| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1708649 | 214 (1.050) | 12 (0.070) | 6/132 | NT | 6.2% | intergenic (+94/+108) | USA300HOU_RS08530/entA_3 | hypothetical protein/Enterotoxin type A |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1708670 | 189 (1.130) | intergenic (+115/+87) | USA300HOU_RS08530/entA_3 | hypothetical protein/Enterotoxin type A | |||||
Only 100 of 383 total aligned reads displayed.
TTAATCATATTTGTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTAACTTAATTAAATTAT > USA300TCH1516_ALE/1708580‑1708760 | aataatctttgacagtgaaatataaagtacctgtcattatgttgttacaaataAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCtt > 2:2972490‑M1/54‑91 (MQ=255) tCATATTTGTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCctta < 1:2490467‑M2/91‑5 (MQ=255) ataatctttgacagtgaaatataaagtacctgtcattatgttgttacaaataAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTa > 2:1544948‑M1/53‑91 (MQ=255) cATATTTGTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttac > 1:1039376‑M2/1‑86 (MQ=255) cATATTTGTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttac < 2:585502‑M2/91‑6 (MQ=255) acatttGTTGCGGATCGAATTCCTGTTTTCATTAAAGAGAATTCGAATAAAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttact > 2:628409‑M2/3‑85 (MQ=255) atctttgacagtgaaatataaagtacctgtcattatgttgttacaaataAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTActg > 2:1941906‑M1/50‑91 (MQ=255) tcattgacagtgaaatataaaatacctgtcattatgttgttacaaataAAAACAGCAGTAAGACTTATCTAAGTGTTAGCATCCTTActgc > 2:1180209‑M1/49‑91 (MQ=255) atTTGTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgc > 2:83293‑M2/1‑83 (MQ=255) tttGTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgct < 2:3535747‑M2/91‑10 (MQ=255) ctttgacagtgaaatataaagtacctgtcattatgttgttacaaataAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTActgct > 1:2687242‑M1/48‑91 (MQ=255) tttgacagtgaaatataaagtacctgtcattatgttgttacaaataAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTActgctg > 1:3787078‑M1/47‑91 (MQ=255) ttGTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgctg > 1:3618134‑M2/1‑81 (MQ=255) ttGTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgctg > 2:331733‑M2/1‑81 (MQ=255) ttGTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgctg > 1:2821701‑M2/1‑81 (MQ=255) atgTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATATTTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgctg > 2:3910685‑M2/2‑81 (MQ=255) tGTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgctgt < 2:1290696‑M2/91‑12 (MQ=255) gTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgctgtt < 1:797126‑M2/91‑13 (MQ=255) tttCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgctgttt < 1:2888934‑M2/91‑14 (MQ=255) tttCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgctgttt < 2:1599368‑M2/91‑14 (MQ=255) ttCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgctgtttt > 1:2157855‑M2/1‑77 (MQ=255) ttCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgctgtttt > 2:1116651‑M2/1‑77 (MQ=255) tCGTATCGAATTGCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGttttt > 1:3040509/1‑91 (MQ=255) tCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGttttt > 2:208662/1‑91 (MQ=255) cGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTa < 1:2114314/91‑1 (MQ=255) cGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTa > 1:3877265/1‑91 (MQ=255) gTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTAt < 2:1367858/91‑1 (MQ=255) gTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTCACTGCTGtttttct > 2:684176/1‑89 (MQ=255) tATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTAtt < 2:286994/91‑1 (MQ=255) tATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTAtt > 2:1620970/1‑91 (MQ=255) tATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTAtt < 1:1639890/91‑1 (MQ=255) cGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGt < 2:3136417/91‑1 (MQ=255) aaTTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTaa > 2:2550555/1‑91 (MQ=255) aaTTCCGTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGGGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTaa < 1:3291805/91‑1 (MQ=255) aTTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTaac > 1:1257460/1‑91 (MQ=255) aTTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTaac > 1:2851458/1‑91 (MQ=255) ttCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTGAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTaaca < 1:3336615/91‑1 (MQ=255) tCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTaacaa < 2:3409378/91‑1 (MQ=255) ccTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTaacaac > 2:2451083/1‑91 (MQ=255) ttGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATa < 2:941748/91‑1 (MQ=255) tgCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATg < 1:1515029/91‑1 (MQ=255) tgCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATg < 1:465376/91‑1 (MQ=255) gCATTAAAGATAATGCTAATAGAACACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACCACATAATGa < 2:3160620/91‑1 (MQ=255) ttAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAg > 1:3922169/1‑91 (MQ=255) aaaGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGt > 1:994209/1‑91 (MQ=255) aTAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACtt < 1:1356622/91‑1 (MQ=255) aTAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACtt < 1:2648666/91‑1 (MQ=255) aTAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACtt < 1:1741647/91‑1 (MQ=255) aTAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTT‑TTTTTTACAACATAATGACAGGTACttt > 2:1402737/1‑91 (MQ=255) tAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACttt > 1:2195642/1‑91 (MQ=255) aaTTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTta < 1:2239414/91‑1 (MQ=255) aaTTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTta < 1:741321/91‑1 (MQ=255) aTTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTtat > 1:2323426/1‑91 (MQ=255) aTTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTtat > 2:1464121/1‑91 (MQ=255) aTTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTtat > 1:906824/1‑91 (MQ=255) ttCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTtata > 1:412615/1‑91 (MQ=255) ttCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTtata > 2:800835/1‑91 (MQ=255) tCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTatat < 1:1098030/91‑1 (MQ=255) tAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATAttt < 2:2157282/91‑1 (MQ=255) aaTAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTc > 2:411613/1‑91 (MQ=255) aaTAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTc > 2:3822390/1‑91 (MQ=255) aaTAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTc > 2:3105579/1‑91 (MQ=255) aTAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCa > 2:1794697/1‑91 (MQ=255) aTAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCa > 2:10425/1‑91 (MQ=255) aTAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCa > 2:3347578/1‑91 (MQ=255) aTAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCa < 1:32712/91‑1 (MQ=255) aTAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCAGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCa < 2:36780/91‑1 (MQ=255) AAACAGCAGCAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTc < 1:1980758‑M1/91‑1 (MQ=255) AACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCa > 2:3067530‑M1/1‑91 (MQ=255) ACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCaa < 1:598522‑M1/91‑1 (MQ=255) CAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCaaa < 1:3481751‑M1/91‑1 (MQ=255) CAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGGTTTTGTTTGTAACAACATAATGACAGGGACTATATATTTCACCGTCaaa > 2:2577966‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAg < 1:1893562‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGa > 2:3747344‑M1/1‑91 (MQ=255) CAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGat > 1:1368041‑M1/1‑91 (MQ=255) CAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGat < 2:2356614‑M1/91‑1 (MQ=255) CAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGat > 2:1080607‑M1/1‑91 (MQ=255) CAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGGTCTTTATATTTCACTGTCAAAGat < 2:748393‑M1/91‑1 (MQ=255) GTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGatta < 2:2498053‑M1/91‑1 (MQ=255) TAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGattat < 1:2745568‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGattatt < 2:728744‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGattatt > 2:1845486‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGattatt < 2:3601297‑M1/91‑1 (MQ=255) AGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGAttatta > 2:2919088‑M1/1‑91 (MQ=255) gACTTTTCTAAGTGTTAGCATCcttactgctgtttttattagaattatctttaatgcacaaaggaattcgatacgaaacaaatatgattaa < 1:3199795‑M2/91‑70 (MQ=255) cTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATg > 2:2784485/1‑91 (MQ=255) cTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATg < 2:3240043/91‑1 (MQ=255) ttttCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGa < 1:1001802/91‑1 (MQ=255) tttCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGAt > 1:2423994/1‑91 (MQ=255) ttCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGAtt < 1:1804460/91‑1 (MQ=255) tgtTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTAACttaa > 2:1224409/1‑91 (MQ=255) ttAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTCACttaatt > 2:3585909/1‑91 (MQ=255) ttAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTAACttaatt > 1:694135/1‑91 (MQ=255) tAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTAACttaatta < 2:2296275/91‑1 (MQ=255) aGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTAACttaattaa < 1:942286/91‑1 (MQ=255) gCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTAACTTaattaaa > 2:3651999/1‑91 (MQ=255) cATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTAACTTaattaaat < 1:1195458/91‑1 (MQ=255) cATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTGTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTAACTTaattaaat < 2:2654310/91‑1 (MQ=255) tCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTTCTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTAACTTaattaaatta > 2:459570/1‑91 (MQ=255) ccTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTAACTTAATTAAATTAt > 2:1013481/1‑91 (MQ=255) | TTAATCATATTTGTTTCGTATCGAATTCCTTTGTGCATTAAAGATAATTCTAATAGAAAACAGCAGTAAGACTTTTCTAAGTGTTAGCATCCTTACTGCTGTTTTTATTTGTAACAACATAATGACAGGTACTTTATATTTCACTGTCAAAGATTATTAATGATTAACTTAATTAAATTAT > USA300TCH1516_ALE/1708580‑1708760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |