| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1136225 | 195 (0.960) | 12 (0.070) | 9/142 | NT | 6.2% | intergenic (+81/+73) | rpmF/isdB | 50S ribosomal protein L32/Iron‑regulated surface determinant protein B |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1136249 | 192 (1.060) | intergenic (+105/+49) | rpmF/isdB | 50S ribosomal protein L32/Iron‑regulated surface determinant protein B | |||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
TATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGATGCT > USA300TCH1516_ALE/1136159‑1136339 | tataAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATc > 1:1917593/1‑91 (MQ=255) taAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcg > 1:1388083‑M2/1‑89 (MQ=255) taAAAAGTCCCACTTAAAACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcc < 2:2993005‑M2/91‑3 (MQ=255) aaaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTACGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgc > 1:3170282‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgc > 1:108763‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgc < 2:1092206‑M2/91‑4 (MQ=255) aaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgcc > 1:967979‑M2/1‑87 (MQ=255) aaaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgcc < 1:3402582‑M2/91‑5 (MQ=255) aaaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgcca < 2:359386‑M2/91‑6 (MQ=255) aaGTCCCGCTTACAATGATTGTTTTAAGTGGGCCTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa < 1:295394‑M2/91‑7 (MQ=255) aaGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa > 1:2580628‑M2/1‑85 (MQ=255) aaGTCCCACTTAAAACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa < 1:2717579‑M2/91‑7 (MQ=255) aaGTCCCACTTAAAACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaa < 1:1677936‑M2/91‑7 (MQ=255) aGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaat < 2:3118645‑M2/91‑8 (MQ=255) aGTCCCACTTAACACAATCATTTTAAGCGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaat < 2:3404525‑M2/91‑8 (MQ=255) gTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaatt > 1:3465952‑M2/1‑83 (MQ=255) gTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaatt < 2:1523989‑M2/91‑9 (MQ=255) cccGCATAAAAGGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTAGATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaa < 2:3641729/91‑1 (MQ=255) ccGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaa > 1:1193259/1‑91 (MQ=255) cGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa > 1:200851/1‑91 (MQ=255) cGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa > 2:3268785/1‑91 (MQ=255) cGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa > 1:2170723/1‑91 (MQ=255) cGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTaaaa > 1:2451754/1‑91 (MQ=255) gCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattaacat < 2:2720789‑M2/91‑14 (MQ=255) gCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAAt > 1:1746479/1‑91 (MQ=255) ttAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAAttt > 1:1177482/1‑91 (MQ=255) tAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTg > 2:2322923/1‑91 (MQ=255) aaaTGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATACTTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGtt > 1:2077344/1‑91 (MQ=255) aaTGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGtta < 1:3144200/91‑1 (MQ=255) tGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaat < 1:820026/91‑1 (MQ=255) tGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaat > 2:704588/1‑91 (MQ=255) aTTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaattt < 1:2675039/91‑1 (MQ=255) ttGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaattta < 1:421115/91‑1 (MQ=255) gTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGttaatttaat > 1:3165330/1‑91 (MQ=255) ttttAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTtaata > 2:3314087/1‑91 (MQ=255) tttAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTtaataa > 2:18691/1‑91 (MQ=255) ttAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTaataat > 2:1641459/1‑91 (MQ=255) aGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTaa > 2:1259347/1‑91 (MQ=255) gggACTTTTAATATTGAGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAata < 2:1977123/91‑1 (MQ=255) ggACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAatat > 1:3689750/1‑91 (MQ=255) gACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAAtata > 1:3627610/1‑91 (MQ=255) aCTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATaa > 1:2983750/1‑91 (MQ=255) aCTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATaa < 2:3092779/91‑1 (MQ=255) tttttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAg < 1:502543/91‑1 (MQ=255) tttttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAg > 1:1625306/1‑91 (MQ=255) ttttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGa < 1:3122319/91‑1 (MQ=255) ttttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGa > 1:2449161/1‑91 (MQ=255) tttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGAc > 2:2412626/1‑91 (MQ=255) tttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGAc < 2:1140143/91‑1 (MQ=255) tttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGAc > 2:3181986/1‑91 (MQ=255) ttATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACg > 1:1013390/1‑91 (MQ=255) tataTTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGa < 2:3961333/91‑1 (MQ=255) tatTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGAtt < 1:921369/91‑1 (MQ=255) ttGAGAGAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATtta < 2:796409/91‑1 (MQ=255) tGCGAAAAATAATTGGCGAACTAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttat < 1:1822444/91‑1 (MQ=255) tGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttat < 2:2969929/91‑1 (MQ=255) tGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttat < 1:3722925/91‑1 (MQ=255) gCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttatt > 2:1193072/1‑91 (MQ=255) gCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttatt < 2:496858/91‑1 (MQ=255) gCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATttatt < 1:1928594/91‑1 (MQ=255) cGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAAGTTAATAATTCAATATAAAGACGATttactt > 2:591620/1‑88 (MQ=255) gAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAg < 2:2701038/91‑1 (MQ=255) ataatTGGCGAACGATGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTTTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGttttt < 2:1355176/91‑1 (MQ=255) taatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTa > 1:2539075/1‑91 (MQ=255) aatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTAc > 1:3723668/1‑91 (MQ=255) aatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTAc < 1:176731/91‑1 (MQ=255) aatTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTAc > 1:3319640/1‑91 (MQ=255) atTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggact < 2:3695331‑M2/91‑61 (MQ=255) atTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACg > 2:2048167/1‑91 (MQ=255) ttGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggactt < 2:2493092‑M2/91‑62 (MQ=255) tGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggacttt < 2:671764‑M2/91‑63 (MQ=255) tGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGtt > 2:3247184/1‑91 (MQ=255) ggCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggactttt < 1:184649‑M2/91‑64 (MQ=255) gCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGattt > 1:3063785/1‑91 (MQ=255) gAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCt < 1:628446/91‑1 (MQ=255) aaCGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaattttaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagtgggactttttata < 2:3420790‑M2/91‑68 (MQ=255) aaCGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggactttttata < 2:2104971‑M2/91‑68 (MQ=255) aaCGAGGTAACTGGATACCTCATCcgccaattatttttcgcaatataaaaagtcccacttaaaacaatcattttaagcgggactttttata < 2:1930110‑M2/91‑68 (MQ=255) aaCGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTa > 1:2088958/1‑91 (MQ=255) aaCGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTa < 1:3809334/91‑1 (MQ=255) cGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAgg > 2:1597950/1‑91 (MQ=255) gAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGCCGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGt < 1:356034/91‑1 (MQ=255) gTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAAt > 2:3530075/1‑91 (MQ=255) tAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATa < 1:1254961/91‑1 (MQ=255) tAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATa < 1:99857/91‑1 (MQ=255) tAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATa > 1:585945/1‑91 (MQ=255) tAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTCTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATa > 2:3876380/1‑91 (MQ=255) aaCTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATGATTAAATATAAAGACGATTTATTAATTTTTACGTTTTCTAGGTAATAc < 2:1562360/91‑1 (MQ=255) aaCTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATAc > 2:2255375/1‑91 (MQ=255) aCTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTGAATTTAATAATTAAATATAAAGACGGTTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACg < 1:1028416/91‑1 (MQ=255) ggATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAAt > 2:1711957/1‑91 (MQ=255) gATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATg < 2:3148139/91‑1 (MQ=255) aTACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGc > 2:2589523/1‑91 (MQ=255) tACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCa < 1:706686/91‑1 (MQ=255) ccTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAAc < 2:942047/91‑1 (MQ=255) tCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGa < 2:2766841/91‑1 (MQ=255) cATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGAt > 2:604184/1‑91 (MQ=255) cATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGAt > 1:2405371/1‑91 (MQ=255) aTCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGATg > 1:84130/1‑91 (MQ=255) aTCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGATg > 1:3347203/1‑91 (MQ=255) | TATAAAAAGTCCCGCTTAAAATGATTGTTTTAAGTGGGACTTTTTATATTGCGAAAAATAATTGGCGAACGAGGTAACTGGATACCTCATCCGCCAATTAAAATTTGTTAATTTAATAATTAAATATAAAGACGATTTATTAGTTTTTACGTTTTCTAGGTAATACGAATGCAACGATGCT > USA300TCH1516_ALE/1136159‑1136339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |