| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2021453 = | 159 (0.780) | 12 (0.070) | 6/140 | NT | 7.1% | intergenic (+12/+248) | queE_2/USA300HOU_RS10190 | 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase/putative acyl‑CoA thioester hydrolase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2021493 = | 174 (0.980) | intergenic (+52/+208) | queE_2/USA300HOU_RS10190 | 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase/putative acyl‑CoA thioester hydrolase | |||||
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
CGTCATATGCACAAACAACCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATA > USA300TCH1516_ALE/2021403‑2021583 | tCATATGCACAAACAACCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATAttt < 2:422245/91‑1 (MQ=255) tCATATGCACAAACAACCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATAttt < 1:1822415/91‑1 (MQ=255) tatGCACAAACAACCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTaa < 1:3359031/91‑1 (MQ=255) atGCACAAACAACCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAAt > 1:2317899/1‑91 (MQ=255) gCACAAACAACCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGc < 1:140061/91‑1 (MQ=255) gCACAAACAACCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGc < 2:2676576/91‑1 (MQ=255) cacaAACAACCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCt < 2:1106407/91‑1 (MQ=255) cacaAACAACCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCt < 1:1144264/91‑1 (MQ=255) acaacCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCtattat > 2:611499/1‑91 (MQ=255) caacCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATtat‑a < 1:2432202/91‑1 (MQ=255) caacCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATtat‑a > 2:2907854/1‑91 (MQ=255) aacCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTat‑aa < 2:2499050/91‑1 (MQ=255) aacCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTat‑aa < 1:1254275/91‑1 (MQ=255) aacCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTat‑aa < 2:3916370/91‑1 (MQ=255) ccACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTGCGCATATTTTAATGCTATTat‑aaaa > 1:3686150/1‑91 (MQ=255) cacaAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTat‑aaaat > 1:2719636/1‑91 (MQ=255) acaAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTat‑aaaata > 1:1133301/1‑91 (MQ=255) caAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTat‑aaaataa < 2:3224969/91‑1 (MQ=255) aaTTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAt‑aaaataaaa > 1:2987752/1‑91 (MQ=255) tataCAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAAc < 2:3721219/91‑1 (MQ=255) tataCAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAAc < 1:2789391/91‑1 (MQ=255) taCAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACaa < 2:1503316/91‑1 (MQ=255) aCAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACaat < 2:3354034/91‑1 (MQ=255) aCAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACATTATCGATAAGTATTCTCAGCATATTTTAATGATATTAT‑AAAATAAAAAACaat > 2:3301061/1‑91 (MQ=255) cAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACaatt < 1:3569675/91‑1 (MQ=255) cAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACaatt < 2:682005/91‑1 (MQ=255) aaTTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACaatta < 2:2556238/91‑1 (MQ=255) aaTTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACaatta < 1:456983/91‑1 (MQ=255) aTTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACaattaa < 1:131210/91‑1 (MQ=255) ttttAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACaattaat < 1:1009772/91‑1 (MQ=255) tttAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACaattaatt > 2:2445862/1‑91 (MQ=255) ttAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTg < 2:1950888/91‑1 (MQ=255) aaaaCTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATTGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAATAACAATTAATTGCTg < 1:3373568/91‑1 (MQ=255) aaaCTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTgg < 1:388370/91‑1 (MQ=255) aaaCTCGTAGGTATGATGAGAAGCACATTATCAATAAGTAGTCTCCGGATATTTTAATGATATAAT‑AAAAAAAAAAACAATTAATTGCTgg < 2:201091/91‑1 (MQ=255) aaCTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGc > 2:1660299/1‑91 (MQ=255) aaCTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGc < 2:28220/91‑1 (MQ=255) aaCTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGc > 1:170987/1‑91 (MQ=255) aaCTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGc > 1:937164/1‑91 (MQ=255) aCTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTACGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCa < 2:2636826/91‑1 (MQ=255) ctctTAATTATGCGGAGAAGCAGTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATGTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAg < 2:3000322/91‑1 (MQ=255) ctctTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAg > 2:470340/1‑91 (MQ=255) ctctTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTACGCATATTTTAATGCTAGTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAg > 1:1349193/1‑91 (MQ=255) tctTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGt < 2:812826/91‑1 (MQ=255) tctTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGt < 1:1939667/91‑1 (MQ=255) ttAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTAc > 2:1941620/1‑91 (MQ=255) tAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTAct < 1:47286/91‑1 (MQ=255) tAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTAct < 1:265857/91‑1 (MQ=255) aaTTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTActc < 1:2002782/91‑1 (MQ=255) aaTTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTActc < 2:1753101/91‑1 (MQ=255) aTTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTActct > 2:3893094/1‑91 (MQ=255) TATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTAc < 2:1403675‑M1/91‑1 (MQ=255) TGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACtt > 2:3410447‑M1/1‑91 (MQ=255) gcggagactacttatcgataaagtgcttctccgcataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTa > 1:2251156‑M2/38‑91 (MQ=255) gcggagactacttatcgataaactgcttctccgcataTTTTACTGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTATACTTa > 2:2559341‑M2/38‑91 (MQ=255) cggagactacttatcgataaagtgcttctccgcataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTaa > 1:783270‑M2/37‑91 (MQ=255) CGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTTTCCGCATATTCTAATGCTATCCT‑AAAATAAAAATCTATTAATTGCTGGCAGTACTATACTTaa < 2:1213965‑M1/91‑1 (MQ=255) CGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTaa < 1:558071‑M1/91‑1 (MQ=255) CGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTaa < 1:3436223‑M1/91‑1 (MQ=255) CGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTaa < 2:1038839‑M1/91‑1 (MQ=255) GGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTaaa > 1:2168135‑M1/1‑91 (MQ=255) AGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAaata < 2:1676116‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCAATTTAAAAATAAGTAGACTACGCATATTTTAATGCTAAAAA‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAaataat > 2:3794461‑M1/1‑91 (MQ=255) aGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAataata > 2:2252455/1‑91 (MQ=255) aGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAataata < 2:2596736/91‑1 (MQ=255) gCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AACATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTCAAAtactaa > 2:3564536/1‑91 (MQ=255) gCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAAtaataa > 1:1152426/1‑91 (MQ=255) gCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAAtaataa > 1:2566015/1‑91 (MQ=255) cACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATaaa > 1:3042507/1‑91 (MQ=255) tttATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAggg < 1:3944607/91‑1 (MQ=255) tttATCGATAAGTAGGGTCCGCATATTTTAATGCTATTATAAAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAgg < 2:3782792/91‑1 (MQ=255) tatcgataaagtgcttctccgcataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAggg > 1:3540505‑M2/26‑91 (MQ=255) ttATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGc > 2:887365/1‑91 (MQ=255) tATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCa > 1:1749644/1‑91 (MQ=255) tCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCAtt < 2:3453112/91‑1 (MQ=255) cGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCAttt > 1:389938/1‑91 (MQ=255) cGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCAttt > 2:240503/1‑91 (MQ=255) gATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTa > 1:1000446/1‑91 (MQ=255) tAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAAt > 2:2526247/1‑91 (MQ=255) aaGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATa < 2:2432549/91‑1 (MQ=255) aaGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACATAAATAATAAAGGGCATTTAAtt > 2:3938232/1‑90 (MQ=255) gtagtCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAgg < 1:2877134/91‑1 (MQ=255) tagtCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGa < 1:905548/91‑1 (MQ=255) gtCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACt < 1:3598050/91‑1 (MQ=255) gtCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACt > 1:3311452/1‑91 (MQ=255) tctccgcataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTa > 1:1233250‑M2/11‑91 (MQ=255) tctccgcataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTa > 2:2228399‑M2/11‑91 (MQ=255) tctccgcataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTa > 2:2224707‑M2/11‑91 (MQ=255) ctccgcataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTaa > 2:3097953‑M2/10‑91 (MQ=255) ctccgcataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCGGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAggacaaa < 2:585205‑M2/82‑4 (MQ=255) tccgcataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAAt > 2:1391937‑M2/9‑91 (MQ=255) tccgcataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAAt < 2:2755452‑M2/83‑1 (MQ=255) gcataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGt > 2:1159195‑M2/6‑91 (MQ=255) cataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTc > 2:3628535‑M2/5‑91 (MQ=255) cataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTc > 2:780015‑M2/5‑91 (MQ=255) ataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCt < 2:1323257‑M2/88‑1 (MQ=255) ataTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCt < 2:741815‑M2/88‑1 (MQ=255) aTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCtat > 2:339407‑M2/2‑91 (MQ=255) aTTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCtat < 2:1800542‑M2/90‑1 (MQ=255) ttttAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCtata < 2:3071474/91‑1 (MQ=255) | CGTCATATGCACAAACAACCACAAATTATACAATTTTAAAAACTCTTAATTATGCGGAGAAGCACTTTATCGATAAGTAGTCTCCGCATATTTTAATGCTATTAT‑AAAATAAAAAACAATTAATTGCTGGCAGTACTCTACTTAAATAATAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATA > USA300TCH1516_ALE/2021403‑2021583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |