New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1841984 = | 128 (0.630) | 22 (0.130) | 6/134 | NT | 17.9% | intergenic (+24/+70) | htrA/tyrS | Serine protease Do‑like HtrA/Tyrosine‑‑tRNA ligase |
? | USA300TCH1516_ALE | 1842029 = | 95 (0.560) | intergenic (+69/+25) | htrA/tyrS | Serine protease Do‑like HtrA/Tyrosine‑‑tRNA ligase |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATCAAT > USA300TCH1516_ALE/1841940‑1842119 | tAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACCGAAAAGGACATTAAGGGCCTACCCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatt < 2:1139944/91‑1 (MQ=255) tAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatt > 2:1693545/1‑91 (MQ=255) tAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatt > 1:1852912/1‑91 (MQ=255) agagATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAattt > 1:586672/1‑91 (MQ=255) agagATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAattt > 1:609796/1‑91 (MQ=255) agagATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAattt > 1:725288/1‑91 (MQ=255) gagaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAattta < 1:331504/91‑1 (MQ=255) agaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttat < 2:3842944/91‑1 (MQ=255) gaTTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAatttatt < 1:149239/91‑1 (MQ=255) ttCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAg > 1:761684/1‑91 (MQ=255) tCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGc < 2:2784156/91‑1 (MQ=255) cTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCt < 1:1529125/91‑1 (MQ=255) tttAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTa > 2:1581905/1‑91 (MQ=255) tAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACTTTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATg < 2:409752/91‑1 (MQ=255) tAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAt < 2:1941206/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:853418/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAAtt < 1:376020/91‑1 (MQ=255) tttACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATtat < 2:140823/91‑1 (MQ=255) ttACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATtata < 1:1811171/91‑1 (MQ=255) ttACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATtata < 1:1518931/91‑1 (MQ=255) tACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTatat < 1:1920903/91‑1 (MQ=255) tACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTatat < 1:1037310/91‑1 (MQ=255) agacagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTTCATGCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTTTTTAGCTAGGCAATTAtattta > 2:2219725/1‑91 (MQ=255) gacagaAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTAtatttat < 1:3788443/91‑1 (MQ=255) aaGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGt > 1:190804/1‑91 (MQ=255) aaGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGt < 1:1834995/91‑1 (MQ=255) aGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGtt < 2:3414786/91‑1 (MQ=255) aGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGtt > 1:3821062/1‑91 (MQ=255) aGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGtt > 2:2868427/1‑91 (MQ=255) aGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGtt > 1:3735403/1‑91 (MQ=255) aGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGtt > 1:1600148/1‑91 (MQ=255) aGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGtt > 2:902592/1‑91 (MQ=255) tACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTaa > 1:1249654/1‑91 (MQ=255) tACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGCCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATGTATTGATAGTTaa > 1:3960405/1‑91 (MQ=255) aCATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAc > 1:1365304/1‑91 (MQ=255) cATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAcc > 1:1051656/1‑91 (MQ=255) cATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAcc > 1:3223040/1‑91 (MQ=255) cATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAcc > 1:1292815/1‑91 (MQ=255) cATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAAcc > 2:1946189/1‑91 (MQ=255) aTTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCa > 1:2317303/1‑91 (MQ=255) ttAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCAt > 2:62185/1‑91 (MQ=255) tAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATg < 1:260395/91‑1 (MQ=255) aaGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGa < 1:2356213/91‑1 (MQ=255) AGAGTCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGaa > 1:3294805‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAg < 2:3268679‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGt < 2:2079395‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGt < 1:2346733‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCCTACTCATTACATGCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGt > 2:3034654‑M1/1‑91 (MQ=255) CTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATCTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtt < 2:3092185‑M1/91‑1 (MQ=255) tactcatattcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAACTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAttt > 1:3376083‑M2/40‑91 (MQ=255) TACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAttt < 2:548114‑M1/91‑1 (MQ=255) CTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAttttt > 1:1745603‑M1/1‑91 (MQ=255) CTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAttttt > 2:2803982‑M1/1‑91 (MQ=255) TCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttttt > 1:3872144‑M1/1‑91 (MQ=255) TCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTCATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTAtttttt < 2:3251756‑M1/91‑1 (MQ=255) catattcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTc > 1:999500‑M2/36‑91 (MQ=255) ATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCt < 2:2585464‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCt > 2:708269‑M1/1‑91 (MQ=255) tattcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCtt > 2:1548702‑M2/34‑91 (MQ=255) tattcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCtt > 2:1548810‑M2/34‑91 (MQ=255) tattcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCtt > 1:2492812‑M2/34‑91 (MQ=255) TTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCtt < 2:215445‑M1/91‑1 (MQ=255) attcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTa > 1:2351874‑M2/33‑91 (MQ=255) attcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTa > 2:1845313‑M2/33‑91 (MQ=255) attcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTa > 1:2924404‑M2/33‑91 (MQ=255) ttcattcctaagaatgtaatgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTAc > 1:119869‑M2/32‑91 (MQ=255) aCATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTAc > 2:1091632/1‑91 (MQ=255) cTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGcga < 1:2200550/91‑1 (MQ=255) cTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGcga > 2:3743244/1‑91 (MQ=255) tAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGcgacg > 2:3662440/1‑91 (MQ=255) aGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATGTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGcgacga < 1:3630422/91‑1 (MQ=255) gaatgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaat < 1:265485/91‑1 (MQ=255) gaatgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATCTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaat > 2:2273457/1‑91 (MQ=255) aatgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACTTCGACGaata > 2:2836045/1‑91 (MQ=255) tgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaataat > 1:829653/1‑91 (MQ=255) tgaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGaataat > 2:2542592/1‑91 (MQ=255) gaatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATc < 2:2839563/91‑1 (MQ=255) aatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCg > 1:138920/1‑91 (MQ=255) aatATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCg < 2:3819798/91‑1 (MQ=255) atatGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGt < 2:93768/91‑1 (MQ=255) atatGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGt < 1:30015/91‑1 (MQ=255) tgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTaaa > 2:2651485‑M2/13‑91 (MQ=255) tgagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTaaa < 1:2825953‑M2/79‑1 (MQ=255) gagtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAAt > 1:69645‑M2/12‑91 (MQ=255) agtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAAtt > 2:2414232‑M2/11‑91 (MQ=255) agtaggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAAtt < 1:466674‑M2/81‑1 (MQ=255) aggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGc < 1:1630953‑M2/84‑1 (MQ=255) aggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGc > 1:2295576‑M2/8‑91 (MQ=255) aggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGc < 1:304316‑M2/84‑1 (MQ=255) ggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGcc < 2:3546405‑M2/85‑1 (MQ=255) ggctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGcc > 2:3073263‑M2/7‑91 (MQ=255) ctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGTCGAATAATCGTAAATTCGCCAt > 2:2856694‑M2/5‑91 (MQ=255) ctctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCAt > 2:2762779‑M2/5‑91 (MQ=255) tctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATc < 2:2954937‑M2/88‑1 (MQ=255) ctAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATACGCCATCa > 2:3514355‑M2/3‑91 (MQ=255) ctAATTTAGTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCAGGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATCa < 2:3391691‑M2/89‑1 (MQ=255) aaTTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATCAAt > 2:2605302/1‑91 (MQ=255) aaTTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATCAAt > 1:2756614/1‑91 (MQ=255) aaTTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATCAAt < 1:526970/91‑1 (MQ=255) aaTTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATCAAt < 2:1307106/91‑1 (MQ=255) | GATAGAGATTTCTTTAGATAATTTACAGACAGAAAAGTACATTAAGAGCCTACTCATTACATTCTTAGGAATGAATATGAGTAGGCTCTAATTTATTTAGCTATGCAATTATATTTATTGATAGTTAACCATGAAGTATTTTTTCTTACCGCGACGAATAATCGTAAATTCGCCATCAAT > USA300TCH1516_ALE/1841940‑1842119 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |