| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2236031 | 141 (0.690) | 10 (0.060) | 6/142 | NT | 7.1% | intergenic (‑304/+43) | tdk/rpmE2 | Thymidine kinase/50S ribosomal protein L31 type B |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2236051 | 138 (0.760) | intergenic (‑324/+23) | tdk/rpmE2 | Thymidine kinase/50S ribosomal protein L31 type B | |||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TATTGAGTCACTTCTTTGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCGCAGCAGCGAATT > USA300TCH1516_ALE/2235961‑2236141 | tATTGAGTCACTTCTTTGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGc < 1:273815/91‑1 (MQ=255) cgtgtggaacgtttcaacaaaaagtttggtcttaaatcaaacaactaatatagtaatcgttAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCa > 1:1124554‑M1/62‑91 (MQ=255) cgtgtggaacgtttcaacaaaaagtttggtcttaaatcaaacaactaatatagtaatcgttAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCa > 1:2055836‑M1/62‑91 (MQ=255) cgggtggaacgattcaacaaaaagtttggtcttaaatcaaacaactaatatagtaatcgttAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCa > 2:566793‑M1/62‑91 (MQ=255) gtgtggaacgtttcaacaaaaagtttggtcttaaatcaaacaactaatatagtaatcgttAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAg > 1:247038‑M1/61‑91 (MQ=255) tGAGTCACTTCTTTGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCaga > 2:159568‑M2/1‑88 (MQ=255) gAGTCACTTCTTTGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCagac < 1:151194‑M2/91‑5 (MQ=255) gTCACTTCTTTGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCagacag > 1:2652153‑M2/1‑85 (MQ=255) cACTTCTTTGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCagacagct > 1:878049‑M2/1‑83 (MQ=255) cACTTCTTTGAACAAAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACATTTCCATTATAGGATGCagacagct > 1:1608137‑M2/1‑83 (MQ=255) aCTTCTTTGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCagacagctt < 1:980609‑M2/91‑10 (MQ=255) tttGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGa < 2:697591/91‑1 (MQ=255) ttGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGAt > 1:2846833/1‑91 (MQ=255) ttGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGAt > 1:715320/1‑91 (MQ=255) tGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGAtt < 1:1885914/91‑1 (MQ=255) aaCACTGTCGTAAGTATATACCATTACTACGCTTATGAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTAc < 2:3196284/91‑1 (MQ=255) aaCACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTAc > 1:3897523/1‑91 (MQ=255) aaCACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTAc > 1:2887948/1‑91 (MQ=255) aaCACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTAc > 1:2084413/1‑91 (MQ=255) acacAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACt < 1:804522/91‑1 (MQ=255) cacaGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCagacagcttttttatttata < 1:925353‑M2/91‑21 (MQ=255) cacaGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACta > 2:1040646/1‑91 (MQ=255) acaGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACtat < 2:341263/91‑1 (MQ=255) acaGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACtat < 2:813932/91‑1 (MQ=255) caGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACtata > 2:234671/1‑91 (MQ=255) caGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACtata < 2:2004082/91‑1 (MQ=255) gTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATAtt > 2:687691/1‑91 (MQ=255) tCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTa > 2:344084/1‑91 (MQ=255) tCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTa < 1:190842/91‑1 (MQ=255) cGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAg > 1:3837830/1‑91 (MQ=255) cGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAg > 2:261520/1‑91 (MQ=255) cGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAg < 2:2404565/91‑1 (MQ=255) gTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAgt > 2:1093167/1‑91 (MQ=255) gTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAgt < 1:889358/91‑1 (MQ=255) gTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAgt < 2:788169/91‑1 (MQ=255) tAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAgtt > 1:1447297/1‑91 (MQ=255) aaaGTATATAACCTTACTACGCTTATAAATAGAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCGTAACGATTACTATATTAgtt < 2:890708/90‑1 (MQ=255) aGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAgttgt > 1:1787936/1‑91 (MQ=255) aGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAgttgt > 2:338010/1‑91 (MQ=255) atataCCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGATTAACGATTACTATATTAGTTGTTTg < 2:2251455/91‑1 (MQ=255) tataCCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGa < 2:2905037/91‑1 (MQ=255) taCCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGAtt > 2:929941/1‑91 (MQ=255) aCCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGAttt > 2:2682370/1‑91 (MQ=255) ccTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTaa > 2:581789/1‑91 (MQ=255) ttACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGa > 2:61832/1‑91 (MQ=255) actactGTTATAACTAAAGAAGCTGTCTACAATTCCATGATAGTATGCAGACAGCTTAACGCTTACTCTATGAGTTGTTTGATTTAAGAcc < 2:2465029/91‑1 (MQ=255) actacGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGTTGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGAcc > 2:895977/1‑91 (MQ=255) ctacGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCa < 1:1014050/91‑1 (MQ=255) ctacGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCa > 2:142386/1‑91 (MQ=255) tacGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCaa < 2:536382/91‑1 (MQ=255) acGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCaaa < 1:3657843/91‑1 (MQ=255) acGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCaaa < 1:618043/91‑1 (MQ=255) acGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCaaa < 2:1207954/91‑1 (MQ=255) cGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAAc > 1:1336682/1‑91 (MQ=255) cGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAAc > 1:1336821/1‑91 (MQ=255) gCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACt > 1:1296504/1‑91 (MQ=255) ttATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACttt > 2:1198666/1‑91 (MQ=255) tataAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACtttt > 1:3631063/1‑91 (MQ=255) ataaataaAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACttttt > 2:2813455/1‑91 (MQ=255) aaataaaAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTttgt > 1:2285996/1‑91 (MQ=255) aaataaaAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTttgt > 1:3596741/1‑91 (MQ=255) aataaaAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTttgtt < 1:673624/91‑1 (MQ=255) aataaaAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTttgtt > 1:238725/1‑91 (MQ=255) ataaaAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTttgttg < 2:1283297/91‑1 (MQ=255) taaaAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGa < 1:2359339/91‑1 (MQ=255) taaaAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGAGGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGa < 1:318704/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCagacagcttttttatttataagcgtagtaagggtatatacttacgactgtgttcaaag < 1:3473612‑M2/91‑59 (MQ=255) aaaaaGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGaaa > 1:2754675/1‑91 (MQ=255) aaaaaGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGaaa > 1:486418/1‑91 (MQ=255) aaaGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTACCGATTACTATATTAGTTGTTTGATTCAAGCCCAAACTTTTTGTTGAAACg > 2:1545018/1‑91 (MQ=255) AAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGt > 1:421956‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGt > 1:3769448‑M1/1‑91 (MQ=255) GCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTc < 1:1204792‑M1/91‑1 (MQ=255) CTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTcc > 1:2575311‑M1/1‑91 (MQ=255) CTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTcc > 1:427096‑M1/1‑91 (MQ=255) tGTCTACAATTCCATTATAGGATGCagacagcttttttatttataagcgtagtaagggtatatacttacgactgtgttcaaagaagtgact < 1:2266118‑M2/91‑67 (MQ=255) TGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCca > 2:1352577‑M1/1‑91 (MQ=255) TGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCca < 2:3946045‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCca < 1:1992396‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCca < 1:1455235‑M1/91‑1 (MQ=255) TCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCcaca > 2:3077265‑M1/1‑91 (MQ=255) cTACAATTCCATTATAGGATGCagacagcttttttatttataagcgtagtaagggtatatacttacgactgtgttcaaagaagtgactcaa < 1:1102762‑M2/91‑70 (MQ=255) cTACAATTCCATTATAGGATGCagacagcttttttatttataagcgtagtaagggtatatacttacgactgtgttcaaagaagtgactcaa < 1:1739740‑M2/91‑70 (MQ=255) TACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACg > 1:1559581‑M1/1‑91 (MQ=255) TACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACg > 1:3062829‑M1/1‑91 (MQ=255) cAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTc < 1:3711684/91‑1 (MQ=255) tataGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCgcag < 1:829397/91‑1 (MQ=255) ataGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCgcagc > 2:1984559/1‑91 (MQ=255) taGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCgcagca > 1:2146269/1‑91 (MQ=255) taGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCgcagca < 1:684111/91‑1 (MQ=255) aGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCGcagcag < 1:1712477/91‑1 (MQ=255) aGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCGcagcag < 2:350546/91‑1 (MQ=255) aGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCGcagcag > 2:1686706/1‑91 (MQ=255) aGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCGcagcag < 2:229356/91‑1 (MQ=255) ggATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCGCagcagc < 2:2158372/91‑1 (MQ=255) aTGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTTAAACGTTCCACACGTCCATCCGCAGAAGCGa > 2:3653554/1‑91 (MQ=255) aTGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCGCAGCAGCGa > 2:1658941/1‑91 (MQ=255) aTGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCGCAGCAGCGa > 2:1144744/1‑91 (MQ=255) tGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCGCAGCAGCGaa < 2:3148118/91‑1 (MQ=255) cAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCGCAGCAGCGAAtt > 1:1384249/1‑91 (MQ=255) | TATTGAGTCACTTCTTTGAACACAGTCGTAAGTATATACCCTTACTACGCTTATAAATAAAAAAGCTGTCTACAATTCCATTATAGGATGCAGACAGCTTAACGATTACTATATTAGTTGTTTGATTTAAGACCAAACTTTTTGTTGAAACGTTCCACACGTCCATCCGCAGCAGCGAATT > USA300TCH1516_ALE/2235961‑2236141 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |