New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2082639 = | 204 (1.000) | 29 (0.150) | 12/148 | NT | 12.8% | intergenic (+280/+44) | aspC/USA300HOU_RS10520 | Aspartate aminotransferase/65 kDa membrane protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 2082667 = | 207 (1.100) | intergenic (+308/+16) | aspC/USA300HOU_RS10520 | Aspartate aminotransferase/65 kDa membrane protein |
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
AATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTT > USA300TCH1516_ALE/2082577‑2082757 | taaagcaactgacattaaaaaggtagatattgaacttaaattctaatctttaattttataatAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCtta > 2:722228‑M1/63‑91 (MQ=255) tttATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCttatt > 2:186788/1‑91 (MQ=255) ttATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCttatta > 2:3235087/1‑91 (MQ=255) tatataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTtattat > 1:1187443/1‑91 (MQ=255) tatataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTtattat < 1:21114/91‑1 (MQ=255) tatataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTtattat < 2:1141971/91‑1 (MQ=255) tatataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTtattat > 1:554885/1‑91 (MQ=255) tatataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTtattat < 1:77127/91‑1 (MQ=255) atataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAATTGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATtata < 1:2345310/91‑1 (MQ=255) atataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGCTTGTGAGATGCCTTATtata > 2:2867760/1‑91 (MQ=255) atataACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATtata > 1:2973047/1‑91 (MQ=255) actgacattaaaaaggtagatattgaacttaaattctaatctttaattttataataaggcatctcacaatcgtggggtgccttATTATaaa > 2:1115584‑M2/84‑91 (MQ=255) aCTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAAtt > 2:2620126/1‑91 (MQ=255) aCTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAAtt > 1:3196337/1‑91 (MQ=255) cTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTa > 1:3078339/1‑91 (MQ=255) tttGGCACATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTaaa < 1:1971862/91‑1 (MQ=255) ttGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAg < 2:3943201/91‑1 (MQ=255) ttGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAg < 2:1258345/91‑1 (MQ=255) tGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGa < 2:1467525/91‑1 (MQ=255) tGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACAGCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCGTATTATAAAATTAAAGa < 2:1905756/91‑1 (MQ=255) ggCAAAAAACTTCCAACCATCACGCTTCGCACCGCTACAGAAGTAAAAGGCGCCCAACGATGGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGAt < 2:1705818/91‑1 (MQ=255) gCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGAtt > 1:3449312/1‑91 (MQ=255) gCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGAtt < 1:2773516/91‑1 (MQ=255) cAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACGCCACGATTGTGAGATCCCTTCTTATAAAATTAAAGCTTa > 2:828880/1‑91 (MQ=255) aTCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGaa < 1:39357/91‑1 (MQ=255) aTCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGaa > 1:1044739/1‑91 (MQ=255) aTCACTTCAAACAGTCAAGCATCTCATCTCTACAGATGTAAGAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTTTAAAATTAAAGATTAGaa < 2:776639/91‑1 (MQ=255) cACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACTAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAAtt < 2:3454476/91‑1 (MQ=255) cACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAAtt < 2:2781009/91‑1 (MQ=255) aCTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAAttt < 1:128817/91‑1 (MQ=255) cTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTa > 2:1677462/1‑91 (MQ=255) cTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTa > 2:600847/1‑91 (MQ=255) ttCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTaa > 2:11946/1‑91 (MQ=255) tCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAg > 1:2199649/1‑91 (MQ=255) cAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGt < 2:2666943/91‑1 (MQ=255) tCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAatat < 2:3045991/91‑1 (MQ=255) cAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATc > 1:3291037/1‑91 (MQ=255) aaGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCt > 1:1356001/1‑91 (MQ=255) aGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTa < 1:522294/91‑1 (MQ=255) aGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTa < 2:1948738/91‑1 (MQ=255) aGCATCACATCACTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTa < 1:3582709/91‑1 (MQ=255) gCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTAc < 1:1635414/91‑1 (MQ=255) cATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTAcc > 1:2496732/1‑91 (MQ=255) tCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCtt > 2:1758416/1‑91 (MQ=255) ctctACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAAt < 1:366307/91‑1 (MQ=255) tctACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATg < 2:2441105/91‑1 (MQ=255) tctACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATg < 2:373136/91‑1 (MQ=255) aCAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCa < 1:2242431/91‑1 (MQ=255) aCAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCa > 2:1026654/1‑91 (MQ=255) cAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAg < 1:2985163/91‑1 (MQ=255) tttataatAAGGCATCTCACAATCGTGGGGTGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGt < 1:2808714‑M1/83‑1 (MQ=255) aaaTGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGt < 2:432379/91‑1 (MQ=255) aaaTGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGt < 1:2551950/91‑1 (MQ=255) tGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGc < 1:1077930/91‑1 (MQ=255) tGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGc > 1:810959/1‑91 (MQ=255) ataatAAGGCATCTCACAATCGTGGGGTGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGc < 1:1615465‑M1/86‑1 (MQ=255) gTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCt < 2:855653/91‑1 (MQ=255) gTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCt > 2:672801/1‑91 (MQ=255) gTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCt > 1:2904148/1‑91 (MQ=255) gTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCt > 2:272624/1‑91 (MQ=255) aaggcatctcacaatcgtggggtgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTaa > 2:540515‑M2/29‑91 (MQ=255) AAGGCATCTCACAATCGTGGGGTGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTaa < 1:1980643‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTaa < 2:227881‑M1/91‑1 (MQ=255) AGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAACGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTaaa < 2:3249547‑M1/91‑1 (MQ=255) AGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTaaa < 1:1425475‑M1/91‑1 (MQ=255) AGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTaaa > 2:2947050‑M1/1‑91 (MQ=255) GGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAAt < 2:2105012‑M1/91‑1 (MQ=255) catctcacaatcgtggggtgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATAc > 2:3369919‑M2/25‑91 (MQ=255) CACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATAc > 1:3632275‑M1/1‑91 (MQ=255) ccccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATActc < 2:2527327/91‑1 (MQ=255) ccccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATActc > 1:3888183/1‑91 (MQ=255) ccccACGATTGTGAGATGCCTTATCATAAAATTAAAGATTAGAATTTCAGTTCAATATCTACCTTTCTAATGTCCGTTGCTTTAAATAccc > 2:3652478/1‑89 (MQ=255) cccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATActct < 1:493819/91‑1 (MQ=255) cccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATActct < 1:9461/91‑1 (MQ=255) cccACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATActct > 2:3319358/1‑91 (MQ=255) cccACGACTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATActct < 2:3530605/91‑1 (MQ=255) acaatcgtggggtgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTc > 2:3897654‑M2/19‑91 (MQ=255) acaatcgtggggtgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAACGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTc > 2:3683051‑M2/19‑91 (MQ=255) caatcgtggggtgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCa > 2:487021‑M2/18‑91 (MQ=255) cGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCa > 1:2049648/1‑91 (MQ=255) gATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCAt < 1:2140937/91‑1 (MQ=255) gATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCAt < 1:3141708/91‑1 (MQ=255) aatcgtggggtgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCAt > 1:3767835‑M2/17‑91 (MQ=255) aatcgtggggtgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTATTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCAt > 1:3361009‑M2/17‑91 (MQ=255) ttGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCt > 1:6520/1‑91 (MQ=255) tgtgAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCtt > 2:3100046/1‑91 (MQ=255) gtgAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCTATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCttt > 2:92704/1‑91 (MQ=255) gtgAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCttt > 1:2703187/1‑91 (MQ=255) gtgAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCttt > 2:849467/1‑91 (MQ=255) gagaTGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTtat > 1:1904792/1‑91 (MQ=255) gagaTGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTtat < 1:1847319/91‑1 (MQ=255) gagaTGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTtat > 2:3396803/1‑91 (MQ=255) tgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTc < 2:851014‑M2/85‑1 (MQ=255) tgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTc < 2:1145165‑M2/85‑1 (MQ=255) tgccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTc < 2:1372444‑M2/85‑1 (MQ=255) gccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCa > 2:2600047‑M2/6‑91 (MQ=255) ccttATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAg < 1:853473‑M2/87‑1 (MQ=255) tATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGttt < 2:3818179‑M2/90‑1 (MQ=255) tATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGttt > 1:1235968‑M2/2‑91 (MQ=255) attatAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGtttt < 1:1664596/91‑1 (MQ=255) | AATTTATATAACTTTTGGCAAATCACTTCAAACATTCAAGCATCACATCTCTACAAATGTAAAAGGCACCCCACGATTGTGAGATGCCTTATTATAAAATTAAAGATTAGAATTTAAGTTCAATATCTACCTTTTTAATGTCAGTTGCTTTAAATACTCTTTCATCTTTATACTCAGTTTT > USA300TCH1516_ALE/2082577‑2082757 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |