New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1371838 = | 163 (0.800) | 7 (0.040) | 5/142 | NT | 5.1% | coding (1368/1989 nt) | tkt | Transketolase |
? | USA300TCH1516_ALE | 1371876 = | 115 (0.640) | coding (1406/1989 nt) | tkt | Transketolase |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
ATTTAAAACCAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTAATGAAACAAG > USA300TCH1516_ALE/1371786‑1371966 | attTAAAACCAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATgg > 1:543611/1‑91 (MQ=255) tttAAAACCAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGt < 1:3308485/91‑1 (MQ=255) tttAAAACCAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGt < 1:1358215/91‑1 (MQ=255) ttAAAACCAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTc < 1:3249499/91‑1 (MQ=255) ttAAAACCAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTc < 2:2458589/91‑1 (MQ=255) tAAAACCAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTcc < 1:2877369/91‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTa < 1:2815688/91‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTa < 2:2546178/91‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTa < 2:2914961/91‑1 (MQ=255) cAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCa < 1:1194201/91‑1 (MQ=255) gCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAACTGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCGATTGCAGTAGGTGCAGATGGTCCTACTCATg > 2:1055804/1‑91 (MQ=255) cGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGa < 1:1089907/91‑1 (MQ=255) cGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGa > 1:1297807/1‑91 (MQ=255) gTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGaa > 1:1893228/1‑91 (MQ=255) gTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGaa < 2:2438242/91‑1 (MQ=255) gTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGaa < 2:1658365/91‑1 (MQ=255) gTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGaa > 1:2797230/1‑91 (MQ=255) gTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGaa > 2:720272/1‑91 (MQ=255) ttACGTTTATCATCAATTATGGGTTTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAAc < 2:3011239/91‑1 (MQ=255) ttACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAAc < 1:1848288/91‑1 (MQ=255) cGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCaa < 1:2242332/91‑1 (MQ=255) cGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCaa < 2:1555002/91‑1 (MQ=255) cGTTTATCAGCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACGCATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCaa < 2:1245511/91‑1 (MQ=255) tATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGa > 1:1240456/1‑91 (MQ=255) tATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGa > 1:2428423/1‑91 (MQ=255) tcatcaATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGc < 2:1736174/91‑1 (MQ=255) tcatcaATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGc < 1:3094360/91‑1 (MQ=255) catcaATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCa > 1:1392454/1‑91 (MQ=255) tcaATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAAt < 2:795316/91‑1 (MQ=255) tcaATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAAt < 2:3063456/91‑1 (MQ=255) caATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAAtt > 2:3895581/1‑91 (MQ=255) aTTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAg > 1:2967730/1‑91 (MQ=255) ttATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGc < 2:145296/91‑1 (MQ=255) ttATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGc < 2:1342087/91‑1 (MQ=255) tATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCt > 2:1535205/1‑91 (MQ=255) aTGGGATTAAATGGAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGGAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTg < 1:3949510/91‑1 (MQ=255) aTGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTg < 1:305832/91‑1 (MQ=255) aTGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTg < 1:323560/91‑1 (MQ=255) gggATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGa > 2:1918359/1‑91 (MQ=255) gggATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGa > 1:1618228/1‑91 (MQ=255) gggATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGa > 2:1257376/1‑91 (MQ=255) tggttcatgagtaggacCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGAt > 1:2572363‑M1/18‑91 (MQ=255) ttAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTaa < 2:1789447/91‑1 (MQ=255) ttAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTaa < 2:133916/91‑1 (MQ=255) aaTGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAagag > 1:2362765/1‑91 (MQ=255) aaTGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAagag < 2:2107018/91‑1 (MQ=255) aaTGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAagag < 1:1050696/91‑1 (MQ=255) tGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGcc < 1:869717/91‑1 (MQ=255) cAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCAt < 2:370498/91‑1 (MQ=255) cAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCAt < 2:3158731/91‑1 (MQ=255) aCGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTc > 1:3641423/1‑91 (MQ=255) aCGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTc < 1:3274521/91‑1 (MQ=255) gTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCa > 2:1503158/1‑91 (MQ=255) gTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCa < 2:334725/91‑1 (MQ=255) ATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAata > 2:3252837‑M1/1‑91 (MQ=255) tcttcacctactgcaattgaatcatgtgtgaagatgGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAatat > 1:948293‑M2/37‑91 (MQ=255) TCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAatat > 1:2071453‑M1/1‑91 (MQ=255) CTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATg > 1:432329‑M1/1‑91 (MQ=255) TTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGa < 2:3345834‑M1/91‑1 (MQ=255) TCACACATGATTCAATTGTAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGaa > 2:1768582‑M1/1‑91 (MQ=255) TCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGaa < 1:3744815‑M1/91‑1 (MQ=255) CACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAAt < 1:292691‑M1/91‑1 (MQ=255) CACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAAt < 2:3604281‑M1/91‑1 (MQ=255) acctactgcaattgaatcatgtgtgaagatgGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATg > 1:3501440‑M2/32‑91 (MQ=255) ACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATg > 2:1614036‑M1/1‑91 (MQ=255) CACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGt < 2:2487057‑M1/91‑1 (MQ=255) caTGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTa > 2:2738421/1‑91 (MQ=255) aTGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTAt < 2:3392360/91‑1 (MQ=255) tCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTc < 1:1236315/91‑1 (MQ=255) tCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTc < 2:2963442/91‑1 (MQ=255) tCAATTGCAGGAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTc < 2:239876/91‑1 (MQ=255) cAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTcc < 2:579500/91‑1 (MQ=255) cAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTcc > 2:233399/1‑91 (MQ=255) aaTTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCct > 1:1784640/1‑91 (MQ=255) aaTTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCct > 1:739371/1‑91 (MQ=255) ttGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCctgc > 1:3802361/1‑91 (MQ=255) ttGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCctgc < 1:2956803/91‑1 (MQ=255) tGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCctgct < 2:555890/91‑1 (MQ=255) gCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCctgctg > 1:3894273/1‑91 (MQ=255) gCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCctgctg < 1:3193849/91‑1 (MQ=255) gCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTAGCCGTCctgctg > 1:3582307/1‑91 (MQ=255) aGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGAt > 1:2538783/1‑91 (MQ=255) aGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGAt < 2:3781732/91‑1 (MQ=255) gTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATg > 1:886097/1‑91 (MQ=255) gTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATg > 1:2595181/1‑91 (MQ=255) gTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATg < 1:1756382/91‑1 (MQ=255) gTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATg < 1:26681/91‑1 (MQ=255) ggTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGGGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTa < 2:1862851/91‑1 (MQ=255) ggTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTa > 2:2059615/1‑91 (MQ=255) ggTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTa > 2:2316311/1‑91 (MQ=255) ggTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGAAATTAGCTGGATTAAGAGCCAGTCCAAATATGAATGTTATCCGTCATGCTGATGGTa > 2:3561010/1‑91 (MQ=255) gtgaagatgGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTaa > 1:2982987‑M2/10‑91 (MQ=255) gaagatgGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTAATg < 1:709738‑M2/84‑1 (MQ=255) gaagatgGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTAATg > 1:2107810‑M2/8‑91 (MQ=255) gaagatgGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTAATg < 1:1512777‑M2/84‑1 (MQ=255) aagatgGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTAATGa > 2:285042‑M2/7‑91 (MQ=255) agatgGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTAATGaa > 2:1615417‑M2/6‑91 (MQ=255) agatgGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATGAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAATTATGAATGGTATCCGTCCTGCTGATGGTAATGaa < 2:939525‑M2/86‑1 (MQ=255) gatgGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTAATCaaa > 1:3065228‑M2/5‑91 (MQ=255) atgGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTAATGAAAc > 1:1656391‑M2/4‑91 (MQ=255) | ATTTAAAACCAGCGTTACGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATGCAACGTTCATCTTCACACATGATTCAATTGCAGTAGGTGAAGATGGTCCTACTCATGAACCAATTGAGCAATTAGCTGGATTAAGAGCCATTCCAAATATGAATGTTATCCGTCCTGCTGATGGTAATGAAACAAG > USA300TCH1516_ALE/1371786‑1371966 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |