| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2263788 = | 241 (1.180) | 24 (0.150) | 10/130 | NT | 11.5% | intergenic (+8/‑258) | czcD_2/USA300HOU_RS11590 | Cadmium, cobalt and zinc/H(+)‑K(+) antiporter/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2263834 = | 174 (1.050) | intergenic (+54/‑212) | czcD_2/USA300HOU_RS11590 | Cadmium, cobalt and zinc/H(+)‑K(+) antiporter/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
TAACCATCATGCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGTCATATTT > USA300TCH1516_ALE/2263744‑2263924 | aCCATCATGCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGttttt > 2:657603/1‑91 (MQ=255) ccATCATGCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCCGTAGGtttttt > 2:400609/1‑91 (MQ=255) ccATCATGCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGtttttt < 2:3377143/91‑1 (MQ=255) tcatGCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATg > 1:3486288/1‑91 (MQ=255) catGCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATgc > 1:1004608/1‑90 (MQ=255) catGCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGt < 1:872121/91‑1 (MQ=255) atGCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTc > 1:3426049/1‑91 (MQ=255) atGCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTc > 2:2785843/1‑91 (MQ=255) atGCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTc > 2:1656693/1‑91 (MQ=255) gCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCtt < 1:2663940/91‑1 (MQ=255) gCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCtt < 1:3652036/91‑1 (MQ=255) tcatcatcaCGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTa > 2:2914785/1‑91 (MQ=255) tcatcatcaCGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTa < 2:161409/91‑1 (MQ=255) catcatcaCGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTAt > 1:407801/1‑91 (MQ=255) catcatcaCGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTAt > 2:741074/1‑91 (MQ=255) atcatcaCGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATg > 1:3506747/1‑91 (MQ=255) atcatcaCGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATAGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATg > 2:1857564/1‑91 (MQ=255) catcaCGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGc < 1:1057526/91‑1 (MQ=255) aCGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACt < 2:94698/91‑1 (MQ=255) aCGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACt > 2:3120788/1‑91 (MQ=255) aCGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACt < 1:1556093/91‑1 (MQ=255) cgcgCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACtt < 2:1826386/91‑1 (MQ=255) gcgcATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTg < 1:3136024/91‑1 (MQ=255) cgcATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCTTTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTGTTTATGGCGACTTGt < 1:3366147/91‑1 (MQ=255) cgcATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGt < 2:576808/91‑1 (MQ=255) cgcATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGt > 1:2312364/1‑91 (MQ=255) cgcATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGt > 1:1746122/1‑91 (MQ=255) cgcATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGt > 1:1418086/1‑91 (MQ=255) cgcATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGt < 2:35624/91‑1 (MQ=255) gcATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGtt < 2:3312613/91‑1 (MQ=255) gcATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGtt < 2:1099698/91‑1 (MQ=255) aTGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTg < 1:3914042/91‑1 (MQ=255) gTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGt < 1:3554622/91‑1 (MQ=255) tACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTc < 1:197398/91‑1 (MQ=255) tACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTc > 1:3320238/1‑91 (MQ=255) cATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGCCTTGTTTGGTCtt > 2:1325647/1‑91 (MQ=255) aTTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCttt < 2:2045151/91‑1 (MQ=255) taataaTTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTtga < 2:3749479/91‑1 (MQ=255) taataaTTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTtga < 1:609424/91‑1 (MQ=255) aataatTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTtgat > 1:1943557/1‑91 (MQ=255) taatTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTTTGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTtgatga > 2:1003522/1‑91 (MQ=255) taatTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTtgatga < 2:1384142/91‑1 (MQ=255) taatTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTtgatga > 1:437908/1‑91 (MQ=255) aatTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTgatgat < 1:1109400/91‑1 (MQ=255) aatTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTgatgat < 2:2714044/91‑1 (MQ=255) atTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTACACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCCTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGatgatg > 1:919712/1‑91 (MQ=255) atTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGatgatg > 2:848302/1‑91 (MQ=255) ttttAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGc < 2:1051482/91‑1 (MQ=255) tttAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCa < 2:466898/91‑1 (MQ=255) tttAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCa > 1:3358078/1‑91 (MQ=255) tttAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCa < 1:3000086/91‑1 (MQ=255) tttAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCa < 2:3271840/91‑1 (MQ=255) tttAACCTACTGATATTGCATAGATTAAATTTTTCAATGGAAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGTGAATTGTTTGGTCTTTGatgatgaa > 2:2560363/1‑89 (MQ=255) ttAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCaa > 2:777600/1‑91 (MQ=255) ttAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCaa > 2:588236/1‑91 (MQ=255) CCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGtt < 1:1457225‑M1/91‑1 (MQ=255) ctactgccattgaaaagtttaatcgatgcaatggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGttt > 1:2172766‑M2/44‑91 (MQ=255) tgccattgaaaagtttaatcgatgcaatggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTttatta > 2:1524200‑M2/40‑91 (MQ=255) CCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAAc > 1:1293977‑M1/1‑91 (MQ=255) tgaaaagtttaatcgatgcaatggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAAt > 2:3042274‑M2/34‑91 (MQ=255) gaaaagtttaatcgatgcaatggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAAtt > 1:3066671‑M2/33‑91 (MQ=255) aaaagtttaatcgatgcaatggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAAttt > 1:472428‑M2/32‑91 (MQ=255) aaagtttaatcgatgcaatggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAAtttt > 1:428319‑M2/31‑91 (MQ=255) aagtttaatcgatgcaatggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTc > 1:2497480‑M2/30‑91 (MQ=255) aagtttaatcgatgcaatggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTc > 1:2497045‑M2/30‑91 (MQ=255) cGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCa > 1:1661486/1‑91 (MQ=255) gATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTTTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCaa > 2:93205/1‑91 (MQ=255) aTTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAAc < 1:3823959/91‑1 (MQ=255) aTTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAAc < 1:1872825/91‑1 (MQ=255) aTTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGCCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAAc < 2:3483898/91‑1 (MQ=255) tAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACta < 1:2668097/91‑1 (MQ=255) aaaCTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACtat < 2:698517/91‑1 (MQ=255) aaaCTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACtat > 1:2391709/1‑91 (MQ=255) aaCTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACtatt > 2:2341155/1‑91 (MQ=255) ttttCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTattatt < 1:1493907/91‑1 (MQ=255) tCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCt < 2:2451577/91‑1 (MQ=255) tCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCt < 2:1155976/91‑1 (MQ=255) caatggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCtt > 2:2150685‑M2/16‑91 (MQ=255) atggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTAc > 2:2255035‑M2/14‑91 (MQ=255) atggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTCTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTAc > 1:3333619‑M2/14‑91 (MQ=255) ggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACAt > 2:1970905‑M2/12‑91 (MQ=255) ggcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACAt > 2:2740518‑M2/12‑91 (MQ=255) gcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACAtt > 1:289303‑M2/11‑91 (MQ=255) gcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACAtt > 1:2043312‑M2/11‑91 (MQ=255) gcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACAtt > 1:3192217‑M2/11‑91 (MQ=255) gcagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACAtt > 2:3806965‑M2/11‑91 (MQ=255) cagtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTa < 1:386330‑M2/82‑1 (MQ=255) agtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAg > 1:1240091‑M2/9‑91 (MQ=255) gtaggttTTTTATGTTTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGt > 1:3379230‑M2/8‑91 (MQ=255) gtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGt > 2:3619172‑M2/8‑91 (MQ=255) gtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGt < 2:2799531‑M2/84‑1 (MQ=255) gtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGt < 2:2105109‑M2/84‑1 (MQ=255) gtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGt < 2:196582‑M2/84‑1 (MQ=255) gtaggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGt < 1:3728587‑M2/84‑1 (MQ=255) taggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGTc > 1:2128441‑M2/7‑91 (MQ=255) aggttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGTCa > 2:3775641‑M2/6‑91 (MQ=255) gttTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGTCata > 1:1399917‑M2/4‑91 (MQ=255) ttttATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGTCATAttt > 2:3839297/1‑91 (MQ=255) ttttATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGTCATAttt < 2:1442554/91‑1 (MQ=255) ttttATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGTCATAttt > 1:242268/1‑91 (MQ=255) | TAACCATCATGCTCATCATCACGCGCATGTACATTAATAATTTTAACCTACTGCCATTGCATCGATTAAACTTTTCAATGGCAGTAGGTTTTTTATGTCTTTATGGCGACTTGTTTGGTCTTTGATGATGCAATGTTTATTAACAAATTTTCAACTATTATTTCTTACATTAGTCATATTT > USA300TCH1516_ALE/2263744‑2263924 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |