| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 211704 = | 157 (0.770) | 9 (0.050) | 7/142 | NT | 5.6% | intergenic (+262/+66) | sfp/yagU | 4'‑phosphopantetheinyl transferase sfp/Inner membrane protein YagU |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 211755 = | 162 (0.900) | intergenic (+313/+15) | sfp/yagU | 4'‑phosphopantetheinyl transferase sfp/Inner membrane protein YagU | |||||
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
CGTAAGTTGGCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGATATGGCCAAAG > USA300TCH1516_ALE/211665‑211845 | cGTAAGTTGGCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTaa > 1:1415649/1‑91 (MQ=255)cGTAAGTTGGCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTaa > 2:1111122/1‑91 (MQ=255)cGTAAGTTGGCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTaa < 1:2124353/91‑1 (MQ=255) gTAAGTTGGCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAGATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAAt < 1:1798746/91‑1 (MQ=255) aaGTTGGCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGt > 1:2852420/1‑91 (MQ=255) atttGGGTGGAATCATATCATGTCAGTTAATTAAATAACGTGAGCATCAATCCTCATTCTCGAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGtt < 2:2707105/89‑1 (MQ=255) aGTTAGCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAACGtt > 1:3119379/1‑91 (MQ=255) tGGCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGt < 1:2654752/91‑1 (MQ=255) tGGCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGt < 1:3829899/91‑1 (MQ=255) ggCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTc > 1:1247337/1‑91 (MQ=255) ggCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTCAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTc > 1:3328128/1‑91 (MQ=255) cTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAg < 1:975937/91‑1 (MQ=255) tGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAgt < 1:3210848/91‑1 (MQ=255) tGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAgt > 2:485056/1‑91 (MQ=255) aaTCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTa < 2:2850113/91‑1 (MQ=255) atcatatcatGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTAt > 2:657454/1‑91 (MQ=255) atcatGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTAttaatt < 2:3169281/91‑1 (MQ=255) tcatGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTAttaattt > 2:3627469/1‑91 (MQ=255) tcatGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTAttaattt > 2:2130485/1‑91 (MQ=255) atacactgactaacattaacgtgagttttaaatcatcgtttgagtatgatgattgatgctcacgttaATGTTAGTCAGTGTAttaatttaa > 2:1716694‑M2/68‑91 (MQ=255) atGTCAGCTAATAAAATAACGTGATCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTTATGTTAGTCAGTGTAttaatttaa > 2:1592250/1‑91 (MQ=255) tGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTAttaatttaat > 1:811014/1‑91 (MQ=255) gTCGGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCGTACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATtaatttaatt < 2:2864388/91‑1 (MQ=255) gTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATtaatttaatt < 2:1402420/91‑1 (MQ=255) tCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTaatttaattt < 2:3077084/91‑1 (MQ=255) tCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTaatttaattt < 2:3078343/91‑1 (MQ=255) cAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAatttaattta < 2:3492199/91‑1 (MQ=255) gTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTtata < 1:548570/91‑1 (MQ=255) gTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTtata < 1:1450391/91‑1 (MQ=255) ttAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAg < 2:358094/91‑1 (MQ=255) ttAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAg < 1:691520/91‑1 (MQ=255) aataaaataaCGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCg > 1:866374/1‑91 (MQ=255) ataaaataaCGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGa < 1:302071/91‑1 (MQ=255) aaaataaCGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATa > 1:2355865/1‑91 (MQ=255) agataaCGGGAGCATCAAGCATCATACTCAAACGATGATTTAGAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAg < 2:1105003/89‑1 (MQ=255) aaataaCGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAg > 1:3526566/1‑91 (MQ=255) aaataaCGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAg > 2:2016953/1‑91 (MQ=255) aaataaCGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAg < 2:2052486/91‑1 (MQ=255) aaataaCGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAg < 2:2548053/91‑1 (MQ=255) ataaCGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGAc > 1:3337325/1‑91 (MQ=255) ataaCGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGAc < 2:2430899/91‑1 (MQ=255) taacgtgagttttaaatcatcgtttgagtatgatgattgatgctcacgttaATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACa > 1:1030505‑M2/52‑91 (MQ=255) TAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACa < 2:2183004‑M1/91‑1 (MQ=255) TAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACa > 2:2967109‑M1/1‑91 (MQ=255) AACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACaa > 1:1057256‑M1/1‑91 (MQ=255) ACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACaaa < 2:3302035‑M1/91‑1 (MQ=255) ACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACaaa > 2:3107843‑M1/1‑91 (MQ=255) ACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACaaa > 1:966392‑M1/1‑91 (MQ=255) cgtgagttttaaatcatcgtttgagtatgatgattgatgctcacgttaATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACaaaa > 1:3519091‑M2/49‑91 (MQ=255) CGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACaaaa < 1:2469850‑M1/91‑1 (MQ=255) GTGAGCATCAGTCATCATACTCAAACGATGATGTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGGCAGAAt > 2:865660‑M1/1‑91 (MQ=255) tgagttttaaatcatcgtttgagtatgatgattgatgctcacgttaATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAAtg > 2:1203581‑M2/47‑91 (MQ=255) TGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAAtg < 1:2556002‑M1/91‑1 (MQ=255) TGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAAtg > 2:47722‑M1/1‑91 (MQ=255) TGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAAtg > 2:3853643‑M1/1‑91 (MQ=255) TGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAAtg > 1:738842‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAAtgt < 1:3402724‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAAtgtt < 2:1043450‑M1/91‑1 (MQ=255) GCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGa < 1:3165290‑M1/81‑1 (MQ=255) atcaatcaTCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAGATGTTGTc < 2:525103/91‑1 (MQ=255) ttaaatcatcgtttgagtatgatgattgatgctcacgttaATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCg > 1:3791859‑M2/41‑91 (MQ=255) ttaaatcatcgtttgagtatgatgattgatgctcacgttaATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCg > 1:163341‑M2/41‑91 (MQ=255) caatcaTCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGc > 1:2033251/1‑91 (MQ=255) catcatACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTa < 1:1595109/91‑1 (MQ=255) catACTCCAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTCAGTCAGTGTACTAATTTAATTTATAGCGAGTGACAAAATCTTGTCGCACTAAtt > 2:3681481/1‑91 (MQ=255) aCTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCaa > 2:435212/1‑91 (MQ=255) cTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAAt < 2:2511640/91‑1 (MQ=255) tCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAAtt > 1:329760/1‑91 (MQ=255) aaaCGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGt < 2:1849444/91‑1 (MQ=255) aaaCGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGt < 2:3526638/91‑1 (MQ=255) aaaCGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGt > 1:1902092/1‑91 (MQ=255) aaCGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGtc > 2:3032402/1‑91 (MQ=255) cGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGtcat < 2:777899/91‑1 (MQ=255) cGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGtcat > 2:3955883/1‑91 (MQ=255) cGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGtcat < 2:153657/91‑1 (MQ=255) cGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGtcat > 2:3579875/1‑91 (MQ=255) gatgatTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGtcatc > 2:104477/1‑91 (MQ=255) atgatTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGtcatca > 2:737382/1‑91 (MQ=255) atgatTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGtcatca < 1:3042442/91‑1 (MQ=255) atgatTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGtcatca > 1:2019025/1‑91 (MQ=255) atgatTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGCGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGtcatca > 2:224484/1‑91 (MQ=255) tgatTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTcatcat < 1:2902026/91‑1 (MQ=255) tttAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCa > 1:2433999/1‑91 (MQ=255) ttAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAg < 1:253194/91‑1 (MQ=255) aaaaCTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGAc < 1:3313942/91‑1 (MQ=255) taCTCACGTTAATTTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATTCAGACGa < 2:2381522/90‑1 (MQ=255) aaCTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGa < 2:2638675/91‑1 (MQ=255) aaCTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGa > 2:1969757/1‑91 (MQ=255) aCTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGat < 2:2669782/91‑1 (MQ=255) aCTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGat < 1:224092/91‑1 (MQ=255) aCTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGat > 1:3501802/1‑91 (MQ=255) cacgttaATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGATATg > 1:2738834‑M2/8‑91 (MQ=255) cacgttaATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGATATg < 1:1678947‑M2/84‑1 (MQ=255) gttaATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGATATGGcc > 1:814760‑M2/5‑91 (MQ=255) ttaATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGATATGGCCa < 1:3913810‑M2/88‑1 (MQ=255) taATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGATATGGCCaa < 1:2991842‑M2/89‑1 (MQ=255) aATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGATATGGCCaaa < 1:2103671‑M2/90‑1 (MQ=255) aATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGATATGGCCaaa < 1:2103770‑M2/90‑1 (MQ=255) aTGTTAGTCAGTGTATTAATTTGATTTATAGCGATAGACAAGATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGATATGGCCAAAg < 1:1203815/91‑1 (MQ=255) aTGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGATATGGCCAAAg < 1:659606/91‑1 (MQ=255) | CGTAAGTTGGCTGGAATCATATCATGTCAGTTAATAAAATAACGTGAGCATCAATCATCATACTCAAACGATGATTTAAAACTCACGTTAATGTTAGTCAGTGTATTAATTTAATTTATAGCGATAGACAAAATGTTGTCGCACTAATTCAATTGTCATCATCCAGACGATATGGCCAAAG > USA300TCH1516_ALE/211665‑211845 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |