| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 494160 | 135 (0.660) | 8 (0.040) | 4/142 | NT | 6.3% | intergenic (+109/+60) | bltD_1/USA300HOU_RS02360 | Spermine/spermidine acetyltransferase/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 494184 | 120 (0.660) | intergenic (+133/+36) | bltD_1/USA300HOU_RS02360 | Spermine/spermidine acetyltransferase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TTAATGATGAATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCTTTTTATTAAAAAT > USA300TCH1516_ALE/494094‑494274 | ttAATGATGAATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCcac > 2:3712382/1‑91 (MQ=255) tAATGATGAATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATTATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTTACATATATCCACa < 2:3458785‑M2/91‑2 (MQ=255) tAATGATGAATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACa < 2:2498744‑M2/91‑2 (MQ=255) tAATGATGAATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACa < 2:1888729‑M2/91‑2 (MQ=255) cagcgcaaaaatgatgagtctatcaattaatcgcaactagcaatataacttaagttAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAg > 1:564258‑M1/57‑91 (MQ=255) aaTGATGAATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACag > 1:3610153‑M2/1‑89 (MQ=255) aaTGAGGAATAAAGGTGCTTTTTGTGATAGATCGGCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACag > 2:7267‑M2/1‑89 (MQ=255) atgatgAATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACagg < 1:1505146‑M2/91‑4 (MQ=255) agcgcaaaaatgatgagtctatcaattaatcgcaactagcaatataacttaagttAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAgg > 1:2980676‑M1/56‑91 (MQ=255) agcgcaaaaatgatgagtctatcaattaatcgcaactagcaatataacttaagttAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAgg > 1:2360184‑M1/56‑91 (MQ=255) tgatgaATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACaggt < 1:845897‑M2/91‑5 (MQ=255) gatgaATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACaggtc > 1:3494258‑M2/1‑86 (MQ=255) gatgaATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCAGCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACaggtc > 1:1169174‑M2/1‑86 (MQ=255) cgcaagaatgatgagtctatcaattgatcgcaactagcagtataacttaagttGAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTc > 1:3677049‑M1/54‑91 (MQ=255) atgaATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACaggtcg > 2:441877‑M2/1‑85 (MQ=255) tgaATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACaggtcgc < 2:1646505‑M2/91‑8 (MQ=255) gaATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACaggtcgct > 1:2103198‑M2/1‑83 (MQ=255) aaatAAAGTTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAAAAAAATATAAAAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACaggtcgct > 2:2634414‑M2/2‑83 (MQ=255) aaaaatgatgagtctatcaattaatcgcaactagcaatataacttaagttAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGct > 1:443561‑M1/51‑91 (MQ=255) aaTAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACaggtcgctt > 2:926312‑M2/1‑82 (MQ=255) aaTAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACaggtcgctt > 2:1541796‑M2/1‑82 (MQ=255) aTAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGctta < 2:1866534/91‑1 (MQ=255) tAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGcttaa < 2:1979411/91‑1 (MQ=255) aaaGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGcttaac > 1:1012875/1‑91 (MQ=255) aGGTGGTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGcttaactt < 2:3210461/91‑1 (MQ=255) aGGTGCTTTTTTTTATAGATCATCGGTCAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGcttaactt > 2:2249273/1‑91 (MQ=255) ggTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGcttaactta > 2:2146686/1‑91 (MQ=255) ggTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGcttaactta > 2:3215304/1‑91 (MQ=255) gTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGcttaacttaa > 1:3436328/1‑91 (MQ=255) tttGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTtata < 1:3741827/91‑1 (MQ=255) ttGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTatat < 1:3815315/91‑1 (MQ=255) gTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTg < 2:3350725/91‑1 (MQ=255) ttATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGc > 1:144120/1‑91 (MQ=255) tataGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCt > 1:1287483/1‑91 (MQ=255) taGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAg > 1:175496/1‑91 (MQ=255) atcatcGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTg < 2:2055983/91‑1 (MQ=255) catcGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCg < 1:2179121/91‑1 (MQ=255) atcGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGa < 1:2242091/91‑1 (MQ=255) tcGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGAt < 1:3714914/91‑1 (MQ=255) tcGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGAt < 2:3885086/91‑1 (MQ=255) ggACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTa > 1:2802085/1‑91 (MQ=255) aCAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAAt > 1:1569973/1‑91 (MQ=255) aCAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAAt > 2:2938566/1‑91 (MQ=255) aCAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAAt < 1:3930786/91‑1 (MQ=255) cAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAAtt > 2:2535836/1‑91 (MQ=255) cAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAAtt > 1:650557/1‑91 (MQ=255) aaTTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTg < 1:32040/91‑1 (MQ=255) aTTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGa > 2:2739935/1‑91 (MQ=255) tttACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGAt < 2:1984047/91‑1 (MQ=255) tttACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGAt < 2:2698002/91‑1 (MQ=255) tttACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGAt > 2:2641920/1‑91 (MQ=255) ttACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATa > 2:1823582/1‑91 (MQ=255) tgaCTAGAGTAAAAAGCGACCTAGTGGACAATGGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATa < 2:1578824/89‑1 (MQ=255) cTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGAc > 1:1833012/1‑91 (MQ=255) taGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACtca < 1:2660751/91‑1 (MQ=255) aGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACtcat < 1:3083571/91‑1 (MQ=255) gTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACtcatc > 1:2497017/1‑91 (MQ=255) gTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACtcatc > 2:2280372/1‑91 (MQ=255) gTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACtcatc > 2:2180251/1‑91 (MQ=255) AAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCAtttt < 1:2612963‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCAtttt < 2:2453651‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCAtttt < 2:518647‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCAtttt < 1:809883‑M1/91‑1 (MQ=255) GACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTgcg > 1:2024922‑M1/1‑91 (MQ=255) GACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTgcg < 1:911512‑M1/91‑1 (MQ=255) GACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTgcg < 2:1440002‑M1/91‑1 (MQ=255) GACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTgcg < 2:3593488‑M1/91‑1 (MQ=255) GACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTgcg < 2:3952728‑M1/91‑1 (MQ=255) aCCTAGTGAACAATTGACATATATCCACaggtcgctttttactatagtaaattgtccgatgatctataacaaaaagcaccttaattcatca < 1:3054149‑M2/91‑64 (MQ=255) ACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCTATTAATTGCTAGCCTCATCATTtttgagc < 2:567421‑M1/91‑4 (MQ=255) ACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTgcgc < 1:2209680‑M1/91‑1 (MQ=255) CCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCt > 1:797114‑M1/1‑91 (MQ=255) cTAGTGAACAATTGACATATATCCACaggtcgctttttactatagtaaattgtccgatgatctataacaaaaagcacctttattcatcatt < 1:2264550‑M2/91‑66 (MQ=255) CTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTg < 2:2829782‑M1/91‑1 (MQ=255) CTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTg < 1:3635214‑M1/91‑1 (MQ=255) CTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTg < 2:1193289‑M1/91‑1 (MQ=255) TAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGt < 2:285069‑M1/91‑1 (MQ=255) aGTGAACAATTGACATATATCCACaggtcgctttttactatagtaaattgtccgatgatctataacaaaaagcacctttattcatcattaa < 1:2966104‑M2/91‑68 (MQ=255) aGTGAACAATTGACATATATCCACaggtcgctttttactatagtaaattgtccgatgatctataacaaaaagcacctttattcatcattaa < 1:413423‑M2/91‑68 (MQ=255) aGTGAACAATTGACATATATCCACaggtcgctttttactatagtaaattgtccgatgatctataacaaaaagcacctttattcatcattaa < 1:3404402‑M2/91‑68 (MQ=255) gTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCg < 2:3394495/91‑1 (MQ=255) gAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCgag > 1:3863809/1‑91 (MQ=255) aaCAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCgaga < 1:1235660/91‑1 (MQ=255) cAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATg < 2:2415226/91‑1 (MQ=255) gACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCtt > 2:2461190/1‑91 (MQ=255) gACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCtt > 1:1351022/1‑91 (MQ=255) aCATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCttt > 2:113691/1‑91 (MQ=255) aCATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCttt > 2:114224/1‑91 (MQ=255) cATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCtttt > 2:297585/1‑91 (MQ=255) cATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCtttt > 2:290040/1‑91 (MQ=255) cATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCtttt > 1:666175/1‑91 (MQ=255) atatCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCTTTttat < 2:3752333/91‑1 (MQ=255) atatCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCTTTttat < 2:1833490/91‑1 (MQ=255) atatCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCTTTttat > 1:1913569/1‑91 (MQ=255) atatCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCTTTttat > 2:936785/1‑91 (MQ=255) tatCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCTTTttatt < 1:700153/91‑1 (MQ=255) tCCACGGGTCGCTTATCTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCTTTTTATTaa < 2:2786905/91‑1 (MQ=255) tCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCTTTTTATTaa > 2:3101367/1‑91 (MQ=255) tCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCTTTTTATTaa < 1:3017647/91‑1 (MQ=255) cacaGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCTTTTTATTaaaa > 1:2083303/1‑91 (MQ=255) | TTAATGATGAATAAAGGTGCTTTTTGTTATAGATCATCGGACAATTTACTATAGTAAAAAGCGACCTAGTGAACAATTGACATATATCCACAGGTCGCTTAACTTAAGTTATATTGCTAGTTGCGATTAATTGATAGACTCATCATTTTTGCGCTGTCGAGATGGTCTTTTTATTAAAAAT > USA300TCH1516_ALE/494094‑494274 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |