New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2483085 = | 206 (1.010) | 29 (0.170) | 16/136 | NT | 15.4% | intergenic (+5/‑158) | hssS/USA300HOU_RS12790 | Heme sensor protein HssS/putative HTH‑type transcriptional regulator |
? | USA300TCH1516_ALE | 2483126 = | 143 (0.830) | intergenic (+46/‑117) | hssS/USA300HOU_RS12790 | Heme sensor protein HssS/putative HTH‑type transcriptional regulator |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
TATGTAACCACCTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATGGTTT > USA300TCH1516_ALE/2483036‑2483216 | tATGTAACCACCTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTAt > 2:1976246/1‑91 (MQ=255) tATGTAACCACCTTTACTATTACACTACCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTAt > 2:2242523/1‑91 (MQ=255) aTGTAACCACCTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATc < 2:1404993/91‑1 (MQ=255) tGTAACCACCTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCt > 1:2266221/1‑91 (MQ=255) tGTAACCACCTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCt > 1:1280797/1‑91 (MQ=255) tAACCACCTTTACTATTACACTGCCGTATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCttt < 2:3420859/91‑1 (MQ=255) tAACCACCTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCttt < 1:1278136/91‑1 (MQ=255) accaccTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTta > 2:2215148/1‑91 (MQ=255) accaccTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTta > 1:3115119/1‑91 (MQ=255) ccaccTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGACAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTtat > 2:2523032/1‑91 (MQ=255) ccTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATAtt < 1:2905894/91‑1 (MQ=255) ccTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCCCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATAtt > 2:3059179/1‑91 (MQ=255) tttACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGa < 2:1355699/91‑1 (MQ=255) tttACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGa > 2:2906837/1‑91 (MQ=255) ttACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGAt > 1:2024530/1‑91 (MQ=255) ttACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGAt > 2:1051589/1‑91 (MQ=255) ttACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGAt > 1:2346284/1‑91 (MQ=255) tACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGAtt > 2:206958/1‑91 (MQ=255) tACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGAtt > 1:1799764/1‑91 (MQ=255) tACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGAtt < 2:1452935/91‑1 (MQ=255) tACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGAtt > 2:638180/1‑91 (MQ=255) tACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGAtt > 1:3868602/1‑91 (MQ=255) aCTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGCTTa > 2:1622111/1‑91 (MQ=255) aCTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTa > 1:464125/1‑91 (MQ=255) aCTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTa > 1:1530638/1‑91 (MQ=255) aCTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTa > 2:3181791/1‑91 (MQ=255) cTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAg < 1:2379036/91‑1 (MQ=255) tATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAgc > 1:2042113/1‑91 (MQ=255) tATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAgc > 1:3398555/1‑91 (MQ=255) tATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAgc < 2:1729894/91‑1 (MQ=255) gCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAg > 2:1814750/1‑91 (MQ=255) cAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGcc < 1:568052/91‑1 (MQ=255) aaaTAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCa < 2:1125069/91‑1 (MQ=255) aaaTAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCa < 1:124521/91‑1 (MQ=255) aatTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTa < 2:1766898/91‑1 (MQ=255) aagtCACTTTAAGCTCGAGCGCCTGAATGAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTATCCACTTa < 2:2742805/88‑1 (MQ=255) ttCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAAc < 2:90590/91‑1 (MQ=255) aatataaaagatacctcctgaaataaaaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACAtt > 1:3187353‑M2/53‑91 (MQ=255) aCTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACAtt < 1:3040470/91‑1 (MQ=255) aaTCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAAtt < 2:2286354/91‑1 (MQ=255) aaTCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAAtt < 2:3444753/91‑1 (MQ=255) aaTCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTACCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAAtt < 2:321696/91‑1 (MQ=255) aTCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAAttt > 1:494854/1‑91 (MQ=255) aTCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAAttt < 1:1165802/91‑1 (MQ=255) tctACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTa < 2:3609966/91‑1 (MQ=255) tctACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTa > 2:3799649/1‑91 (MQ=255) ctACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTAc > 2:288019/1‑91 (MQ=255) TACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTAcc < 1:3523029‑M1/91‑1 (MQ=255) aCTCCTAAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCAt > 2:474063‑M1/2‑91 (MQ=255) ctcctgaaataaaaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCAtt > 2:3321022‑M2/39‑91 (MQ=255) CTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaa < 2:1211731‑M1/91‑1 (MQ=255) tgaaataaaaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaac > 1:1831331‑M2/35‑91 (MQ=255) tgaaataaaaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaac > 1:1213034‑M2/35‑91 (MQ=255) TGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTCGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaac < 2:3467319‑M1/91‑1 (MQ=255) TGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaac > 1:3001528‑M1/1‑91 (MQ=255) TGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaac < 2:2674580‑M1/91‑1 (MQ=255) TGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaac < 1:2970249‑M1/91‑1 (MQ=255) TGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCCAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaac < 1:3354401‑M1/91‑1 (MQ=255) gaaataaaaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaaca > 1:1752559‑M2/34‑91 (MQ=255) AAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaacaa > 1:1417899‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaacaa > 2:1152071‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACaaa < 1:704888‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACaaa < 1:1343759‑M1/91‑1 (MQ=255) ataaaaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACaaaa > 1:1908616‑M2/31‑91 (MQ=255) taaaaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAAt > 1:3723861‑M2/30‑91 (MQ=255) aaaaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAAtt > 2:2762384‑M2/29‑91 (MQ=255) aaCATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAAtt > 1:3461393/1‑91 (MQ=255) aaCATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAAtt > 1:456111/1‑91 (MQ=255) aaCATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAAtt > 2:259029/1‑91 (MQ=255) aCATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAAttt < 1:628174/91‑1 (MQ=255) aCATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAAttt > 2:301504/1‑91 (MQ=255) cATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTa > 2:1517557/1‑91 (MQ=255) cATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTa > 1:1613621/1‑91 (MQ=255) cATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCCTTCTAGCCTCTTAACATTTGATCTCTACCATTCAACAAAATTTa > 2:819168/1‑91 (MQ=255) aaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTCTTACATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTCCCACTCAACAAAATTTa > 2:23802‑M2/27‑91 (MQ=255) aacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTaa > 2:3363762‑M2/26‑91 (MQ=255) aTTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTaa > 1:518319/1‑91 (MQ=255) tttCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTaaa < 2:1633642/91‑1 (MQ=255) ttCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAat > 2:1972854/1‑91 (MQ=255) tCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAata > 1:3776601/1‑91 (MQ=255) cTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTACCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAatat > 1:3332803/1‑91 (MQ=255) tGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAatata > 1:1129536/1‑91 (MQ=255) tttATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGa < 1:670146/91‑1 (MQ=255) ttATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGAt > 1:192327/1‑91 (MQ=255) tATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATg > 1:919139/1‑91 (MQ=255) tttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGt > 1:840410‑M2/13‑91 (MQ=255) tttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGt < 2:121965‑M2/79‑1 (MQ=255) ttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTc < 1:3218331‑M2/80‑1 (MQ=255) tcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCa > 1:2709034‑M2/11‑91 (MQ=255) tcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCa < 2:2687042‑M2/81‑1 (MQ=255) aggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCAtt < 2:2657876‑M2/83‑1 (MQ=255) ggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCAttt > 1:2575475‑M2/8‑91 (MQ=255) ggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCAttt > 1:28498‑M2/8‑91 (MQ=255) ggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCAttt > 1:2217668‑M2/8‑91 (MQ=255) ggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCAttt > 2:45892‑M2/8‑91 (MQ=255) ggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATg > 2:1905601‑M2/5‑91 (MQ=255) ggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATg < 1:1590395‑M2/87‑1 (MQ=255) ggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATg > 2:3096970‑M2/5‑91 (MQ=255) aTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATGGtt > 1:137321‑M2/2‑91 (MQ=255) aTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATGGtt > 1:2051957‑M2/2‑91 (MQ=255) | TATGTAACCACCTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATGGTTT > USA300TCH1516_ALE/2483036‑2483216 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |