New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1435387 = | 198 (0.970) | 19 (0.110) | 11/140 | NT | 11.2% | intergenic (+24/‑119) | dapH/yxeP_3 | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑acetyltransferase/putative hydrolase YxeP |
? | USA300TCH1516_ALE | 1435417 = | 129 (0.730) | intergenic (+54/‑89) | dapH/yxeP_3 | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑acetyltransferase/putative hydrolase YxeP |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
GAGATTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTATTTATATAGTAATTTAACACAAAGGATTGATAATTAT > USA300TCH1516_ALE/1435328‑1435507 | gagaTTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTAt > 2:2323647/1‑91 (MQ=255) ataaatagtgtaacgtatttcgaaatttgtgatcataagtttattcaatgctaaacaatAAGGTTGAGATACGATTATCTCTCAACCTTAt > 1:3033136‑M1/60‑91 (MQ=255) gaTTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTg < 2:839285/91‑1 (MQ=255) gaTTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTg < 2:1630204/91‑1 (MQ=255) gaTTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTg < 1:2076202/91‑1 (MQ=255) aTTGTAGCAGCATTAAGAAAACTGAATGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGt < 2:5826/91‑1 (MQ=255) 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tGACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATcac > 1:2813828/1‑91 (MQ=255) gACTCGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTGGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATcaca < 2:1459032/91‑1 (MQ=255) gACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATcaca < 1:556384/91‑1 (MQ=255) gACTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATcaca < 1:2786299/91‑1 (MQ=255) gACTAGTGACGTCAACGTATAATAAATTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATcaca < 1:3682977/91‑1 (MQ=255) aCTAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACaa > 2:1798909/1‑91 (MQ=255) tAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAAt < 2:2227905/91‑1 (MQ=255) tAGTGACGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGAGTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAAt < 2:3479949/91‑1 (MQ=255) aCGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGa < 1:2347478/91‑1 (MQ=255) aCGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGa < 1:252233/91‑1 (MQ=255) cGTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGaa > 2:389530/1‑91 (MQ=255) gTCAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGaaa < 2:3311465/91‑1 (MQ=255) cAACGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATa > 2:1742010/1‑91 (MQ=255) aCGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACg > 1:3605435/1‑91 (MQ=255) aCGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACg < 2:492968/91‑1 (MQ=255) aCGTATAATAATTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACg > 2:1304189/1‑91 (MQ=255) 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taataaTTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTaca > 2:189468/1‑91 (MQ=255) taataaTTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTaca > 1:3306688/1‑91 (MQ=255) aataatTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTacac < 2:211939/91‑1 (MQ=255) ataatTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACt > 2:786495/1‑91 (MQ=255) taatTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTa > 2:1284712/1‑91 (MQ=255) aaacaatAAGGTTGAGACATAATCGTATCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTa < 2:1734687‑M1/84‑1 (MQ=255) aatTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTAt > 2:2482870/1‑91 (MQ=255) aatTTCAAGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTAt > 2:251956/1‑91 (MQ=255) 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AGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTATTtatata < 2:1177823‑M1/91‑1 (MQ=255) AGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTATTtatata > 2:2504727‑M1/1‑91 (MQ=255) AGGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTATTtatata > 1:2169102‑M1/1‑91 (MQ=255) GGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTATTTATATAg < 2:243908‑M1/91‑1 (MQ=255) GGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTATTTATATAg < 1:2778453‑M1/91‑1 (MQ=255) GGTTGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTATTTATATAg > 1:738258‑M1/1‑91 (MQ=255) tgagacataatcgtatctcaaccttATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTATTTATATAGTaa > 1:3539441‑M2/26‑91 (MQ=255) TGAGATACGATTATGTCTCAACCTTATTGTTTAGCATTGAATAAACTTATGATCACAAATTTCGAAATACGTTACACTATTTATATAGTaa < 2:3590759‑M1/91‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |