New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1086962 = | 217 (1.070) | 13 (0.070) | 7/140 | NT | 7.0% | coding (131/1401 nt) | ykoD_1 | Putative HMP/thiamine import ATP‑binding protein YkoD |
? | USA300TCH1516_ALE | 1087000 = | 156 (0.880) | coding (93/1401 nt) | ykoD_1 | Putative HMP/thiamine import ATP‑binding protein YkoD |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
ACGCCACTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGATCGAAAATTTTACGTTGAC > USA300TCH1516_ALE/1086872‑1087052 | ttaaaagtaagtgatttacgattaaaatatccaagtggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaag < 1:879947‑M1/1‑1 (MQ=255) aCGCCACTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAgtg < 1:3353314/91‑1 (MQ=255) aCGCCACTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAgtg < 2:1433530/91‑1 (MQ=255) cGCCACTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAgtgt < 2:3874586/91‑1 (MQ=255) gCCACTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTa > 1:3204639/1‑91 (MQ=255) ccACTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTAc > 1:3276291/1‑91 (MQ=255) ccACTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTAc > 1:2129869/1‑91 (MQ=255) ccACTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTAc > 2:1624721/1‑91 (MQ=255) aaagtaagtgatttacgattaaaatatccaagtggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTAc < 1:1624721‑M1/4‑1 (MQ=255) aaagtaagtgatttacgattaaaatatccaagtggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTAc < 1:3522406‑M1/4‑1 (MQ=255) aaagtaagtgatttacgattaaaatatccaagtggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTAc < 2:734546‑M1/4‑1 (MQ=255) aaagtaagtgatttacgattaaaatatccaagtggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattaaaaaaaaaaaaaaaGTAc > 2:2110007‑M1/88‑91 (MQ=255) cACTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACt > 1:2901858/1‑91 (MQ=255) aagtaagtgatttacgattaaaatatccaagtggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTACt > 1:3633259‑M1/87‑91 (MQ=255) aagtaagtgatttacgagtaaaatatccaagtggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTACt > 2:230619‑M1/87‑91 (MQ=255) agtaagtgatttacgattaaaatatccaagtggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTACtt < 2:2835669‑M1/6‑1 (MQ=255) cTTAATGGGTTAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACttt > 2:180229/1‑91 (MQ=255) cTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACttt < 1:3566722/91‑1 (MQ=255) cTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATAGTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACttt < 1:3166152/91‑1 (MQ=255) agtgatttacgattaaaatatccaagtggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTACTTTTAc < 2:1299254‑M1/10‑1 (MQ=255) agtgatttacgattaaaatatccaagtggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTACTTTTAc < 2:3457706‑M1/10‑1 (MQ=255) aaTGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCCTAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTAc > 2:594898/1‑91 (MQ=255) aaTGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTAc > 2:3148718/1‑91 (MQ=255) gggTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGc > 2:3116786/1‑91 (MQ=255) gggTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGc < 1:178967/91‑1 (MQ=255) ggTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCa > 1:625283/1‑91 (MQ=255) gTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCaa > 2:1650784/1‑91 (MQ=255) tCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAAc < 1:1872753/91‑1 (MQ=255) aaCGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCa > 2:753628/1‑91 (MQ=255) aCGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAg < 1:46582/91‑1 (MQ=255) aCGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAg < 2:1687532/91‑1 (MQ=255) ttAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTTAATTAAATTAGGAACAATACAACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACTCCAACCAGAAgg > 2:1121819/1‑91 (MQ=255) ttAGCTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGCAgg > 2:437773/1‑91 (MQ=255) tAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACTACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGa > 2:1012158/1‑91 (MQ=255) tAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGa > 2:1148445/1‑91 (MQ=255) tAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGa < 1:221074/91‑1 (MQ=255) tAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAAGTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGa < 2:266081/91‑1 (MQ=255) aGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAACTTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGAc > 1:1224833/1‑91 (MQ=255) aGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTCCCGCAACCAGAAGGAc > 2:3035894/1‑91 (MQ=255) aGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGAc > 1:3553144/1‑91 (MQ=255) gTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGAcc > 2:969676/1‑91 (MQ=255) gTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGAcc < 1:409722/91‑1 (MQ=255) ttCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCg > 2:3037428/1‑91 (MQ=255) ttCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCg < 2:1372875/91‑1 (MQ=255) tcatcaTATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGa < 1:3739030/91‑1 (MQ=255) catcatATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAg > 1:2836624/1‑91 (MQ=255) tccaagtggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGt > 1:3754996‑M1/62‑91 (MQ=255) tccaagtggtcaacgtaaaatttgcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGt > 2:236015‑M1/62‑91 (MQ=255) atcatATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGt < 2:2266860/91‑1 (MQ=255) atcatATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGt < 2:1553288/91‑1 (MQ=255) tatTTCATAGGTGATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTaaaa < 2:3289913/91‑1 (MQ=255) atTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAg < 1:1348348/91‑1 (MQ=255) tttCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGt > 2:3173006/1‑91 (MQ=255) tggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGt > 1:32422‑M1/56‑91 (MQ=255) tggtcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGt > 1:3447474‑M1/56‑91 (MQ=255) tCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTAc < 1:1724857/91‑1 (MQ=255) tCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTAc > 2:2161409/1‑91 (MQ=255) tCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTAc < 1:2418410/91‑1 (MQ=255) tcaacgtaaaattttcgatcatttaaatatcactattcaagacaaagaaaaaGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACt > 1:3066314‑M1/53‑91 (MQ=255) cATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACt > 2:1650360/1‑91 (MQ=255) cATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACt < 2:91742/91‑1 (MQ=255) aTAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACtt < 1:704417/91‑1 (MQ=255) tAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACttt > 1:3822462/1‑91 (MQ=255) ggTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACttttt > 2:2192875/1‑91 (MQ=255) ggTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACttttt < 1:2346890/91‑1 (MQ=255) gTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTc > 2:338469/1‑91 (MQ=255) tAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCt < 2:193886/91‑1 (MQ=255) aaTTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCtt < 2:2922734/91‑1 (MQ=255) aattaaattaGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCt < 2:1857189/91‑1 (MQ=255) aattaGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAAt > 2:341328/1‑91 (MQ=255) taGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGt < 1:2484627/91‑1 (MQ=255) taGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGt < 1:2635026/91‑1 (MQ=255) aGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTg < 2:1517325/91‑1 (MQ=255) aGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTg > 1:905163/1‑91 (MQ=255) aGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTCGAATAGTg > 2:635982/1‑91 (MQ=255) ggAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGa < 2:661073/91‑1 (MQ=255) ggAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGa < 1:953320/91‑1 (MQ=255) aCAATACCACTTAATATATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGatat < 2:3775065/91‑1 (MQ=255) aCAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGatat < 2:1762961/91‑1 (MQ=255) aCAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGatat < 2:3963484/91‑1 (MQ=255) aCAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGatat < 2:3641004/91‑1 (MQ=255) cAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATAtt > 2:789526/1‑91 (MQ=255) cAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATAtt < 1:2715371/91‑1 (MQ=255) aaTACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATAttt < 1:2060210/91‑1 (MQ=255) aTACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTa > 1:1558074/1‑91 (MQ=255) aCCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTaaa > 1:2999098/1‑91 (MQ=255) aCCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTCCTTTGTCTTGAATAGTGATATCTaaa > 2:2801807/1‑91 (MQ=255) ccACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAAt > 1:403639/1‑91 (MQ=255) cACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTAAAATg > 1:1483086/1‑91 (MQ=255) aCTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGa > 1:1071641/1‑91 (MQ=255) cTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGAt < 1:1576539/91‑1 (MQ=255) cTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGAt < 1:1576623/91‑1 (MQ=255) aTACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGATCGaa > 1:2258833/1‑91 (MQ=255) tACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGATCGaaa < 2:824057/91‑1 (MQ=255) tACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGATCGaaa > 2:2030101/1‑91 (MQ=255) cATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGATCGAAAAt > 1:2765232/1‑91 (MQ=255) cATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGATCGAAAAt > 1:765463/1‑91 (MQ=255) aTTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCTAGTAAAAGTACTTTGTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGATCGAAAAtt < 2:181616/91‑1 (MQ=255) ttCAGAAGTCTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGATCTAAAAttt > 1:1976680/1‑91 (MQ=255) gAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGATCGAAAATTTTACg < 2:1220911/91‑1 (MQ=255) | ACGCCACTTAATGGGTCAACGATTAGTTCATCATATTTCATAGGTAATTCAATTAAATTAGGAACAATACCACTTAATACATTCAGAAGTGTACTTTTACCGCAACCAGAAGGACCGAGTAAAAGTACTTTTTCTTTGTCTTGAATAGTGATATTTAAATGATCGAAAATTTTACGTTGAC > USA300TCH1516_ALE/1086872‑1087052 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |