| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2588442 | 167 (0.820) | 9 (0.050) | 6/142 | NT | 5.9% | intergenic (+25/+143) | yehR/gltB_2 | putative lipoprotein YehR/Glutamate synthase [NADPH] large chain |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2588473 | 137 (0.760) | intergenic (+56/+112) | yehR/gltB_2 | putative lipoprotein YehR/Glutamate synthase [NADPH] large chain | |||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
GTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCGCTGCTTT > USA300TCH1516_ALE/2588383‑2588563 | gTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCatat > 2:3754954/1‑91 (MQ=255) tttAAAAGAAAGAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATt > 1:3580191‑M2/1‑90 (MQ=255) tttAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATt > 1:2072532‑M2/1‑90 (MQ=255) ttttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTc > 2:402632‑M1/50‑91 (MQ=255) tttatgtaagttgtgtatgctggtcatataagaacttcatatattaaaTCCCTCTGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCt > 2:458530‑M1/49‑91 (MQ=255) aaagaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctga < 2:3848605‑M2/91‑6 (MQ=255) aagaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgag > 2:1108689‑M2/1‑85 (MQ=255) aagaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgag > 1:2354175‑M2/1‑85 (MQ=255) agaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagg < 2:2018965‑M2/91‑8 (MQ=255) aaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggc < 1:2708313‑M2/91‑10 (MQ=255) aaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCt < 1:2005386/91‑1 (MQ=255) aaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCt < 2:186501/91‑1 (MQ=255) gaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTaa > 2:2450724/1‑91 (MQ=255) gaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTaa < 2:863929/91‑1 (MQ=255) tAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACGAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAata < 2:1431009/91‑1 (MQ=255) aaaaTGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAatat > 1:980941/1‑91 (MQ=255) aaaaTGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAatat < 1:263195/91‑1 (MQ=255) aaaTGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATAtt > 1:1471475/1‑91 (MQ=255) aTGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTg < 1:2569024/91‑1 (MQ=255) aTGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTg < 1:1211504/91‑1 (MQ=255) gacgacAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAg > 2:1041990/1‑91 (MQ=255) gacgacAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGATTTAATATTTGAAg > 2:180859/1‑91 (MQ=255) acgacAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGt > 1:3380261/1‑91 (MQ=255) acAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCt > 1:2811327/1‑91 (MQ=255) cAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTTAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCtt > 2:3687873/1‑91 (MQ=255) cAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCtt > 2:3094321/1‑91 (MQ=255) cAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCtt < 2:1737322/91‑1 (MQ=255) aaaTAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtg < 1:1008759/91‑1 (MQ=255) aaaTAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGCTCTtg > 2:2939964/1‑91 (MQ=255) aaTAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgt < 2:2614454/91‑1 (MQ=255) aTAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACGAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgtg < 1:3284858/91‑1 (MQ=255) tAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgtgt > 1:3016273/1‑91 (MQ=255) tttATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGAc > 1:3233060/1‑91 (MQ=255) tttATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGAc > 2:931916/1‑91 (MQ=255) ttATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGGCTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGAcc < 2:1199718/91‑1 (MQ=255) ttATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGAcc < 1:729977/91‑1 (MQ=255) ttATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGAcc > 1:187121/1‑91 (MQ=255) ataACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAg < 1:3706987/91‑1 (MQ=255) ataACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAg > 1:3442239/1‑91 (MQ=255) taACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGc < 2:53624/91‑1 (MQ=255) aaCTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACCAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGTGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCa > 1:3514943/1‑91 (MQ=255) aCTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCAt < 2:2405598/91‑1 (MQ=255) cTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATc < 2:3489278/91‑1 (MQ=255) ttAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATcc < 2:289035/91‑1 (MQ=255) tAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCa > 2:3353467/1‑91 (MQ=255) aaaTGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCacta < 1:3080102/91‑1 (MQ=255) aaaTGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCacta < 2:3238617/91‑1 (MQ=255) aTGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCactact > 2:2212170/1‑91 (MQ=255) tGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCActacta > 2:1285388/1‑91 (MQ=255) gCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatcttttt < 1:2718259‑M2/91‑52 (MQ=255) cccTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatctttttc < 1:1363449‑M2/91‑53 (MQ=255) cccTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatctttttc < 1:42405‑M2/91‑53 (MQ=255) CAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATaa > 2:834365‑M1/1‑91 (MQ=255) CAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATaa > 2:3138245‑M1/1‑91 (MQ=255) CAGACAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATaa < 1:3124703‑M1/91‑1 (MQ=255) GATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATaaaa > 1:2428507‑M1/1‑91 (MQ=255) ATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAAt > 1:1654917‑M1/1‑91 (MQ=255) aaGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatctttttcttttaaacc < 1:1152614‑M2/91‑62 (MQ=255) aaGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatctttttcttttaaacc < 2:1726138‑M2/91‑62 (MQ=255) aaGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAatta > 2:573914/1‑91 (MQ=255) gACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAattatt > 1:2193141/1‑91 (MQ=255) aCTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTAttt > 2:2055843/1‑91 (MQ=255) aCTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTAttt > 2:1527689/1‑91 (MQ=255) cTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTg < 1:858888/91‑1 (MQ=255) aaGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCa > 1:3369705/1‑91 (MQ=255) aGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAg > 1:227587/1‑91 (MQ=255) aGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAg < 1:2406405/91‑1 (MQ=255) ggTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGt > 1:1247423/1‑91 (MQ=255) gTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTa < 2:2783408/91‑1 (MQ=255) ttgtaaCCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAAc > 2:2437634/5‑91 (MQ=255) tgtaaCCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACg > 1:2594325/4‑91 (MQ=255) tgtaaCCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACg > 2:302124/4‑91 (MQ=255) aCAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCAACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACg > 2:2846428/1‑91 (MQ=255) cAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGc < 2:117740/91‑1 (MQ=255) cAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGc < 2:3188653/91‑1 (MQ=255) cAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGc < 2:3229391/91‑1 (MQ=255) aaaCCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCt < 2:731164/91‑1 (MQ=255) aaaCCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCt > 2:3027003/1‑91 (MQ=255) aaaCCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCt < 1:2479200/91‑1 (MQ=255) aCCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTaa > 1:340122/1‑91 (MQ=255) cTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTaaaa > 2:1650543/1‑91 (MQ=255) ttAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGTAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTaaatc < 1:2759873/91‑3 (MQ=255) ttAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAAt < 1:1994094/91‑1 (MQ=255) ttAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAAt > 2:2178351/1‑91 (MQ=255) tAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATc < 2:3524258/91‑1 (MQ=255) tAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATc < 1:562505/91‑1 (MQ=255) tAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATc < 2:2610005/91‑1 (MQ=255) aaTTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATcc > 2:1071691/1‑91 (MQ=255) aaTTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACAACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATcg > 2:3914922/1‑90 (MQ=255) aTTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCg < 1:2864010/91‑1 (MQ=255) ttCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCgc < 2:2351800/91‑1 (MQ=255) ttCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCgc > 2:2635225/1‑91 (MQ=255) tCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCgct < 2:2168579/91‑1 (MQ=255) cATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCgctg > 2:2751137/1‑91 (MQ=255) cATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCgctg > 1:372507/1‑91 (MQ=255) tatTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCgctgct < 2:759032/91‑1 (MQ=255) tatTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCgctgct > 2:1381702/1‑91 (MQ=255) atTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCGCTGCtt < 1:3808880/91‑1 (MQ=255) atTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCGCTGCtt < 1:519269/91‑1 (MQ=255) ttCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCGCTGCttt < 2:1416410/91‑1 (MQ=255) | GTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAATTATTTGCAGTAACGCTAAAATCCGCTGCTTT > USA300TCH1516_ALE/2588383‑2588563 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |