| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1136225 | 195 (0.960) | 12 (0.070) | 9/142 | NT | 6.2% | intergenic (+81/+73) | rpmF/isdB | 50S ribosomal protein L32/Iron‑regulated surface determinant protein B |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1136249 | 192 (1.060) | intergenic (+105/+49) | rpmF/isdB | 50S ribosomal protein L32/Iron‑regulated surface determinant protein B | |||||
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
AGCTAAATAATTTTAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCT > USA300TCH1516_ALE/1136135‑1136315 | gcTAAATAATTTTAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGa < 2:1453685/91‑1 (MQ=255) aaaTAATTTTAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACg > 1:2845657/1‑91 (MQ=255) aataatTTTAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGa > 2:1028275/1‑91 (MQ=255) taatTTTAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAgg > 1:3876996/1‑91 (MQ=255) aatTTTAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGt < 1:747255/91‑1 (MQ=255) aatTTTAGTGACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGt < 1:3787232/91‑1 (MQ=255) atgttAGTTACTCAATAT‑AAAAGTCCCGCTTACAATGATTGTTTTACGTGGGACTTTTTATATAGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTaa > 2:1801213/4‑91 (MQ=255) atTTTAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTa < 1:1293187/91‑1 (MQ=255) tttAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAAc > 1:3491101/1‑91 (MQ=255) tttAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAAc > 1:776687/1‑91 (MQ=255) tttAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAAc < 1:1123537/91‑1 (MQ=255) tttAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAAc > 2:35106/1‑91 (MQ=255) ttAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACt < 1:2334625/91‑1 (MQ=255) ttACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGAt < 1:537878/91‑1 (MQ=255) tACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATa > 2:2988612/1‑91 (MQ=255) aCTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATAc < 2:3222250/91‑1 (MQ=255) aCTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATAc > 2:3128741/1‑91 (MQ=255) aCTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATAc < 1:2428397/91‑1 (MQ=255) aCTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATAc < 2:674069/91‑1 (MQ=255) cTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATAcc > 1:1903060/1‑91 (MQ=255) tataAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGgatgaggtatccagttacctcgtt < 2:2104971‑M1/91‑25 (MQ=255) tataAAAAGTCCCACTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTAAAATTGCGAAAAATAATTGGCGgatgaggtatccagttacctcgtt < 2:3420790‑M1/91‑25 (MQ=255) taAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGgatgaggtatccagttacctcgttcg < 2:1626880‑M1/91‑27 (MQ=255) taAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcg > 1:1388083‑M2/1‑89 (MQ=255) aaaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTATGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgc > 1:3170267‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgc < 2:1092206‑M2/91‑4 (MQ=255) aaaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgc > 1:108763‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgcc > 1:841967‑M2/1‑87 (MQ=255) aaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgcc < 2:247427‑M2/91‑5 (MQ=255) aaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgcca < 2:359386‑M2/91‑6 (MQ=255) aaGTCCCGCTTACAATGATTGTTTTAAGTGGGCCTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa < 1:295394‑M2/91‑7 (MQ=255) aaGTCCCACTTAAAACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa < 2:1543453‑M2/91‑7 (MQ=255) aaGTCCCACTTAAAACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa < 1:1677936‑M2/91‑7 (MQ=255) aaGTCCCACTTAAAACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa < 1:3916699‑M2/91‑7 (MQ=255) aGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaat < 2:2614164‑M2/91‑8 (MQ=255) aGTCCCACTTAACACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaat < 2:3404525‑M2/91‑8 (MQ=255) aGTCCCACTTAAAACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaat < 1:165046‑M2/91‑8 (MQ=255) tCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaatta < 1:966417‑M2/91‑10 (MQ=255) tCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTAAATTGCGAACAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaatta < 1:3148139‑M2/91‑10 (MQ=255) cccGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaa > 2:53596/1‑91 (MQ=255) cGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa > 1:2170723/1‑91 (MQ=255) cGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa > 1:200851/1‑91 (MQ=255) cGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa > 1:1186093/1‑91 (MQ=255) cGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa > 2:3268785/1‑91 (MQ=255) gCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAAt < 1:593583/91‑1 (MQ=255) gCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAAt < 1:2450010/91‑1 (MQ=255) cTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAAtt > 2:3111551/1‑91 (MQ=255) aaTGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGtta < 1:2505146/91‑1 (MQ=255) tGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaat > 2:704086/1‑91 (MQ=255) tGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGtaaat > 1:3192197/1‑91 (MQ=255) gATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaatt < 1:3327064/91‑1 (MQ=255) aTTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaattt < 1:2675039/91‑1 (MQ=255) ttGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaattta < 1:421115/91‑1 (MQ=255) ttttAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTtaata > 2:3314087/1‑91 (MQ=255) tttAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTtaataa > 2:3802457/1‑91 (MQ=255) ttAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTaataat > 2:1641485/1‑91 (MQ=255) aGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTaa > 2:2038581/1‑91 (MQ=255) aGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTaa > 2:1259347/1‑91 (MQ=255) tGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAat > 1:2573630/1‑91 (MQ=255) ggACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAatat > 1:2239144/1‑91 (MQ=255) gACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAAtata > 1:3627610/1‑91 (MQ=255) aCTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATaa > 1:3649102/1‑91 (MQ=255) aCTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATaa > 1:2983534/1‑91 (MQ=255) tttttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAg < 1:502284/91‑1 (MQ=255) ttttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGa < 1:3122561/91‑1 (MQ=255) ttttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGa > 1:3461832/1‑91 (MQ=255) tttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGAc > 2:2412626/1‑91 (MQ=255) tttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGAc > 2:2877738/1‑91 (MQ=255) tttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGAc > 2:3181986/1‑91 (MQ=255) tttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGAc < 2:1971584/91‑1 (MQ=255) tttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGAc < 2:2283500/91‑1 (MQ=255) ttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACg > 1:1013390/1‑91 (MQ=255) ttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAACTTAATAATTAAATATAAAGACg > 2:3001092/1‑91 (MQ=255) tatTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGAtt > 1:1824484/1‑91 (MQ=255) tatTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGAtt < 1:921369/91‑1 (MQ=255) tGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttat < 1:3722925/91‑1 (MQ=255) tGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttat < 2:2969929/91‑1 (MQ=255) gCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttatt > 2:1193072/1‑91 (MQ=255) gCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttatt < 1:2782379/91‑1 (MQ=255) gCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttatt < 1:1927605/91‑1 (MQ=255) gAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAg < 1:1594760/91‑1 (MQ=255) atgttaattggcGgatgaggtatccagttacctcgttcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagc < 2:2720789‑M1/87‑79 (MQ=255) aaaaTAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGtt > 2:253808/1‑91 (MQ=255) ataatTGGCGaacgaggtaactggatccctcgttcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccccttaaaacaatcactttaagcggg > 2:2239635‑M1/1‑10 (MQ=255) ataatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGttttt > 1:974149/1‑91 (MQ=255) ataatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGttttt < 2:671503/91‑1 (MQ=255) taatTGGCGgatgaggtatccagttacctcgttcgccaattattgttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcggga < 1:3147842‑M1/91‑83 (MQ=255) aatTGGCGgatgaggtatccagttacctcgttcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggac > 1:3465952‑M1/1‑8 (MQ=255) aatTGGCGgatgaggtatccagttacctcgttcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggac < 2:1523989‑M1/91‑84 (MQ=255) aatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTAc < 1:176501/91‑1 (MQ=255) atTGGCGgatgaggtatccagttacctcgttcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggact < 1:1229937‑M1/91‑85 (MQ=255) atTGGCGgatgaggtatccagttacctcgttcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggact < 1:2994336‑M1/91‑85 (MQ=255) atTGGCGAACGAGGTAACTGGATCGCTCATCCGCCAATTAAAAGTTGTTAGTTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACg < 2:3669287/91‑1 (MQ=255) ttGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGt > 1:612992/1‑91 (MQ=255) ggCGgatgaggtatccagttacctcgttcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggactttt < 1:3076645‑M1/91‑88 (MQ=255) ggCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggactttt < 1:184649‑M2/91‑64 (MQ=255) ggCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGttt < 2:3936741/91‑1 (MQ=255) gCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGtttt > 2:729292/1‑91 (MQ=255) gCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGattt > 1:3063785/1‑91 (MQ=255) cGgatgaggtatccagttacctcgttcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggacttttta > 2:408550‑M1/1‑2 (MQ=255) | AGCTAAATAATTTTAGTTACTCAATATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCT > USA300TCH1516_ALE/1136135‑1136315 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |