New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1671778 = | 204 (1.000) | 24 (0.130) | 11/146 | NT | 12.8% | intergenic (‑23/+108) | trmK/sigA | tRNA (adenine(22)‑N(1))‑methyltransferase/RNA polymerase sigma factor SigA |
? | USA300TCH1516_ALE | 1671809 = | 142 (0.760) | intergenic (‑54/+77) | trmK/sigA | tRNA (adenine(22)‑N(1))‑methyltransferase/RNA polymerase sigma factor SigA |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
GACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGT > USA300TCH1516_ALE/1671719‑1671899 | gACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctca > 2:958781/1‑91 (MQ=255) gACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctca < 2:2514933/91‑1 (MQ=255) gACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctca > 1:2689134/1‑91 (MQ=255) aCTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCAAAAAAAAAAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctcac < 2:858183/91‑1 (MQ=255) tgagaccaagacatgaataagcgcttatttatttttagattaagatttaacctgagtGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctcact > 2:1489167‑M1/58‑91 (MQ=255) cTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctcact > 2:3326476/1‑91 (MQ=255) tACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctcactca < 1:3043152/91‑1 (MQ=255) ccGTCGTTAATCGGTTATTCAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGACAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAg > 2:1333810/1‑91 (MQ=255) cgtcgtTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGt < 1:207406/91‑1 (MQ=255) cgtTAGTCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCGTTATGACAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTaa < 2:3547672/91‑1 (MQ=255) ttAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAGTGTACCAACCTCACTCAAGGTAAAt > 1:3675142/1‑91 (MQ=255) ttAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAAt > 2:1018893/1‑91 (MQ=255) tAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATc < 1:1737473/91‑1 (MQ=255) aaTCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCt > 1:3484053/1‑91 (MQ=255) aaTCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCt > 2:345988/1‑91 (MQ=255) aTCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCtt > 2:3948601/1‑91 (MQ=255) ggTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAAt > 2:1690165/1‑91 (MQ=255) attATTTAACGAAATCATTTTATTCTAAAAAAAAAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATc < 2:3524021/90‑1 (MQ=255) ttATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCt > 2:499404/1‑91 (MQ=255) ttATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTATATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCt < 2:2295886/91‑1 (MQ=255) tATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTa > 1:2850984/1‑91 (MQ=255) tttAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTaaa < 1:644514/91‑1 (MQ=255) tttAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTaaa < 2:2147270/91‑1 (MQ=255) tttAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTaaa > 2:1417720/1‑91 (MQ=255) ttAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTaaaa > 1:3747961/1‑91 (MQ=255) ttAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTaaaa > 1:637551/1‑91 (MQ=255) ttAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTaaaa > 2:1700147/1‑91 (MQ=255) tAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTaaaaa > 2:25903/1‑91 (MQ=255) aaCGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaat < 1:2284002/91‑1 (MQ=255) aCGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaata < 1:2196179/91‑1 (MQ=255) cGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaataa > 2:181596/1‑91 (MQ=255) cGAAATCATTTTATTCAACAAAAAAAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaataa < 2:2715498/91‑1 (MQ=255) gAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTGTTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaataaa < 1:3945240/91‑1 (MQ=255) tCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAataaataac > 2:1580344/1‑90 (MQ=255) aTTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAgcg > 2:1058913/1‑91 (MQ=255) aTTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAgcg > 2:3042938/1‑91 (MQ=255) tttATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCt > 2:2231170/1‑91 (MQ=255) tttATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCt > 2:2231583/1‑91 (MQ=255) ttATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCtt > 1:2388050/1‑91 (MQ=255) ttATTCTCCGTGATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCtt < 2:3604552/91‑1 (MQ=255) tATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTa < 1:449761/91‑1 (MQ=255) tATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTa > 2:2095822/1‑91 (MQ=255) aTTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTAt < 1:3414666/91‑1 (MQ=255) cctgtATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATg < 1:3111964/87‑1 (MQ=255) ctatATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGt < 2:190630/88‑1 (MQ=255) cTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCGCTCAAGTTTAATGTTAATCTAAGAATAAATAAGCGCTTATTCATGt < 1:3156776/91‑1 (MQ=255) ttATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATGCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCt < 2:148074/91‑1 (MQ=255) aTGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTg > 1:1026638/1‑91 (MQ=255) aTGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTg < 1:2619471/91‑1 (MQ=255) tGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTgg < 1:1952976/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTa < 2:2198008/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTa > 1:3535314/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTa > 2:2895695/1‑91 (MQ=255) aaaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTat < 2:1627320/91‑1 (MQ=255) aaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatc > 2:3735912/1‑91 (MQ=255) aaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatcaa < 2:2932504/91‑1 (MQ=255) agagGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatcaat > 2:3945083/1‑91 (MQ=255) GAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatcaatc < 1:3337388‑M1/91‑1 (MQ=255) AGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatcaatca > 2:609263‑M1/1‑91 (MQ=255) ggttggtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCAt > 1:2941798‑M2/30‑91 (MQ=255) GGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTATTCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCAt < 2:3362227‑M1/91‑1 (MQ=255) GGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCAt < 2:3924268‑M1/91‑1 (MQ=255) gttggtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCAtt > 1:2580888‑M2/29‑91 (MQ=255) gttggtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCAtt > 2:379060‑M2/29‑91 (MQ=255) GTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTACTCATGTCTTGGTATCAATCAtt < 2:3185634‑M1/91‑1 (MQ=255) ttggtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTa > 2:627606‑M2/28‑91 (MQ=255) TTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTa < 1:5497‑M1/91‑1 (MQ=255) TTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTa < 1:3084914‑M1/91‑1 (MQ=255) tggtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATATGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTaa > 1:3370787‑M2/27‑91 (MQ=255) TGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTaa > 1:151140‑M1/1‑91 (MQ=255) TGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTaa > 1:785544‑M1/1‑91 (MQ=255) ggtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTaaa > 1:688274‑M2/26‑91 (MQ=255) gtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTaaaa > 1:839427‑M2/25‑91 (MQ=255) aaCATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTaaaa > 1:986085/1‑91 (MQ=255) tacattgaataatgctcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAAt > 2:2851795‑M2/24‑91 (MQ=255) aCATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAAt > 2:2135191/1‑91 (MQ=255) cattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTg > 1:735501‑M2/22‑91 (MQ=255) cattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTg > 2:3261467‑M2/22‑91 (MQ=255) cattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAAT‑AATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGa > 2:386853‑M2/22‑91 (MQ=255) ttgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGat > 1:1375617‑M2/20‑91 (MQ=255) ttgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGat > 2:3242106‑M2/20‑91 (MQ=255) tCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGAtata > 2:1748142/1‑91 (MQ=255) cAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATaa > 1:412760/1‑91 (MQ=255) aaTGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATaaa < 1:1091208/91‑1 (MQ=255) aTGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAAt > 1:2887542/1‑91 (MQ=255) tGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAAtt < 1:2551007/91‑1 (MQ=255) tGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAAtt > 2:701833/1‑91 (MQ=255) gTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTa > 2:3071604/1‑91 (MQ=255) tACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTaa > 2:3104103/1‑91 (MQ=255) caacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATcc < 1:3822619‑M2/84‑1 (MQ=255) acctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCAt < 1:2174860‑M2/86‑1 (MQ=255) acctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCAt > 1:1515114‑M2/6‑91 (MQ=255) acctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCAt > 2:1886893‑M2/6‑91 (MQ=255) acctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCAt > 1:1261844‑M2/6‑91 (MQ=255) ctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATaa < 1:1881095‑M2/88‑1 (MQ=255) ctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATaa < 2:2768212‑M2/88‑1 (MQ=255) tcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATaaa < 2:1970589‑M2/89‑1 (MQ=255) cACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAg < 1:679369‑M2/90‑1 (MQ=255) cACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAg > 2:1381054‑M2/2‑91 (MQ=255) actcaAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGt > 2:775371/1‑91 (MQ=255) | GACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGT > USA300TCH1516_ALE/1671719‑1671899 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |