| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1245227 = | 205 (1.010) | 14 (0.080) | 9/146 | NT | 7.3% | intergenic (+32/‑211) | fabG/acpP | 3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase FabG/Acyl carrier protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1245269 = | 169 (0.910) | intergenic (+74/‑169) | fabG/acpP | 3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase FabG/Acyl carrier protein | |||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
GTGGAATGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAT > USA300TCH1516_ALE/1245179‑1245359 | gtggAATGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACt > 2:2217050/1‑91 (MQ=255) gAATGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTg < 2:2926088/91‑1 (MQ=255) aaTGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGc > 1:755084/1‑91 (MQ=255) gTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCggg < 2:41077/91‑1 (MQ=255) tACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCgggg < 2:493046/91‑1 (MQ=255) aCATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCggggg > 2:3810163/1‑91 (MQ=255) aCATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCggggg > 2:3625985/1‑91 (MQ=255) aCATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCggggg > 2:24314/1‑91 (MQ=255) cATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGa < 1:3097247/91‑1 (MQ=255) cATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGa > 2:32946/1‑91 (MQ=255) tAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAAtt < 2:1101102/91‑1 (MQ=255) atatatTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCt < 2:844506/91‑1 (MQ=255) tatatTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTa < 1:1627439/91‑1 (MQ=255) atatTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTaa > 1:2904814/1‑91 (MQ=255) tatTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAg < 2:21916/91‑1 (MQ=255) tatTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAg > 1:1125451/1‑91 (MQ=255) atTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGc < 1:484770/91‑1 (MQ=255) ctttaGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAGATTCTAAGCAACCTAg > 2:3033191/5‑91 (MQ=255) cTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAg > 1:843388/1‑91 (MQ=255) cTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAg > 2:2040274/1‑91 (MQ=255) cTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAg < 1:3260107/91‑1 (MQ=255) cTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAg < 2:611301/91‑1 (MQ=255) cTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAg < 1:2854422/91‑1 (MQ=255) tAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCttat < 2:2268170/91‑4 (MQ=255) ttaGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGAt > 1:269244/3‑91 (MQ=255) ttaGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGAt > 2:1057074/3‑91 (MQ=255) gtaGCTCATCGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGCATCGCCTGACCTAGCCAGCTCTGCGGCGGCGCTTCTAACCAACCTCGAt > 2:1511806/3‑91 (MQ=255) taGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCCATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATa > 2:3328652/2‑91 (MQ=255) taGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCCAATTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATa > 2:672443/2‑91 (MQ=255) aTTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTc < 2:529773/91‑1 (MQ=255) aTTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTc < 2:608650/91‑1 (MQ=255) ttGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTcc < 1:761449/91‑1 (MQ=255) tGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTGTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCa < 1:3322814/91‑1 (MQ=255) gACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAg < 2:637160/91‑1 (MQ=255) aCGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGa < 1:769855/91‑1 (MQ=255) cGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGGGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGaa > 1:2217599/1‑91 (MQ=255) gCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAAt > 2:1366938/1‑91 (MQ=255) gCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAAt > 1:123624/1‑91 (MQ=255) aGTGGTTGACTGGTGATCCGATGGAGAATTGTCTGGCCTAGTCAAGTTTGCGGGGGAAAGTCTGAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGGAttt < 2:3398381/91‑1 (MQ=255) gTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTtc < 1:2026339/91‑1 (MQ=255) gTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTtc > 1:1017552/1‑91 (MQ=255) tGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTtct < 1:1440429/91‑1 (MQ=255) GTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTcc < 1:36787‑M1/91‑1 (MQ=255) TTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTccc < 1:3012280‑M1/91‑1 (MQ=255) tgactaggtcagacaattctccattggatgaccagtcaacTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCt > 1:95115‑M2/41‑91 (MQ=255) actaggtcagacaattctccattggatgaccagtcaacTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTaa > 1:3633508‑M2/39‑91 (MQ=255) ACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTaa < 2:2737184‑M1/91‑1 (MQ=255) CTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAg < 2:335864‑M1/91‑1 (MQ=255) taggtcagacaattctccattggatgaccagtcaacTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGa > 1:570773‑M2/37‑91 (MQ=255) TGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGa > 1:1148399‑M1/1‑91 (MQ=255) TGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGa > 1:3493127‑M1/1‑91 (MQ=255) ggTCATCCAATGGAGCATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGaa > 1:3371017/1‑91 (MQ=255) ggTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGaa > 1:2251049/1‑91 (MQ=255) tCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAac > 1:2132625/1‑91 (MQ=255) tCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAac > 1:3862543/1‑91 (MQ=255) tcagacaattctccattggatgaccagtcaacTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAaca > 1:70675‑M2/33‑91 (MQ=255) cATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAaca < 1:129482/91‑1 (MQ=255) cATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAaca > 2:1796284/1‑91 (MQ=255) cATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAaca > 1:1944800/1‑91 (MQ=255) cATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGATTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAaca > 1:3689913/1‑91 (MQ=255) tCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACt > 2:1288804/1‑91 (MQ=255) tCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACt < 2:560197/91‑1 (MQ=255) agacaattctccattggatgaccagtcaacTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACt > 2:2787008‑M2/31‑91 (MQ=255) gacaattctccattggatgaccagtcaacTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTa > 1:1348716‑M2/30‑91 (MQ=255) ccAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAacacag < 1:861123/91‑3 (MQ=255) cAATGGAGAGTTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTaa > 1:1980169/1‑91 (MQ=255) cAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTaa < 1:2407978/91‑1 (MQ=255) aaTGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAATCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAAt > 2:1552524/1‑91 (MQ=255) aaTGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAAt < 1:1738072/91‑1 (MQ=255) aaTGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAAt < 1:1385818/91‑1 (MQ=255) aTGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATc > 1:2439061/1‑91 (MQ=255) ggAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCaa < 1:90736/91‑1 (MQ=255) agaATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATa > 1:1898036/1‑91 (MQ=255) agaATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATa < 2:1502162/91‑1 (MQ=255) agaATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATa > 1:1543282/1‑91 (MQ=255) agaATTGTCTGACCTAGTCAACTCTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATa > 2:2653948/1‑91 (MQ=255) gaATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATaa > 2:377649/1‑91 (MQ=255) gaATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATaa > 2:377861/1‑91 (MQ=255) aaTTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATaaa < 1:3176689/91‑1 (MQ=255) gTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGa < 2:1686608/91‑1 (MQ=255) cTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATa < 2:2818779/91‑1 (MQ=255) cTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATa > 2:2614805/1‑91 (MQ=255) cTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATa > 2:1917246/1‑91 (MQ=255) tGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTTATCAATTTATTGAtta < 1:537471/91‑3 (MQ=38) tGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATaa > 1:1077950/1‑91 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTTATCAATTTATTGAttag < 1:2633176/91‑4 (MQ=38) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTTATCAATTTATTGAttag < 1:3812814/91‑4 (MQ=38) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTTATCAATTTATTGATTAg < 1:3464800/91‑1 (MQ=38) aCCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTTATCAATTTATTGATTAgt < 2:2025242/91‑1 (MQ=38) ccTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTTATCAATTTATTGATTAgtg < 2:472225/91‑1 (MQ=38) cTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTTATCAATTTATTGATTAgtgt < 2:356773/91‑1 (MQ=37) gtcaacTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTc > 1:1033630‑M2/7‑91 (MQ=255) gtcaacTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTc > 1:2970039‑M2/7‑91 (MQ=255) gtcaacTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTc > 2:263349‑M2/7‑91 (MQ=255) caacTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTa < 2:2912267‑M2/87‑1 (MQ=255) caacTTTGCGGGAGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATCTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATCAGTGTTTCTa > 2:829124‑M2/5‑91 (MQ=255) acTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaaa > 1:359513‑M2/3‑91 (MQ=255) acTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaaa > 1:2872176‑M2/3‑91 (MQ=255) acTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTCCTaaa > 2:3209539‑M2/3‑91 (MQ=255) tttGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAt > 1:2040410/1‑91 (MQ=255) | GTGGAATGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAT > USA300TCH1516_ALE/1245179‑1245359 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |