New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1392266 = | 231 (1.130) | 13 (0.070) | 9/140 | NT | 6.7% | intergenic (+40/‑460) | alsT/glcT | Amino‑acid carrier protein AlsT/GlcA/glcB genes antiterminator |
? | USA300TCH1516_ALE | 1392308 = | 162 (0.910) | intergenic (+82/‑418) | alsT/glcT | Amino‑acid carrier protein AlsT/GlcA/glcB genes antiterminator |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
GATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGATTTATTTCC > USA300TCH1516_ALE/1392218‑1392398 | gATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGtttt < 2:1845957/91‑1 (MQ=255) gATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGtttt > 1:2926353/1‑91 (MQ=255) gATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGtttt < 1:2646276/91‑1 (MQ=255) ataaataaATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTa > 2:2383254/1‑91 (MQ=255) taaataaaTATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTaa < 2:2783578/91‑1 (MQ=255) taaataaaTATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAAACCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTaa > 2:3485911/1‑91 (MQ=255) aaataaatATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTaaa > 2:923626/1‑91 (MQ=255) aaataaatATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTaaa < 2:3378401/91‑1 (MQ=255) aaataaatATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTaaa < 1:2177642/91‑1 (MQ=255) ataaataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAGGCGAATATCTCAGGGTTTTAAAtt < 1:664529/91‑1 (MQ=255) ataaataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAAtt < 1:2029164/91‑1 (MQ=255) ataaataTTTTTAATGTAACGATACATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAAtt < 1:1075661/91‑1 (MQ=255) aaataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTg < 1:2293554/91‑1 (MQ=255) aataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGt > 2:739979/1‑91 (MQ=255) aataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGt > 2:2336547/1‑91 (MQ=255) aataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGt > 2:356146/1‑91 (MQ=255) aataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGt < 2:299553/91‑1 (MQ=255) atatTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTa < 2:1599722/91‑1 (MQ=255) tatTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTaa < 2:2278824/91‑2 (MQ=255) atTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACt < 1:819549/91‑1 (MQ=255) atTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACt > 1:323933/1‑91 (MQ=255) tttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCaa > 2:1878176/1‑91 (MQ=255) tttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCaa < 1:2346310/91‑1 (MQ=255) tttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCaa > 2:433075/1‑91 (MQ=255) ttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAAt < 1:3831421/91‑1 (MQ=255) aaTGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTa < 1:1225899/91‑1 (MQ=255) aTGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTTAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTat > 2:565719/1‑91 (MQ=255) gTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTatca > 1:1806750/1‑91 (MQ=255) gTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTatca < 1:507333/91‑1 (MQ=255) aaCGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTatcatc > 2:251771/1‑91 (MQ=255) aTTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTa > 1:2041679/1‑91 (MQ=255) cATTATATAAAAATCAAATAATCCCTGGGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATATCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATAATCTGTATCa > 2:244967/1‑91 (MQ=255) cATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCa < 2:858922/91‑1 (MQ=255) tatgaaaataaaatAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTaca < 1:3554254/87‑1 (MQ=255) aaaaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTAGACTa < 1:3121014/91‑1 (MQ=255) aaaaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTa > 1:2575621/1‑91 (MQ=255) aaaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAg < 1:211024/91‑1 (MQ=255) aaaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAg < 2:1731231/91‑1 (MQ=255) aaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGt > 2:3198296/1‑91 (MQ=255) aaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGt > 2:290263/1‑91 (MQ=255) aaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGt > 1:1019062/1‑91 (MQ=255) aaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGt > 1:1902818/1‑91 (MQ=255) aaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTCGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGt > 1:3235465/1‑91 (MQ=255) aaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAACCTCAGGCTTTTAAATTTGTACTCAACAATCATCTGCATCATTACACTAGt > 2:3670168/1‑91 (MQ=255) aaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGtt > 1:362583/1‑91 (MQ=255) aaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGtt > 1:1109183/1‑91 (MQ=255) aTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTa > 1:1996636/1‑91 (MQ=255) aTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTa > 2:2204776/1‑91 (MQ=255) cAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAAt < 1:3263846/91‑1 (MQ=255) aaaTAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATc > 1:3571681/1‑91 (MQ=255) aaTAAACCCTGAGGTTTTCACATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCt > 2:1394415/1‑91 (MQ=255) aaTAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCt > 1:1660040/1‑91 (MQ=255) tAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTaa < 2:1271252/91‑1 (MQ=255) AAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAg < 2:1423129‑M1/91‑1 (MQ=255) AAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAg < 1:3664479‑M1/91‑1 (MQ=255) AAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAg < 2:79141‑M1/91‑1 (MQ=255) AAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACACAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAg > 2:762743‑M1/1‑91 (MQ=255) AACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGa > 2:1139007‑M1/1‑91 (MQ=255) AACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGa > 1:2554814‑M1/1‑91 (MQ=255) AACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGa > 2:1971620‑M1/1‑91 (MQ=255) ACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGAt > 2:2052596‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGAt < 1:3887976‑M1/91‑1 (MQ=255) GAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGAt < 2:2765686‑M1/91‑1 (MQ=255) GAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGAt < 2:2599345‑M1/91‑1 (MQ=255) GAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGAt < 2:526724‑M1/91‑1 (MQ=255) GAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGAt < 1:463157‑M1/91‑1 (MQ=255) GAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCACTACACTAGTTAATCTAAGATTTGAt < 1:3666163‑M1/91‑1 (MQ=255) gTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATtat < 1:3185042/91‑1 (MQ=255) tttCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATtatat < 2:1954628/91‑1 (MQ=255) ttCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATtatata > 1:1357940/1‑91 (MQ=255) tcgctttaatttgaaaacctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTatatat > 2:2695741‑M2/29‑91 (MQ=255) cgctttaatttgaaaacctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATAtt > 2:1560275‑M2/28‑91 (MQ=255) cAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATAtt < 1:2758085/91‑1 (MQ=255) aaaaTTATAGCGAGTATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATAtttt < 2:1375134/90‑1 (MQ=255) ctttaatttgaaaacctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTaa > 1:2969634‑M2/26‑91 (MQ=255) aTTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAat < 1:1314868/91‑1 (MQ=255) ttaatttgaaaacctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAata > 1:1592934‑M2/24‑91 (MQ=255) tAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAatat < 2:302945/91‑1 (MQ=255) tAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAatat < 2:3225825/91‑1 (MQ=255) aaaGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAAtata < 1:2618587/91‑1 (MQ=255) aaaaTCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAgg < 1:1489227/91‑1 (MQ=255) aaaaTCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAgg > 2:417753/1‑91 (MQ=255) aaaTCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGt > 2:3137056/1‑91 (MQ=255) taTCTCATGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATTATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGtt < 2:2718237/90‑1 (MQ=255) aTCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTg < 2:878901/91‑1 (MQ=255) tcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTgaga > 1:3939974‑M2/10‑91 (MQ=255) tcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTgaga > 1:279071‑M2/10‑91 (MQ=255) cagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCGTGTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGat < 2:2014125‑M2/83‑1 (MQ=255) cagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGCTTTGATTCTATATTACTATAGTAAGGTTGAGat > 2:232518‑M2/9‑91 (MQ=255) cagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGat > 2:2626713‑M2/9‑91 (MQ=255) agtttttTAAATTTGTGCTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGatt < 2:3787845‑M2/84‑1 (MQ=255) agggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTACTCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGatt > 2:3463484‑M2/8‑91 (MQ=255) agggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGatt < 1:74466‑M2/84‑1 (MQ=255) gggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGattt > 1:2485878‑M2/7‑91 (MQ=255) gggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGattt > 1:2485762‑M2/7‑91 (MQ=255) gggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGattt < 1:128315‑M2/85‑1 (MQ=255) ggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTGAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGattta < 2:1202840‑M2/86‑1 (MQ=255) tttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGatttatt < 2:1800945‑M2/88‑1 (MQ=255) tAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGATTTATTtcc < 1:2997811/91‑1 (MQ=255) tAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGATTTATTtcc > 1:3710732/1‑91 (MQ=255) | GATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGATTTATTTCC > USA300TCH1516_ALE/1392218‑1392398 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |