| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1115642 | 189 (0.930) | 22 (0.120) | 9/146 | NT | 10.9% | intergenic (‑137/+47) | mntH_1/USA300TCH1516_01038 | Divalent metal cation transporter MntH/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1115662 | 188 (1.010) | intergenic (‑157/+27) | mntH_1/USA300TCH1516_01038 | Divalent metal cation transporter MntH/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
ATGTTTAGGTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTTTCTTCTA > USA300TCH1516_ALE/1115552‑1115732 | aTGTTTAGGTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTTAATATATTAATTATTATGTTGTACGTTCGTTTTAATATTAAT‑TAAAAATAGCAC > 2:3671707‑M1/1‑91 (MQ=255)aTGTTTAGGTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCAC < 2:2488360‑M1/91‑1 (MQ=255) tGTTTAGGTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACg > 1:1985275/1‑91 (MQ=255) tttAGGTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGaa > 1:589520/1‑91 (MQ=255) tttAGGTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATAAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGaa > 1:3431224/1‑91 (MQ=255) tAGGTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAAt > 2:3334998/1‑91 (MQ=255) tAGGTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAAt < 2:2346950/91‑1 (MQ=255) ggTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCa > 1:3588549/1‑91 (MQ=255) gTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCAt < 2:1051478/91‑1 (MQ=255) gTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCAt > 1:3921191/1‑91 (MQ=255) gTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCAt > 1:918993/1‑91 (MQ=255) ccTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGAtg < 2:3380528/91‑1 (MQ=255) tAAATTTATTTTAA‑TTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCTATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGa < 1:3421717/91‑1 (MQ=255) aaaTTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGa > 2:2141657/1‑91 (MQ=255) aaTTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGAt > 1:733732/1‑91 (MQ=255) aaTTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGAt < 2:2045393/91‑1 (MQ=255) tatttTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACttaatcacatccatgatttcg < 2:3028782‑M1/91‑22 (MQ=255) tATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAg > 1:3048377‑M2/1‑90 (MQ=255) atttTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACttaatcacgtccatgatttcgt < 2:979174‑M1/91‑23 (MQ=255) ttttAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGATCACttaatcacatccatgatttcgtg < 2:2239697‑M1/91‑24 (MQ=255) ttttAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACttaatcacatccatgatttcgtg < 1:3100414‑M1/91‑24 (MQ=255) ttttAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAgtg < 1:3293954‑M2/91‑4 (MQ=255) tttAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACttaattacatccatgatttcgtgc < 2:1357703‑M1/91‑25 (MQ=255) ttAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAgtgct > 1:1753944‑M2/1‑86 (MQ=255) ttAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAgtgct > 1:164434‑M2/1‑86 (MQ=255) ttAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAgtgct > 1:1246946‑M2/1‑86 (MQ=255) aTTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCta > 1:2599910/1‑91 (MQ=255) tttttAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCtatta < 1:1738802/91‑1 (MQ=255) tttAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTattatt < 2:50506/91‑1 (MQ=255) tttAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATAATAAGAAAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTACGTGCTCtattat < 2:2896877/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTAttt > 1:1381652/1‑91 (MQ=255) ttAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTAttt > 1:1291510/1‑91 (MQ=255) ttAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTAttt < 1:3894526/91‑1 (MQ=255) tAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTa > 2:921379/1‑91 (MQ=255) aaGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAAc > 1:1163558/1‑91 (MQ=255) aaGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAAc < 1:3476002/91‑1 (MQ=255) gTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACaa > 1:1016098/1‑91 (MQ=255) aTGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAg < 2:835506/91‑1 (MQ=255) tGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGt < 2:963287/91‑1 (MQ=255) tGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGt > 2:3737058/1‑91 (MQ=255) gAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGtt > 2:1907447/1‑91 (MQ=255) attattATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGttat > 2:2584509/1‑91 (MQ=255) tattatGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGttattt > 2:3646061/1‑91 (MQ=255) attatGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGttattta > 1:2810031/1‑91 (MQ=255) attatGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGttattta > 2:1079440/1‑91 (MQ=255) tatGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATg < 2:3113718/91‑1 (MQ=255) atGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGc < 1:2337263/91‑1 (MQ=255) gTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAg < 2:532007/91‑1 (MQ=255) tGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGaa < 2:110964/91‑1 (MQ=255) aCGTTCGATTTAATACTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCAATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATaa > 1:3365398/1‑91 (MQ=255) ttCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAAt < 1:488682/91‑1 (MQ=255) cGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATgg > 1:3719476/1‑91 (MQ=255) cGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATgg > 1:1935889/1‑91 (MQ=255) gATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGt < 1:2186919/91‑1 (MQ=255) gATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGt < 1:431754/91‑1 (MQ=255) gATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGt > 1:1529154/1‑91 (MQ=255) tttAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTCTTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATATAATGGTaa > 2:3879226/1‑91 (MQ=255) tttAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTaa > 2:2567996/1‑91 (MQ=255) tttAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTaa > 2:2475107/1‑91 (MQ=255) tttAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTaa > 1:51248/1‑91 (MQ=255) aaTATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGaa > 1:2653546/1‑91 (MQ=255) atatTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAAc < 1:1707264/91‑1 (MQ=255) atatTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAAc > 2:2752309/1‑91 (MQ=255) tatTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACt < 1:2144454/91‑1 (MQ=255) ttAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGa < 2:246071/91‑1 (MQ=255) aG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCg < 2:3072069/91‑1 (MQ=255) g‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaa < 1:1085400‑M2/91‑59 (MQ=255) g‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGa < 2:625742/91‑1 (MQ=255) g‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGa < 2:1197966/91‑1 (MQ=255) aaaaaGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAg < 1:1255829/91‑1 (MQ=255) aaaaGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAgg > 2:1699931/1‑91 (MQ=255) aaaGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGt > 2:412461/1‑91 (MQ=255) aaaGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGt < 2:1340680/91‑1 (MQ=255) aaaGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGt < 1:303166/91‑1 (MQ=255) aaGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGtt > 2:2652611/1‑91 (MQ=255) agagCACttaatcacatccatgatttcgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaatt < 1:2776339‑M1/91‑85 (MQ=255) agagCACttaatcacatccatgatttcgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaatt > 1:1594504‑M1/1‑7 (MQ=255) gagCACttaatcacatccatgatttcgtggtcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatactttgaaaaaaatta < 2:1072316‑M1/91‑86 (MQ=255) gagCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTttc < 2:2178111/91‑1 (MQ=255) agCACttaatcacatccatgatttcgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaattaa > 2:3896565‑M1/1‑5 (MQ=255) agCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTttct > 1:382800/1‑91 (MQ=255) agCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTttct < 1:271477/91‑1 (MQ=255) gCACttaatcacatccatgatttcgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaattaaa > 2:298990‑M1/1‑4 (MQ=255) gCACGAAATCATGGATGTGATTAAgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaattaaa < 1:3738281‑M2/91‑68 (MQ=255) gCACGAAATCATGGATGTGATTAAgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaattaaa < 2:853549‑M2/91‑68 (MQ=255) gCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTttctt < 1:1889039/91‑1 (MQ=255) gCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATCATTAAAACAAAGCTATTTATGCAGACTAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTttctt > 1:3155289/1‑91 (MQ=255) cACttaatcacatccatgatttcgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaattaaaa < 1:3293953‑M1/91‑89 (MQ=255) cACGAAATCATGGATGTGATTAAgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaattaaaa < 2:2240012‑M2/91‑69 (MQ=255) cACGAAATCATGGATGTGATTAAgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaattaaaa < 2:2344566‑M2/91‑69 (MQ=255) cACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTttcttc > 2:677034/1‑91 (MQ=255) cACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTttcttc < 2:2300973/91‑1 (MQ=255) cACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTttcttc > 1:740047/1‑91 (MQ=255) aCttaatcacatccatgatttcgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaattaaaat > 1:1502375‑M1/1‑2 (MQ=255) aCttaatcacatccatgatttcgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaattaaaat > 2:1461650‑M1/1‑2 (MQ=255) aCGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTTtcttct > 2:2072043/1‑91 (MQ=255) aCGAAATCATGGATGTGATCAAgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaattaaaat < 2:3460780‑M2/91‑70 (MQ=255) cGAAATCATGGATGTGATTAAgtgctcttttttcttaatattaaatcgaacgttcaacataataattcatacttttaaaaaaattaagata < 1:3192159‑M2/91‑71 (MQ=255) cGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTTTCTTCTa > 2:1785371/1‑91 (MQ=255) cGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTTTCTTCTa < 1:2994990/91‑1 (MQ=255) | ATGTTTAGGTCAACCTAAATTTATTTTAATTTTTTTAAAAGTATGAATTATTATGTTGAACGTTCGATTTAATATTAAG‑AAAAAAGAGCACGAAATCATGGATGTGATTAAGTGCTCTATTATTTAAACAAAGTTATTTATGCAGAATAAAATGGTAAGAACTGATCGAAGGTTTCTTCTA > USA300TCH1516_ALE/1115552‑1115732 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |