| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 760026 = | 226 (1.110) | 21 (0.130) | 12/132 | NT | 11.3% | coding (1674/1674 nt) | USA300HOU_RS03705 | Putative multidrug export ATP‑binding/permease protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 760070 = | 145 (0.870) | intergenic (+44/+83) | USA300HOU_RS03705/mgrA | Putative multidrug export ATP‑binding/permease protein/HTH‑type transcriptional regulator MgrA | |||||
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
GATAAATGGTAAAATAGTTGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCTTAATAAAT > USA300TCH1516_ALE/759936‑760116 | aaaataattaacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagtta < 2:1236126‑M1/1‑1 (MQ=255)aaaataattaacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaaaaaaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagtta > 2:3926913‑M1/91‑91 (MQ=255) aaataattaacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttaa < 2:908741‑M1/2‑1 (MQ=255) aaataattaacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttaa > 2:1811907‑M1/90‑91 (MQ=255) ataattaacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttaaaa < 2:2985980‑M1/4‑1 (MQ=255) aaaTGGTAAAATAGTTGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATaaaaa > 2:2900979/1‑91 (MQ=255) aaTGGTAAAATAGTTGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATaaaaaa < 1:1739428/91‑1 (MQ=255) aattaacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttaaaaaa > 2:241420‑M1/86‑91 (MQ=255) attaacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattcgcacgcgtaagcttgttagttAAAAAA‑c < 2:3305341‑M1/7‑1 (MQ=255) attaacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcatgcgtaagcttgttagttAAAAAA‑c < 2:3677665‑M1/7‑1 (MQ=255) attaacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttattaattAAAAAA‑c > 2:597794‑M1/85‑91 (MQ=255) taacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttAAAAAA‑CTg < 1:3197946‑M1/9‑1 (MQ=255) taacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttAAAAAA‑CTg > 1:349321‑M1/83‑91 (MQ=255) aacttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttAAAAAA‑CTGc > 2:1173712‑M1/82‑91 (MQ=255) aaaaTAGTTGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCt < 2:3403349/91‑1 (MQ=255) aaaaTAGTTGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCt > 2:1707328/1‑91 (MQ=255) aaaaTAGTTGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCt > 2:396382/1‑91 (MQ=255) cttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttAAAaaa‑cttacg < 1:2759732‑M1/12‑5 (MQ=255) cttttgtcatgacaattaaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttAAAAAA‑CTGCtt > 1:3532251‑M1/80‑91 (MQ=255) aaTAGTTGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTg > 1:2285531/1‑91 (MQ=255) aaTAGTTGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTg > 1:2839557/1‑91 (MQ=255) aTAGTTGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGa > 1:3337673/1‑91 (MQ=255) tAGTTGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGAt > 2:3825157/1‑91 (MQ=255) ttGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAgg > 2:515701/1‑91 (MQ=255) tGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGc > 1:2225087/1‑91 (MQ=255) gAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCt < 1:3489303/91‑1 (MQ=255) gAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCt < 1:47170/91‑1 (MQ=255) aaaaGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTa > 2:198923/1‑91 (MQ=255) aaaGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTaa > 1:3885747/1‑91 (MQ=255) aaGGGGAACTATCAACAATTACTAGTTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATACAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAg < 1:3684570/91‑1 (MQ=255) aaGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATCTGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAg > 2:3241668/1‑91 (MQ=255) aaGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAg < 2:3722391/91‑1 (MQ=255) aaGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATAAAAAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAg < 2:2526001/91‑1 (MQ=255) gggAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGaa > 1:613036/1‑91 (MQ=255) gggAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGaa < 2:354200/91‑1 (MQ=255) gggAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGaa < 1:1871932/91‑1 (MQ=255) aaaCTATCAACAATTCCTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATACAAAAA‑CTGCTTGATAGGCCAAGAAAcc > 2:3164930/1‑91 (MQ=255) aaagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCt > 1:2409273‑M1/63‑91 (MQ=255) aagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCtt > 1:3225201‑M1/62‑91 (MQ=255) aagtaatgtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCtt > 1:2298904‑M1/62‑91 (MQ=255) aCTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCtt > 1:106807/1‑91 (MQ=255) tATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTc > 1:2125418/1‑91 (MQ=255) aacaaTTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGc > 1:68772/1‑91 (MQ=255) gtttagaatttattaagaatagaaaaacaattagcacgcgtaagcttgttagttAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCa > 1:1463653‑M1/55‑91 (MQ=255) acaaTTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCa > 2:2292093/1‑91 (MQ=255) tttagaatttattaagaatagaaaatcaattagcacgcgtaagcttgttagttAAAAAAACTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCa > 1:2673710‑M1/54‑91 (MQ=255) caaTTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAg > 1:3097716/1‑91 (MQ=255) aTTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGtt < 2:3459808/91‑1 (MQ=255) cTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGtttttt > 1:1553264/1‑91 (MQ=255) tAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTta > 2:2154276/1‑91 (MQ=255) aGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTtaa > 1:2144661/1‑91 (MQ=255) aGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTtaa > 2:3119347/1‑91 (MQ=255) aGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTtaa > 1:2582544/1‑91 (MQ=255) gCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTtaac < 2:865978/91‑1 (MQ=255) cTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTtaact > 1:2296364/1‑91 (MQ=255) cTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTtaact > 2:1933580/1‑91 (MQ=255) aaTCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTtaactaa > 1:1624190/1‑91 (MQ=255) aTCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTtaactaac < 1:1773545/91‑1 (MQ=255) tCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACa < 2:3217117/91‑1 (MQ=255) aGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCGAGCAGTTTTTTAACTAACAAGc < 1:1443829/91‑1 (MQ=255) aGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGc < 2:1437797/91‑1 (MQ=255) ggTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCt > 1:1857857/1‑91 (MQ=255) ggTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCt > 2:2864984/1‑91 (MQ=255) ggTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCt < 2:2103324/91‑1 (MQ=255) ggTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCt > 1:3396845/1‑91 (MQ=255) gTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCtt > 1:3762719/1‑91 (MQ=255) gCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTAc > 2:2650639/1‑91 (MQ=255) cTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTAcg > 1:2976508/1‑91 (MQ=255) cTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTAcg > 2:7435/1‑91 (MQ=255) tATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGt > 1:2311176/1‑91 (MQ=255) aTGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTg < 2:1213011/91‑1 (MQ=255) aTGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTg < 2:2951349/91‑1 (MQ=255) aTGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTg < 1:401763/91‑1 (MQ=255) ggAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCt < 1:1220668/91‑1 (MQ=255) ggAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCt < 2:3759268/91‑1 (MQ=255) ggAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCt > 1:2483393/1‑91 (MQ=255) ggAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCt > 2:2993125/1‑91 (MQ=255) gAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTa < 1:85047/91‑1 (MQ=255) gAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTa < 2:2838474/91‑1 (MQ=255) atatGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAAt > 2:3091445/1‑91 (MQ=255) atatGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAAt > 2:1420994/1‑91 (MQ=255) atGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTg > 1:3792221/1‑91 (MQ=255) tGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGt < 1:1008742/91‑1 (MQ=255) gATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGtt > 1:760851/1‑91 (MQ=255) gATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGtt > 1:224897/1‑91 (MQ=255) aTTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGttt < 1:1384735/91‑1 (MQ=255) tCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGttttt < 1:1911244/91‑1 (MQ=255) tCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGttttt < 1:2983826/91‑1 (MQ=255) atatAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTa > 2:158378/1‑91 (MQ=255) taATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTc < 2:3858127/91‑1 (MQ=255) aaTGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCt > 2:1101208/1‑91 (MQ=255) aaTGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCt < 1:1807466/91‑1 (MQ=255) aaTGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACCAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCt > 1:2893394/1‑91 (MQ=255) aaTGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTGTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCt < 2:711258/91‑1 (MQ=255) tagttAAAAAG‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCTtaa > 2:2164694‑M1/6‑91 (MQ=255) cATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCTtaat > 1:2048111/1‑91 (MQ=255) cATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCTtaat > 1:1119957/1‑91 (MQ=255) aTAAAAGAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCGAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCTtaata < 2:2568025/91‑1 (MQ=255) aTAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCTtaata > 2:2767433/1‑91 (MQ=255) tAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCTtaataa > 1:3612367/1‑91 (MQ=255) | GATAAATGGTAAAATAGTTGAAAAGGGAAACTATCAACAATTACTAGCTAATCAAGGTGCTTTATGGAATATGATTCAATATAATGCATAAAAAAA‑CTGCTTGATAGGCTAAGAAACCTTTCAAGCAGTTTTTTAACTAACAAGCTTACGCGTGCTAATTGTTTTTCTATTCTTAATAAAT > USA300TCH1516_ALE/759936‑760116 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |