 2:2314344/1‑91 (MQ=255) aaaTTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCa > 1:843079/1‑91 (MQ=255) taaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCAtt > 2:91719‑M1/51‑91 (MQ=255) aaatcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaactgtgAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCAttt > 1:3135307‑M1/50‑91 (MQ=255) tATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTaa > 2:2764140/1‑91 (MQ=255) tATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTaa < 2:3104702/91‑1 (MQ=255) tATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTaa > 2:1277513/1‑91 (MQ=255) atcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAACCTATATTAATGGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTaa > 2:732521‑M1/48‑91 (MQ=255) tcgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAat > 1:2824273‑M1/47‑91 (MQ=255) aTTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAat > 2:1216368/1‑91 (MQ=255) ttCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAata < 2:20316/91‑1 (MQ=255) cgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAata > 1:1539227‑M1/46‑91 (MQ=255) cgagtgaggaaatgctaaagtaccatgtaagcacacaaaattgtgAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAata > 1:3738867‑M1/46‑91 (MQ=255) tCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAatat > 2:664411/1‑91 (MQ=255) tCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAatat < 2:285380/91‑1 (MQ=255) cGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAAtata > 2:501578/1‑91 (MQ=255) cGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAAtata > 1:2910916/1‑91 (MQ=255) cGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAAtata < 1:583311/91‑1 (MQ=255) ctgtcctTCCGCGCTCATTGTCAACCATTCGCTTAGATCAACCTATATTCATTGACGGGTTCGTGCCCCACACAGTCATTTAATATAGGtt < 2:2862299/91‑1 (MQ=255) ctgtcctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGtt > 1:1573044/1‑91 (MQ=255) ctgtcctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTACCTCACACAGTCATTTAATATAGGtt < 2:2249603/91‑1 (MQ=255) tgtcctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTc > 1:193228/1‑91 (MQ=255) gtcctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTca > 2:3446237/1‑91 (MQ=255) tcctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTcac < 2:1605806/91‑1 (MQ=255) cctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTcaca < 1:2868786/91‑1 (MQ=255) ctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACaa < 2:3178448/91‑1 (MQ=255) tCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAAtt > 1:51529/1‑91 (MQ=255) tCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAAtt > 1:682393/1‑91 (MQ=255) ccGCACTCATGGTTAGGCATTGGCTTAGGTGAACCTATATTAAATGACGGGTTGGTGCCGCACTCGGTCATTTAATATAGGTTCACAAttt < 2:1724360/91‑1 (MQ=255) cgcgCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAAtttt < 1:1783954/91‑1 (MQ=255) cgcgCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAAtttt < 1:3356204/91‑1 (MQ=255) aTTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCt < 1:1009015/91‑1 (MQ=255) ttGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCtt > 1:903382/1‑91 (MQ=255) tGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTa > 2:2684980/1‑91 (MQ=255) aaaCCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACAt < 2:3864485/91‑1 (MQ=255) aaCCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTTTGCTTACATg > 1:443993/1‑91 (MQ=255) aaCCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATg > 2:1157629/1‑91 (MQ=255) cATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTa > 2:2823697/1‑91 (MQ=255) aTTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTAc > 2:2530481/1‑91 (MQ=255) tCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACtt < 1:781731/91‑1 (MQ=255) tCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACtt > 1:1208136/1‑91 (MQ=255) cGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACttt > 1:63564/1‑91 (MQ=255) cGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACttt > 2:584731/1‑91 (MQ=255) gCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTa < 1:1150953/91‑1 (MQ=255) gCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTa < 1:1315734/91‑1 (MQ=255) gCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTa < 2:353147/91‑1 (MQ=255) gCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTa < 1:1663430/91‑1 (MQ=255) cTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAg < 1:3593081/91‑1 (MQ=255) ttAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGc > 1:3920417/1‑91 (MQ=255) ttAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGc > 2:1461302/1‑91 (MQ=255) ttAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGc < 2:3414705/91‑1 (MQ=255) aGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCAt < 2:1914943/91‑1 (MQ=255) gATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCAtt > 1:1625554/1‑91 (MQ=255) ttAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTc < 2:3572224/91‑1 (MQ=255) ttAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTc < 1:3568235/91‑1 (MQ=255) tAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTcc < 2:450464/91‑1 (MQ=255) AACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCt > 1:2485234‑M1/1‑91 (MQ=255) | ATAGTATGCTTCTTTTTAGATTATGCATTTTACATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCT > USA300TCH1516_ALE/681040‑681220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |