| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2866995 | 150 (0.740) | 23 (0.140) | 13/134 | NT | 14.6% | intergenic (‑394/+59) | USA300HOU_RS14695/noc_2 | hypothetical protein/Nucleoid occlusion protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2867006 | 144 (0.850) | intergenic (‑405/+48) | USA300HOU_RS14695/noc_2 | hypothetical protein/Nucleoid occlusion protein | |||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
ATTGATTTATGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCATAATAATCTTCA > USA300TCH1516_ALE/2866917‑2867096 | taattTATGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGAT‑CAAGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagct > 2:2534700‑M2/3‑87 (MQ=255) tGATTTATGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagc < 2:2186167‑M2/91‑4 (MQ=255) tGATTTATGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagc > 1:1854544‑M2/1‑88 (MQ=255) agATTTATGTACCAGCCTGAGAAAAATATAAATATAAATTTTTATGTGTAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAg < 2:1291086/90‑1 (MQ=255) gATTTATGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagct < 1:105682‑M2/91‑5 (MQ=255) gATTTATGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagct < 1:2694880‑M2/91‑5 (MQ=255) gATTTATGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagct > 1:2236611‑M2/1‑87 (MQ=255) tttATGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagcttt < 1:3953698‑M2/91‑7 (MQ=255) tATGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgt > 2:2458397‑M2/1‑83 (MQ=255) tATGGAGCAGCCGGATCGACATATAAAGATAAATTTTTATGTTTCAAGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgt > 2:834309‑M2/1‑83 (MQ=255) tGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtct < 1:581718‑M2/91‑11 (MQ=255) tGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtct < 1:232012‑M2/91‑11 (MQ=255) tGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCAAGTAAAAA‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtct > 2:2943428‑M2/1‑81 (MQ=255) gTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtctt < 2:1797442‑M2/91‑12 (MQ=255) tACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAACAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctgtgtcttt < 2:3578617‑M2/91‑13 (MQ=255) tACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtcttt > 2:2012111‑M2/1‑79 (MQ=255) tACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtcttt > 2:3202953‑M2/1‑79 (MQ=255) aCCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtctttt > 1:1181818‑M2/1‑78 (MQ=255) aCCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtctttt > 1:3359528‑M2/1‑78 (MQ=255) aCCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtctttt > 2:1909233‑M2/1‑78 (MQ=255) aCCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtctttt > 1:593996‑M2/1‑78 (MQ=255) ccAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTa > 2:1995042/1‑91 (MQ=255) ccAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTa > 2:274147/1‑91 (MQ=255) aGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTAtg > 2:68879/1‑91 (MQ=255) aGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑‑AAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTAtgt < 1:2402229/91‑1 (MQ=255) ccTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTAtgtg > 1:2660928/1‑91 (MQ=255) cTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAACAAAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTAtgtg < 1:49292/91‑1 (MQ=255) cTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGCCAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATgtgt > 1:3409307/1‑91 (MQ=255) cTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATgtgt < 1:2678900/91‑1 (MQ=255) cTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATgtgt < 1:159046/91‑1 (MQ=255) cTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACATAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATgtgt > 1:720905/1‑91 (MQ=255) atGATAAAAATATAAATATAAATTTTTATGTTTAAAGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATgtgt < 2:2188112/90‑1 (MQ=255) tGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGtt > 1:473413/1‑91 (MQ=255) gATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTa < 1:3462556/91‑1 (MQ=255) cAACATATAAATATAAATTTTTTTGTTTCACGTAAAAC‑AAAAACAACTTCAAAGCTGATATCATATTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGtc > 2:555394/1‑91 (MQ=255) aCATATAAATATAAATTTTTATGTTTTACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGtcat > 2:211448/1‑91 (MQ=255) atataaatataaATTTTTATTTTTCACGTAAAAG‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGtcatca < 1:3245188/91‑1 (MQ=255) tataaatataaaTTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTcatcat < 1:1407011/91‑1 (MQ=255) ataaatataaatTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATg > 2:120981/1‑91 (MQ=255) taaatataaatTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGt > 1:1198010/1‑91 (MQ=255) attataaatTTTTATGTTTCAAGAAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGtat < 2:710390/89‑1 (MQ=255) atataaatTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGtata > 2:1987616/1‑91 (MQ=255) ataaatTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACg < 1:2519532/91‑1 (MQ=255) aaatTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGAc > 1:3042558/1‑91 (MQ=255) aatTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACa > 1:1774705/1‑91 (MQ=255) tttttATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATc < 1:1817832/91‑1 (MQ=255) ttttATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATcc < 1:330142/91‑1 (MQ=255) ttttATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATcc > 1:1134973/1‑91 (MQ=255) tttATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATCTGTTAGTCATCATGTATACGACATCct > 2:449172/1‑91 (MQ=255) ttATGTTTCACGTAAAAC‑‑‑AAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCctact < 1:2811142/91‑1 (MQ=255) tATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCctac > 1:2845792/1‑91 (MQ=255) aTGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCctact < 1:2622011/91‑1 (MQ=255) gTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCctactac < 1:507502/91‑1 (MQ=255) gTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCctactac < 1:2920592/91‑1 (MQ=255) ttCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCctactacta > 2:2666562/1‑91 (MQ=255) ttCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCctactacta > 2:127647/1‑91 (MQ=255) ttCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCctactacta > 2:78075/1‑91 (MQ=255) aCGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACg > 2:3842216/1‑91 (MQ=255) cGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGt < 2:400564/91‑1 (MQ=255) cGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGt > 2:692438/1‑91 (MQ=255) aaaaC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTta > 1:3943263/1‑91 (MQ=255) aaC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTtata > 2:2904551/1‑91 (MQ=255) aaC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTgata > 1:3556378/1‑91 (MQ=255) c‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTtatata > 2:1420569/1‑91 (MQ=255) aaacaaaaaGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTatatat < 1:3113969/91‑1 (MQ=255) aaaaaaaGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTc > 1:2167760/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCg > 1:1318368/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCg > 2:1806235/1‑91 (MQ=255) aaaaaGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGa < 1:700079/91‑1 (MQ=255) aaaaGGCAAAGCTGTGATGATCTTAGCGTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGaa < 2:340172/91‑1 (MQ=255) aaaGACAAAGCTGTTATGATTTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTCATATATTCGAAt > 2:3287977/1‑91 (MQ=255) aaaGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAAt > 1:3793616/1‑91 (MQ=255) aGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtcttttttttttgttttacgtgaaacataaaaatttatatttatatgttgatcaggctggtac < 1:864147‑M2/91‑71 (MQ=255) aGACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtctttttttttgttttacgtgaaacataaaaatttatatttatatgttgatcaggctggtaca < 1:782173‑M2/91‑71 (MQ=255) aGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAAttt < 1:1682277/91‑1 (MQ=255) aGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAAttt < 1:2247623/91‑1 (MQ=255) aGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAAttt > 1:1352193/1‑91 (MQ=255) gACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtctttttttttgttttacgtgaaacataaaaatttatatttatatgttgatcaggctggtacat < 2:2307772‑M2/91‑72 (MQ=255) gACAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtctttttttttgttttacgtgaaacataaaaatttatatttatatgttgatcaggctggtacat < 1:3925619‑M2/91‑72 (MQ=255) gACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTCCTACTAACGTCTATATATTCGAAtttt > 1:3269259/1‑91 (MQ=255) cAAAGCTGTTATGATCTTagctttgtctttttttttgtttttcgtgaaacataaaaatttatatttatttgttgatccggctggtacataa < 2:283162‑M2/91‑74 (MQ=255) aGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTAttt > 1:2742501/1‑91 (MQ=255) gCTGTTATGATCTTagctttgtctttttttttgttttacgtgaaacataaaaatttatatttatatgttgatcaggctggtacataaatca < 2:3743907‑M2/91‑78 (MQ=255) cTGTTATGATCTTagctttgtcttttttttttttttttcgtgaaacataaaaatttatatttatatgtttatcaggctggtacataaatca < 2:1975279‑M2/91‑79 (MQ=255) cTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCa > 1:2069301/1‑91 (MQ=255) tGTTATGATCTTagctttgtctttttttttgttttacgtgaaacataaaaatttatatttatatgttgatcaggctggtacataaatcaat < 2:3828683‑M2/91‑80 (MQ=255) tGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCat < 1:599681/91‑1 (MQ=255) tGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATATATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCat < 2:3474928/91‑1 (MQ=255) gTTATGATCTTagctttgtctttttttttgttttacgtgaaacataaaaatttatatttatatgttgatcaggctggtacataaatcaatg < 1:1663810‑M2/91‑81 (MQ=255) gTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCata > 2:823590/1‑91 (MQ=255) gTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCata < 1:3666891/91‑1 (MQ=255) ttATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCataa > 1:899641/1‑91 (MQ=255) tgctCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCAtactaa > 2:3796942/4‑91 (MQ=255) gATCTTagctttgtctttttttttgttttacgtgaaacataaaaatttatatttatatgttgatcaggctggtacataaatcaatgttcta < 1:288543‑M2/91‑86 (MQ=255) gATCTTagctttgtctttttttttgttttacgtgaaacataaaaatttatatttatatgttgatcaggctggtacataaatcaatgttcta < 1:2451496‑M2/91‑86 (MQ=255) gATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCATaataat > 2:1586364/1‑91 (MQ=255) gATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCATaataat > 1:1542013/1‑91 (MQ=255) aTCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCATAATAATc < 2:263247/91‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCATAATAATCTTc > 1:3174729/1‑91 (MQ=255) tAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCATAATAATCTTCa > 1:1004814/1‑91 (MQ=255) | ATTGATTTATGTACCAGCCTGATCAACATATAAATATAAATTTTTATGTTTCACGTAAAAC‑AAAAAAAAAGACAAAGCTGTTATGATCTTAGCTTTGTCTTTTATGTGTTAGTCATCATGTATACGACATCCTACTACTAACGTTTATATATTCGAATTTTTATTTCATAATAATCTTCA > USA300TCH1516_ALE/2866917‑2867096 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |