| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2850817 = | 144 (0.710) | 22 (0.130) | 12/132 | NT | 15.7% | intergenic (+16/+103) | pcp/USA300HOU_RS14605 | Pyrrolidone‑carboxylate peptidase/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2850866 = | 117 (0.700) | intergenic (+65/+54) | pcp/USA300HOU_RS14605 | Pyrrolidone‑carboxylate peptidase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
ACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAA > USA300TCH1516_ALE/2850776‑2850955 | acCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTgg < 2:2245216/91‑1 (MQ=255)acCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTgg < 1:1632560/91‑1 (MQ=255) ccTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGga > 2:2198313/1‑91 (MQ=255) ccTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGga > 1:959467/1‑91 (MQ=255) ccTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGga < 2:1452403/91‑1 (MQ=255) ccTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGga > 2:475333/1‑91 (MQ=255) cTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACACAAGCGCCCGAATTTGTGAGTTGAAGTCGAACTTTAGGGTGCTTTTGgat < 2:1233260/91‑1 (MQ=255) cTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGgat > 2:2007366/1‑91 (MQ=255) cTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGgat > 2:3489415/1‑91 (MQ=255) gCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGgatgat > 2:3638432/1‑91 (MQ=255) gCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGgatgat > 1:1863676/1‑91 (MQ=255) cTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTgg > 2:1966275/1‑91 (MQ=255) cTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTgg < 1:3550545/91‑1 (MQ=255) tGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGt < 1:994167/91‑1 (MQ=255) gggCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGta < 2:3815076/91‑1 (MQ=255) gggCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGta < 1:3800717/91‑1 (MQ=255) ggCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGtat < 2:1710488/91‑1 (MQ=255) ggCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGtat > 2:677433/1‑91 (MQ=255) gCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATGTGTTAGTTTAAGTCGAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGtata < 2:703440/91‑1 (MQ=255) caACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAg < 1:1510884/91‑1 (MQ=255) caACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAg > 2:2386379/1‑91 (MQ=255) aaCGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGt > 1:2040894/1‑91 (MQ=255) ggAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGtttt > 2:163765/1‑91 (MQ=255) aaTAGTTATAAGTGCACAAACAAAATCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTAc < 2:3581241/91‑1 (MQ=255) aaTAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTAc < 2:2874900/91‑1 (MQ=255) aaTAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTAc < 1:2883633/91‑1 (MQ=255) aTAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACt > 1:3282743/1‑91 (MQ=255) aTAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACt < 1:746094/91‑1 (MQ=255) tAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACta < 2:717493/91‑1 (MQ=255) gTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACtata > 2:499217/1‑91 (MQ=255) gTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACtata > 2:3023552/1‑91 (MQ=255) tataAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAat < 1:811878/91‑1 (MQ=255) tataAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTATTACTATAat > 2:561958/1‑91 (MQ=255) tataAGAGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGTGTGCTTTTGGATAATTGGGATACAGTTTTACTATAat > 2:2500451/1‑91 (MQ=255) ataAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAATTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatg > 1:3142031/1‑91 (MQ=255) ataAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGCTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatg > 1:1753550/1‑91 (MQ=255) taAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatga > 1:2240275/1‑91 (MQ=255) taAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatga > 1:105554/1‑91 (MQ=255) aaGTGCACAAACAAAAGCGCCCTAATTTGTTGGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgat < 2:1394461/91‑1 (MQ=255) aaGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgat > 1:2830405/1‑91 (MQ=255) aaGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgat < 1:2580068/91‑1 (MQ=255) aaGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgat < 1:1140531/91‑1 (MQ=255) aaGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgat < 1:880886/91‑1 (MQ=255) aGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgatg < 1:3834953/91‑1 (MQ=255) gTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGt < 2:961046/91‑1 (MQ=255) tGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTa < 1:2630344/91‑1 (MQ=255) gCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTCTACTATAATGATGTAt > 2:3780622/1‑91 (MQ=255) caaacaaaAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTAtttt > 2:896082/1‑91 (MQ=255) acaaaAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGc > 2:2059440/1‑91 (MQ=255) CAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTTAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCt > 1:3686031‑M1/1‑91 (MQ=255) CAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCt < 2:77637‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAAc > 2:1276789‑M1/1‑91 (MQ=255) gcaccctaaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACg > 1:1041871‑M2/45‑91 (MQ=255) CACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGa > 1:3719321‑M1/1‑91 (MQ=255) accctaaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGAc > 2:3870548‑M2/43‑91 (MQ=255) accctaaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGAc > 1:1347432‑M2/43‑91 (MQ=255) ccctaaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACa > 2:1087757‑M2/42‑91 (MQ=255) CCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCtaaacaatg > 2:2036791‑M1/1‑87 (MQ=255) CCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACa > 1:1937041‑M1/1‑91 (MQ=255) ctaaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACAtt > 2:2686479‑M2/40‑91 (MQ=255) ctaaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACAtt > 1:2328030‑M2/40‑91 (MQ=255) ctaaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACAtt > 2:147527‑M2/40‑91 (MQ=255) CTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACAtt < 2:2741569‑M1/91‑1 (MQ=255) CTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACAtt < 2:114971‑M1/91‑1 (MQ=255) taaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTg > 1:2341404‑M2/39‑91 (MQ=255) taaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTg > 1:1640206‑M2/39‑91 (MQ=255) TAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTg < 1:3375559‑M1/91‑1 (MQ=255) aaagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGt > 1:498256‑M2/38‑91 (MQ=255) AATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGt > 2:755162‑M1/1‑91 (MQ=255) ttGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTa < 2:3382354/91‑1 (MQ=255) gTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGt > 1:463275/1‑91 (MQ=255) ttAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtc < 1:2956928/91‑1 (MQ=255) ttAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtc > 2:2941316/1‑91 (MQ=255) ttAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATCGTTTAGtc > 2:2790101/1‑91 (MQ=255) tAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtct < 1:27074/91‑1 (MQ=255) tAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtct < 1:2018072/91‑1 (MQ=255) aGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtctt > 1:3637298/1‑91 (MQ=255) gTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtcttc < 1:1009020/91‑1 (MQ=255) gTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtcttc > 2:1750427/1‑91 (MQ=255) tAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCttt < 2:3140756/91‑1 (MQ=255) aaGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCtttt > 1:2359787/1‑91 (MQ=255) gTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCtttttt > 2:3211497/1‑91 (MQ=255) gTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCtttttt > 2:1842091/1‑91 (MQ=255) gTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCtttttt > 2:416233/1‑91 (MQ=255) tCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCttttttt < 1:2874230/91‑1 (MQ=255) tAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTaa > 2:2561652/1‑91 (MQ=255) aaCTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAAc < 2:2786842/91‑1 (MQ=255) tttAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTc < 1:2961805/91‑1 (MQ=255) ttagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTcc < 1:2274168‑M2/77‑1 (MQ=255) ttagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTcc < 1:1607232‑M2/77‑1 (MQ=255) tagggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCt < 1:251820‑M2/78‑1 (MQ=255) agggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTa > 1:3920879‑M2/13‑91 (MQ=255) agggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTa > 1:375519‑M2/13‑91 (MQ=255) gggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTaa > 2:1412828‑M2/12‑91 (MQ=255) ggtgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTaaa > 2:2149673‑M2/11‑91 (MQ=255) tgcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAAt > 2:3633537‑M2/9‑91 (MQ=255) gcttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAAtt > 2:3293044‑M2/8‑91 (MQ=255) cttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAAttt > 1:2670570‑M2/7‑91 (MQ=255) cttttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAAttt > 1:3443690‑M2/7‑91 (MQ=255) tttgGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTAc < 2:3428018‑M2/87‑1 (MQ=255) | ACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAA > USA300TCH1516_ALE/2850776‑2850955 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |