| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 329211 | 178 (0.870) | 18 (0.100) | 8/140 | NT | 10.4% | intergenic (+79/+64) | USA300HOU_RS01475/ssaA2_1 | hypothetical protein/Staphylococcal secretory antigen ssaA2 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 329244 | 156 (0.880) | intergenic (+112/+31) | USA300HOU_RS01475/ssaA2_1 | hypothetical protein/Staphylococcal secretory antigen ssaA2 | |||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
TGTAGAGAACATTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGAT > USA300TCH1516_ALE/329154‑329334 | gtttcatcatataattacatccattaaattaatcatgacatcaataaAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACt > 1:1617822‑M1/48‑91 (MQ=255) gtttcatcatataattacatccagtaaattaatcatgacatcaataaAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACt > 2:1677926‑M1/48‑91 (MQ=255) gTAGAGAACATTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACt > 1:2249672‑M2/1‑90 (MQ=255) tAGAGAACATTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtg > 1:635404‑M2/1‑89 (MQ=255) ttcatcatataattacatccattaaattaatcatgacatcaataaAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTgg > 2:215036‑M1/46‑91 (MQ=255) catcatataattacatccattaaattaatcatgacatcaataaAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTc > 1:2113160‑M1/44‑91 (MQ=255) agaACATTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtc < 1:2962764‑M2/91‑6 (MQ=255) gaACATTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcg > 1:3521684‑M2/1‑85 (MQ=255) gaACATTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcg > 2:327398‑M2/1‑85 (MQ=255) atcatataattacatccattaaattaatcatgacatcaataaAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCg > 1:1010363‑M1/43‑91 (MQ=255) cATTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcgctt > 2:3829454‑M2/1‑82 (MQ=255) cATTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcgctt < 2:2384337‑M2/91‑10 (MQ=255) aTTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcgcttt > 1:3840617‑M2/1‑81 (MQ=255) tttCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCtttt < 2:1200160/91‑1 (MQ=255) ttCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCttttt > 1:3438098/1‑91 (MQ=255) tCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTCAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTa > 1:3027168/1‑91 (MQ=255) cTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTAt < 1:1778059/91‑1 (MQ=255) cTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTAt > 2:3748989/1‑91 (MQ=255) tttGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTAtt > 2:1253661/1‑91 (MQ=255) ttacatccattaaattaatcatgacatcaaaatAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTAtt > 1:159125‑M1/34‑91 (MQ=255) ttGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTg > 2:2761429/1‑91 (MQ=255) catccattaaattaatcatgacatcaaaatAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGAt > 2:2820928‑M1/31‑91 (MQ=255) tAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATg > 2:3596305/1‑91 (MQ=255) aaTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCACTTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCGTTTTATTGATGt > 2:1450187/1‑91 (MQ=255) aaTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGCTGt > 2:76746/1‑91 (MQ=255) atgttATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTc < 2:154916/88‑1 (MQ=255) aTTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTGCGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTc < 2:3258018/91‑1 (MQ=255) tttATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCAt < 1:1169014/91‑1 (MQ=255) ttATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATg > 1:71262/1‑91 (MQ=255) tataATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGa < 1:529756/91‑1 (MQ=255) ataATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAt < 1:934382/91‑1 (MQ=255) ataATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAt < 1:2684596/91‑1 (MQ=255) ataATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAt < 1:93804/91‑1 (MQ=255) aTCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaa > 2:2258172/1‑91 (MQ=255) cGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaatt > 1:329520/1‑91 (MQ=255) cGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaatt > 2:3454125/1‑91 (MQ=255) gAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaattt < 1:3543086/91‑1 (MQ=255) aTAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaatttaa < 2:1758095/91‑1 (MQ=255) aTAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGAttaatttaa < 2:2030728/91‑1 (MQ=255) aTAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTGTTTATTGATGTCATGAttaatttaa > 1:3684311/1‑91 (MQ=255) aaCATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATg < 1:1245974/91‑1 (MQ=255) aCATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATgg > 2:1387246/1‑91 (MQ=255) aCATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATgg > 2:2577462/1‑91 (MQ=255) aCATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATCGATGTCATGATTAATTTAATgg > 2:3191903/1‑91 (MQ=255) cATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGa > 2:2170299/1‑91 (MQ=255) aTACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGAt > 2:2845972/1‑91 (MQ=255) aTACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGAt > 1:606323/1‑91 (MQ=255) aCAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGt > 2:1667844/1‑91 (MQ=255) aCAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGt < 1:2916459/91‑1 (MQ=255) cAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTACACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTa > 2:2735909/1‑91 (MQ=255) cAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTa > 1:1499539/1‑91 (MQ=255) cAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTa < 1:3037109/91‑1 (MQ=255) aaaTAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAAt < 2:1969887/91‑1 (MQ=255) aTAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATta < 1:3731429/91‑1 (MQ=255) tAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATtat < 1:2020126/91‑1 (MQ=255) AAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTatat < 1:439788‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTatat < 2:3154668‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTatat < 2:625640‑M1/91‑1 (MQ=255) aGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcgctttattttgtatgttattcgattataaaattacaaagaaatgt < 1:3633579‑M2/91‑51 (MQ=255) AGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatg < 1:2589858‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatg < 2:2455136‑M1/91‑1 (MQ=255) GCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatga > 1:3095757‑M1/1‑91 (MQ=255) GCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatga > 1:2268535‑M1/1‑91 (MQ=255) CGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatgat < 1:2400410‑M1/91‑1 (MQ=255) CGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATatgat < 1:1343724‑M1/91‑1 (MQ=255) aTTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcgctttattttgtatgttattcgattataaaattacaaagaaatgttctctaca < 2:101197‑M2/91‑59 (MQ=255) aTTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcgctttattttgtatgttattcgattataaaattacaaagaaatgttctctaca < 1:766594‑M2/91‑59 (MQ=255) ttttGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcgctttattttgtatgttcttcgattataaaattacaaagaaatgttctctacaa < 2:3912872‑M2/91‑60 (MQ=255) ttttGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcgctttattttgtatgttattcgattataaaattacaaagaaatgttctctacat < 1:3191546‑M2/91‑60 (MQ=255) ttttGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACtt < 1:1072353/91‑1 (MQ=255) tGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcgctttattttgtatgttattcgattataaaattacaaagaaatgttctctacattcc < 1:414530‑M2/91‑63 (MQ=255) tGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTg < 1:794197/91‑1 (MQ=255) gCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACtggtcgctttattttgtatgttattcgattataaaattacaaagaaatgttctctacattccc < 1:2205920‑M2/91‑64 (MQ=255) gCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGa > 2:2290397/1‑91 (MQ=255) gCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGa > 1:2179886/1‑91 (MQ=255) aGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAg < 2:508253/91‑1 (MQ=255) gtTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCag < 1:2136968/91‑1 (MQ=255) gtTACGAATTGTAAACTGCAAAAttggtcgctttattttgtatgttattcgattataaaattacaaagaaatgttctctacattcctcatt < 1:3894170‑M2/91‑69 (MQ=255) ttACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCaga < 1:1881141/91‑1 (MQ=255) aCGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAgaga < 1:1363394/91‑1 (MQ=255) aCGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAgaga < 2:799222/91‑1 (MQ=255) aaTTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTGATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATgg < 2:2999597/91‑1 (MQ=255) aaTTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATgg < 2:3075648/91‑1 (MQ=255) aaTTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATgg < 2:861244/91‑1 (MQ=255) aaTTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTGTTTATTGATGTCATGATTAATTTAAAGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGTAGCAGAGATgg > 2:748938/1‑91 (MQ=255) aTTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGt < 2:1067964/91‑1 (MQ=255) tGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTc < 2:1826966/91‑1 (MQ=255) tGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTc < 2:294831/91‑1 (MQ=255) tGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTc < 2:1140550/91‑1 (MQ=255) gTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCt > 2:404214/1‑91 (MQ=255) gTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCt > 2:1405957/1‑91 (MQ=255) aaaCTGCGCACTGGACGCTTTTTAATGGTGTCTTGATTAATTTAATGGTTGTAATTATATGATGAAACTTATGAAGCAGAGCTGGTTCTtg > 2:3108640/1‑91 (MQ=255) aaaCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtg < 2:334540/91‑1 (MQ=255) aaaCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtg > 1:2701808/1‑91 (MQ=255) aaaCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtg > 1:3152885/1‑91 (MQ=255) aCTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTtgat > 2:2666549/1‑91 (MQ=255) cGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGaaa > 1:1714937/1‑91 (MQ=255) gAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAAc < 1:2982990/91‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACg > 1:2488722/1‑91 (MQ=255) aCTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGa < 1:1935666/91‑1 (MQ=255) | TGTAGAGAACATTTCTTTGTAATTTTATAATCGAATAACATACAAAATAAAGCGACCAATTTTGCAGTGTTACGAATTGTAAACTGCGAACTGGTCGCTTTTTATTGATGTCATGATTAATTTAATGGATGTAATTATATGATGAAACTTCTGAAGCAGAGATGGTTCTTGATGAAACGAT > USA300TCH1516_ALE/329154‑329334 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |