New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 349720 = | 256 (1.260) | 15 (0.080) | 9/142 | NT | 7.0% | intergenic (+272/‑314) | USA300HOU_RS01580/yezG_6 | hypothetical protein/putative antitoxin YezG |
? | USA300TCH1516_ALE | 349754 = | 172 (0.950) | intergenic (+306/‑280) | USA300HOU_RS01580/yezG_6 | hypothetical protein/putative antitoxin YezG |
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
CAAGATTATTATAATTGTATTACATATAGGTGCTGGTAAATTTTATTTACGAAATGGCAAAAAAGTATATACTATTAATATCTTTTTTGCTATAATTATAAATAGTTAAATAAATAGAAAGACAAAATAATGAGTAGGAGTTTTAGGGCTATTATTTACAAATAATATAATACTGCAAAGA > USA300TCH1516_ALE/349664‑349844 | cAAGATTATTATAATTGTATTACATATAGGTGCTGGTAAATTTTATTTACGAAATGGCAAAAAAGTATATACTATTAATATCTTTTTTGCt < 1:3397463/91‑1 (MQ=255) aGATTATTATAATTGTATTACATATAGGTGCTGGTAAATTTTATTTACGAAATAGAAAAAAAGTATATACTATTAATATCTTTTTTGCtat < 2:1153291/91‑1 (MQ=255) gATTATTATAATTGTATTACATATAGGTGCTGGTAAATTTTATTTACGAAATGGCAAAAAAGTATATACTATTACTATCTTTTTTGCtata > 2:3039592/1‑91 (MQ=255) gATTATTATAATTGTATTACATATAGGTGCTGGTAAATTTTATTTACGAAATGAAAAAAAAGTATATACTATTAATATCTTTTTTGCtata < 2:1090674/91‑1 (MQ=255) attattATAATTGTATTACATATAGGTGCTGGTAAATTTTATTTACGAAATGGCAAAAAAGTATATACTATTAATATCTTTTTTGCTATaa < 1:1000441/91‑1 (MQ=255) attattATAATTGTATTACATATAGGTGCTGGTAAATTTTATTTACGAAATGGCAAAAAAGTATATACTATTAATATCTTTTTTGCTATaa < 2:112706/91‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |