| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1361472 = | 162 (0.800) | 14 (0.080) | 8/140 | NT | 8.7% | intergenic (+11/+282) | USA300HOU_RS06765/USA300TCH1516_01271 | Putative phosphatase/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1361520 = | 153 (0.860) | intergenic (+59/+234) | USA300HOU_RS06765/USA300TCH1516_01271 | Putative phosphatase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGAATAGAGTAAAT > USA300TCH1516_ALE/1361430‑1361610 | tATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCtttt < 2:2335109/91‑1 (MQ=255) tATTCCACATGCACTCAAAACATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCtttt > 1:3037963/1‑91 (MQ=255) aTTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCttttt > 1:728969/1‑91 (MQ=255) tCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAt > 2:1099894/1‑91 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt > 1:1076383/1‑91 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt < 2:3045973/91‑1 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt < 2:1584411/91‑1 (MQ=255) caTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAttttt > 1:1704899/1‑91 (MQ=255) cgcTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGa < 2:2520072/91‑1 (MQ=255) cgcTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGa < 2:620353/91‑1 (MQ=255) tCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGaaaa < 1:1785451/91‑1 (MQ=255) tCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGaaaa < 1:874978/91‑1 (MQ=255) cAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAAt > 2:2136601/1‑91 (MQ=255) cAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATAATGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAAt > 2:1636336/1‑91 (MQ=255) aaaaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATGAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTTTTAAAATGa > 2:3480854/1‑91 (MQ=255) aaaaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGa > 2:582999/1‑91 (MQ=255) aaaaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGa < 1:2620120/91‑1 (MQ=255) aaaaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGa > 1:2467579/1‑91 (MQ=255) aaaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGAc < 2:2226835/91‑1 (MQ=255) aaaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGAc < 1:1579472/91‑1 (MQ=255) aaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACt > 2:2564290/1‑91 (MQ=255) aaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACt < 2:2705778/91‑1 (MQ=255) aaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACt > 1:1347855/1‑91 (MQ=255) aaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATAACt < 1:231244/91‑1 (MQ=255) aaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACtt < 2:189336/91‑1 (MQ=255) aTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTc < 2:3305793/91‑1 (MQ=255) aTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTc > 1:3215077/1‑91 (MQ=255) tGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAg > 2:3046941/1‑91 (MQ=255) tGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAg > 2:1321672/1‑91 (MQ=255) gTTATGAATTTTAAAATAAGCCTTAGCACATGATATTTGGATAAGATATCTTGGGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGt < 1:3681601/91‑1 (MQ=255) gTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGt < 1:2944427/91‑1 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt < 2:906882/91‑1 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt < 2:1262681/91‑1 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt > 2:7862/1‑91 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt > 1:2407585/1‑91 (MQ=255) ataAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTtat < 1:1039877/91‑1 (MQ=255) ataAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTtat > 1:2853449/1‑91 (MQ=255) aaTTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACt < 1:441589/91‑1 (MQ=255) aaTTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACt < 1:1796198/91‑1 (MQ=255) aTTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTa < 2:2279986/91‑1 (MQ=255) tttAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATg < 2:2771283/91‑1 (MQ=255) aaaataaaaagccttaaccacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATg > 1:1497108‑M2/57‑91 (MQ=255) aaaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagg < 1:796132/91‑1 (MQ=255) aaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagga > 1:2141709/1‑91 (MQ=255) aaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagga > 1:2239107/1‑91 (MQ=255) aaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagga > 1:283965/1‑91 (MQ=255) aaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagga > 1:3108196/1‑91 (MQ=255) aTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGAt > 2:350179/1‑91 (MQ=255) aTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGAt < 2:1533807/91‑1 (MQ=255) tAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGAtt > 1:1544929/1‑91 (MQ=255) aagcctaaaccacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGAttt > 1:3073976‑M2/49‑91 (MQ=255) AGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTg < 1:364031‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTg < 1:522080‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTg < 1:791873‑M1/91‑1 (MQ=255) gccttaaccacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGa > 2:3184477‑M2/47‑91 (MQ=255) CCTTAACACATGATACTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGACAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGaa < 1:3371026‑M1/91‑1 (MQ=255) ttaaccacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttTTTATTTTTGTTAAATTGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAAt > 2:1167121‑M2/44‑91 (MQ=255) ttaaccacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAAt > 2:290115‑M2/44‑91 (MQ=255) TAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATa > 1:3463657‑M1/1‑91 (MQ=255) ACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACa < 2:210431‑M1/91‑1 (MQ=255) caTGATATTTGGATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACatat < 1:3578096/91‑1 (MQ=255) caTGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACatat < 2:1997010/91‑1 (MQ=255) aTGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATAtt < 2:404904/91‑1 (MQ=255) aTGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATAtt < 2:2496557/91‑1 (MQ=255) tGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATAttt < 2:398172/91‑1 (MQ=255) gATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATAtttt > 2:2583687/1‑91 (MQ=255) gATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATAtttt < 2:3755664/91‑1 (MQ=255) atatTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTa > 1:3202575/1‑91 (MQ=255) tatTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGTGTATTTGAAATTCATATTTTAg > 2:1133916/1‑91 (MQ=255) tttGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGAt > 1:3821873/1‑91 (MQ=255) tttGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGAt < 2:166467/91‑1 (MQ=255) tGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTa < 1:1231135/91‑1 (MQ=255) gAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAg > 1:413095/1‑91 (MQ=255) tAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTaa > 1:1625213/1‑91 (MQ=255) aaGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAAt < 2:3437153/91‑1 (MQ=255) aaGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAAt < 2:2748914/91‑1 (MQ=255) aaGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAAt < 1:2196666/91‑1 (MQ=255) aaatatCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATg > 2:2976360/3‑91 (MQ=255) aGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATg < 2:468712/91‑1 (MQ=255) atatCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGat > 1:869285/1‑91 (MQ=255) tatCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGata < 1:1941959/91‑1 (MQ=255) tCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGatatt > 2:1411773/1‑90 (MQ=255) tCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATc > 2:3546148/1‑91 (MQ=255) tCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATc < 1:2069135/91‑1 (MQ=255) tCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATc > 2:5510/1‑91 (MQ=255) tCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATc > 2:2169544/1‑91 (MQ=255) tCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATCATATc > 2:3643467/1‑91 (MQ=255) ttGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCaa < 1:2958766/91‑1 (MQ=255) tgtgGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCaaa < 1:378674/91‑1 (MQ=255) tgtgGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCaaa < 1:518188/91‑1 (MQ=255) gtgGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAAc < 1:83351/91‑1 (MQ=255) gttaaggcttTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGaa > 2:1783510‑M2/11‑91 (MQ=255) ttaaggcttTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGAAt < 1:1985801‑M2/82‑1 (MQ=255) taaggcttTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGAATa < 2:876481‑M2/83‑1 (MQ=255) aaggcttTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGAATag > 1:2729112‑M2/8‑91 (MQ=255) aggcttTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGAATaga > 2:819413‑M2/7‑91 (MQ=255) ttTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGAATAGAGTaa < 2:2542607‑M2/89‑1 (MQ=255) tTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGAATAGAGTaaa > 2:2289831‑M2/2‑91 (MQ=255) tTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGAATAGAGTaaa > 1:1282740‑M2/2‑91 (MQ=255) tttATTTTTTTTTAAATTACTTCATTTATCCTATGGCGTCTTTGAAATACATCTTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGCATAGCGTAAAt > 2:88345/1‑91 (MQ=255) | GTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGAATAGAGTAAAT > USA300TCH1516_ALE/1361430‑1361610 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |