| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 329202 = | 185 (0.910) | 26 (0.150) | 12/140 | NT | 14.1% | intergenic (+70/+73) | USA300HOU_RS01475/ssaA2_1 | hypothetical protein/Staphylococcal secretory antigen ssaA2 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 329255 = | 156 (0.880) | intergenic (+123/+20) | USA300HOU_RS01475/ssaA2_1 | hypothetical protein/Staphylococcal secretory antigen ssaA2 | |||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
TTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTCACCA > USA300TCH1516_ALE/329165‑329344 | tttCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCtttt < 2:1200160/91‑1 (MQ=255) ttCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCttttt > 1:3438174/1‑91 (MQ=255) ttCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCttttt > 1:3438017/1‑91 (MQ=255) tCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTCAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTa > 1:3027283/1‑91 (MQ=255) cTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTAt > 2:3748989/1‑91 (MQ=255) cTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTAt < 1:787295/91‑1 (MQ=255) tttGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTAtt < 2:1212207/91‑1 (MQ=255) ttGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTg < 2:768135/91‑1 (MQ=255) ttGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTg < 2:766315/91‑1 (MQ=255) catccattaaattaatcatgacatcaaaatAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGAt > 2:2820928‑M1/31‑91 (MQ=255) tAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATg < 1:2194118/91‑1 (MQ=255) aTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTc > 1:3878250/1‑91 (MQ=255) ttttATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCa < 2:2308883/91‑1 (MQ=255) tttATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCAt < 1:1169014/91‑1 (MQ=255) ttATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATg > 1:2758784/1‑91 (MQ=255) ttATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATg > 1:71278/1‑91 (MQ=255) ataATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAt < 2:32323/91‑1 (MQ=255) aaTCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTGATTGATGTCATGAtta > 2:3041896/1‑91 (MQ=255) aTCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaa > 2:2258549/1‑91 (MQ=255) cGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaatt > 1:329520/1‑91 (MQ=255) cGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaatt < 1:2368514/91‑1 (MQ=255) gAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaattt < 1:3543086/91‑1 (MQ=255) aTAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaatttaa < 2:1758095/91‑1 (MQ=255) aTAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaatttaa < 2:2030728/91‑1 (MQ=255) aTAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTGTTTATTGATGTCATGAttaatttaa > 1:3684311/1‑91 (MQ=255) aaCATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATg < 1:1245974/91‑1 (MQ=255) cATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGa > 2:621518/1‑91 (MQ=255) aTACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGAt > 2:2845972/1‑91 (MQ=255) aCAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGt > 2:1664301/1‑91 (MQ=255) cAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTa > 1:1499539/1‑91 (MQ=255) aaaaTAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTaa < 1:989057/91‑1 (MQ=255) aaaTAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAAt < 2:1969887/91‑1 (MQ=255) aTAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATta < 1:3731429/91‑1 (MQ=255) tAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATtat < 1:2020126/91‑1 (MQ=255) tAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATtat > 2:1670369/1‑91 (MQ=255) AAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATtata < 2:3303616‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTatat < 1:439703‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTatat < 2:1471274‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTatat < 2:3154668‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatg < 1:1774958‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatg < 2:2456070‑M1/91‑1 (MQ=255) GCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatga > 1:2268535‑M1/1‑91 (MQ=255) cgaccagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatgat > 1:1010363‑M2/50‑91 (MQ=255) CGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatgat < 2:2736243‑M1/91‑1 (MQ=255) CGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatgat < 1:1906256‑M1/91‑1 (MQ=255) gaccagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatgatg > 1:2113160‑M2/49‑91 (MQ=255) accagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATAtgatga > 2:2592995‑M2/48‑91 (MQ=255) accagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATAtgatga > 1:64675‑M2/48‑91 (MQ=255) ACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATAtgatga > 2:809661‑M1/1‑91 (MQ=255) ccagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGaa > 2:215189‑M2/47‑91 (MQ=255) ccagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGaa > 2:215036‑M2/47‑91 (MQ=255) cagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGaaa > 1:315338‑M2/46‑91 (MQ=255) cagttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGaaa > 1:315157‑M2/46‑91 (MQ=255) agttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAAc > 1:3088396‑M2/45‑91 (MQ=255) agttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAAc > 2:3155583‑M2/45‑91 (MQ=255) agttcgcagtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAAc > 1:1617609‑M2/45‑91 (MQ=255) AATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAAc > 2:376959‑M1/1‑91 (MQ=255) aTTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACt < 1:1359686/91‑1 (MQ=255) ttttGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACtt < 1:1072353/91‑1 (MQ=255) cAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGaa > 1:813859/1‑91 (MQ=255) cAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGaa < 2:2180880/91‑1 (MQ=255) gtttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAg > 1:470703‑M2/37‑91 (MQ=255) aGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAg < 2:508253/91‑1 (MQ=255) ttacaattcgtaacactgcaaaattggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCa > 1:4144‑M2/35‑91 (MQ=255) tgtTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCa > 1:1979154/1‑91 (MQ=255) gtTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCag < 1:2137029/91‑1 (MQ=255) aaTTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTGATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATgg < 2:2999597/91‑1 (MQ=255) aaTTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATgg < 2:861244/91‑1 (MQ=255) aaTTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATgg > 2:747407/1‑91 (MQ=255) aaTTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATGATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATgg < 2:1309903/91‑1 (MQ=255) aTTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGt < 2:1067964/91‑1 (MQ=255) tGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTc < 2:294831/91‑1 (MQ=255) tGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTc < 2:141247/91‑1 (MQ=255) tGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTc < 2:1826966/91‑1 (MQ=255) tGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTc < 2:1140550/91‑1 (MQ=255) tGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTc < 1:609927/91‑1 (MQ=255) gTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCt > 2:404214/1‑91 (MQ=255) gTAAACTGAGAACAGGTAGCTTTTTATAGATGTCATGAATAATATAAAGAAAATAATTATAAGATGAAACTTAAGAAGCAGAGATGGttaa > 2:1405905/1‑89 (MQ=255) tAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGACGTCATGATTACTTTCATGGAAGTAATTATATGATAGAACTTCTGATGCAGAGGTGGTTCtt > 2:3431758/1‑91 (MQ=255) aaaCTGCGCACTGGACGCTTTTTAATGGTGTCTTGATTAATTTAATGGTTGTAATTATATGATGAAACTTATGAAGCAGAGCTGGTTCTtg > 2:3108640/1‑91 (MQ=255) aaaCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtg > 1:2977535/1‑91 (MQ=255) aaaCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtg > 1:2701462/1‑91 (MQ=255) aaaCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtg > 2:3558393/1‑91 (MQ=255) aCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtgat > 1:574986/1‑91 (MQ=255) tGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtgatga > 2:2731903/1‑91 (MQ=255) tGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtgatga > 1:936909/1‑91 (MQ=255) gCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGaa > 1:1583029/1‑91 (MQ=255) gAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAAc < 1:2983110/91‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACg > 1:2488722/1‑91 (MQ=255) cTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGat > 1:2923803/1‑91 (MQ=255) cTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGat < 1:1819400/91‑1 (MQ=255) ggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatat < 2:1684775‑M2/82‑1 (MQ=255) ggtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatat > 2:2725270‑M2/10‑91 (MQ=255) gtcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatata > 1:1306716‑M2/9‑91 (MQ=255) tcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatatat < 1:2410988‑M2/84‑1 (MQ=255) tcgctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGatatat < 2:3342100‑M2/84‑1 (MQ=255) gctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTc > 1:2682500‑M2/6‑91 (MQ=255) gctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTc > 2:2769470‑M2/6‑91 (MQ=255) gctttTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTc > 1:366815‑M2/6‑91 (MQ=255) tTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTCACCa > 1:1640683‑M2/2‑91 (MQ=255) | TTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGATATATTCACCA > USA300TCH1516_ALE/329165‑329344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |