New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 511972 | 199 (0.980) | 12 (0.060) | 10/154 | NT | 6.2% | intergenic (+40/‑6723) | recR/speA_2 | Recombination protein RecR/Arginine decarboxylase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 512004 | 174 (0.890) | intergenic (+72/‑6691) | recR/speA_2 | Recombination protein RecR/Arginine decarboxylase |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
AGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAA > USA300TCH1516_ALE/511914‑512094 | tAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTtta > 2:239356‑M2/1‑88 (MQ=255) gAACAGCAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtg > 1:3081984/1‑91 (MQ=255) gAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTCAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtg > 2:487828/1‑91 (MQ=255) gAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtg > 1:1298624/1‑91 (MQ=255) gAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtg > 1:2318156/1‑91 (MQ=255) aaCAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtgg < 1:3906991/91‑1 (MQ=255) aaCAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAAAACAAAAAAAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtgg < 2:3911503/91‑1 (MQ=255) cAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGTTTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCCCAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtg < 1:3515540/91‑1 (MQ=255) cAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtg < 1:1103629/91‑1 (MQ=255) cAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtg < 2:2080156/91‑1 (MQ=255) cAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtg > 1:1443355/1‑91 (MQ=255) aGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgt < 1:2703627/91‑1 (MQ=255) aGAAATGTAATGTCTGCTATTAAACATTTTTGATTGTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgt < 2:2571781/91‑1 (MQ=255) aaaTGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgtgg < 1:3280195/91‑1 (MQ=255) atgtaatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgtggtg > 1:2099208/1‑91 (MQ=255) atgtaatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgtggtg < 1:748406/91‑1 (MQ=255) atgtaatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTAtggtgtggtg > 1:2325288/1‑91 (MQ=255) gtaatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGgtgtggtgtg > 2:1544290/1‑91 (MQ=255) gtaatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGgtgtggtgtg > 2:2333075/1‑91 (MQ=255) taatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGa < 2:802770/91‑1 (MQ=255) taatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGa < 1:795172/91‑1 (MQ=255) taatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGa < 1:2139073/91‑1 (MQ=255) aatgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGAt < 2:1108491/91‑1 (MQ=255) atgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATg > 1:596262/1‑91 (MQ=255) atgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATg > 1:3012744/1‑91 (MQ=255) atgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATg < 1:2641114/91‑1 (MQ=255) tgtCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGt < 1:3225126/91‑1 (MQ=255) ttctATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGtacta < 1:495409/91‑1 (MQ=255) tctATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGtactac > 2:1302751/1‑91 (MQ=255) tctATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGtactac < 1:2766868/91‑1 (MQ=255) tctATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGtactac < 2:1501507/91‑1 (MQ=255) ctATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTactact < 1:3567813/91‑1 (MQ=255) aTTAAACATTTTTTATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACttt > 2:2987991/1‑91 (MQ=255) aTTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACttt > 1:335679/1‑91 (MQ=255) aTTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACttt < 2:1642556/91‑1 (MQ=255) aTTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACttt < 1:3841392/91‑1 (MQ=255) aTTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACttt > 1:2813142/1‑91 (MQ=255) aTTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACttt < 1:2183580/91‑1 (MQ=255) ttAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTa > 2:1983325/1‑91 (MQ=255) aaaCATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTAtt < 2:3732980/91‑1 (MQ=255) aaaCATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTAtt > 1:2948823/1‑91 (MQ=255) aaCATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTAttt < 2:929532/91‑1 (MQ=255) aCATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTAtttt > 2:2826114/1‑90 (MQ=255) cATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGc > 2:1897916/1‑91 (MQ=255) cATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGc < 1:2671902/91‑1 (MQ=255) aTTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCg > 2:867132/1‑91 (MQ=255) tttttGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTGTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCgg < 2:1629176/91‑1 (MQ=255) gATTTTAATACTATAGTAAGAATAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTATTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTgg < 2:3006069/91‑1 (MQ=255) gATTTTAATACTATAGTAAGAACAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTCTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTgg < 2:3005493/91‑1 (MQ=255) gATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTgg < 2:2454737/91‑1 (MQ=255) gATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTgg < 2:268631/91‑1 (MQ=255) gATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTgg < 2:662238/91‑1 (MQ=255) ttttAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCg < 2:686640/91‑1 (MQ=255) ttttAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCg < 2:291741/91‑1 (MQ=255) tttAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTttactatagtattaaaatcaaaaatgttaaatagaagacatta < 1:934324‑M2/91‑44 (MQ=255) tttAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGTTGTGGCgg > 2:277877/1‑91 (MQ=255) tttAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCgg < 2:1689404/91‑1 (MQ=255) ttAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTTTTTGCGGTGTGGCggt > 2:3947483/1‑91 (MQ=255) ttAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCggt < 1:1039090/91‑1 (MQ=255) tAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGTTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCggtg > 2:2576628/1‑91 (MQ=255) tAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCggtg < 1:1700494/91‑1 (MQ=255) tACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATTTTTTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCggtggtt > 2:2147990/1‑90 (MQ=255) cTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATg > 1:2851861/1‑91 (MQ=255) tataGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATgg < 1:1556649/91‑1 (MQ=255) tataGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATgg > 2:924783/1‑91 (MQ=255) tataGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATgg > 1:526598/1‑91 (MQ=255) tataGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATgg < 2:2239984/91‑1 (MQ=255) aGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGttt > 1:2220477/1‑91 (MQ=255) gTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTTTGGCGGTGGTATGGTTTa > 2:3578129/1‑91 (MQ=255) aaGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTAcc > 1:2504631/1‑91 (MQ=255) aaGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTAcc > 1:1347694/1‑91 (MQ=255) aaGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTCttactatagtattaaaatcaaaaatgtttaatagaagacattacatttctgttctac < 2:2427364‑M2/91‑58 (MQ=255) aGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCt < 2:122062/91‑1 (MQ=255) aaaaGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAg > 2:640427/1‑91 (MQ=255) aaaGTCATAGTGTTATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCGAGt < 2:3508541/91‑1 (MQ=255) aaaGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGt < 1:3418086/91‑1 (MQ=255) aaGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGtt > 1:1783636/1‑91 (MQ=255) gTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTCTACCTAGcttt > 2:3225079/1‑91 (MQ=255) gTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTCttactatagtattaaaatcaaaaatgtttaatagaagacattacatttctgttctacctgcgat < 2:3695091‑M2/91‑65 (MQ=255) tCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTa > 1:2443649/1‑91 (MQ=255) tCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTa > 2:1492450/1‑91 (MQ=255) tCACAGTGAAATCATTGTGGCTTTTCttactatagtattaaaatcaaaaatgtttaatagaagacattacatttctgttctacctgcgatt < 2:3388487‑M2/91‑66 (MQ=255) acaGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACt < 1:890386/91‑1 (MQ=255) caGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTTTTTTTTTGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTg > 2:30355/1‑91 (MQ=255) gtgtAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGG‑TTACCTAGTTTTACTGAgg < 2:3302903/91‑1 (MQ=255) gtAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAggg < 1:1884463/91‑1 (MQ=255) gtAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAggg < 2:1421998/91‑1 (MQ=255) tAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGa < 1:3109888/91‑1 (MQ=255) tAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGa > 2:2539724/1‑91 (MQ=255) tCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATgg > 2:3782415/1‑91 (MQ=255) tCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATgg > 2:607577/1‑91 (MQ=255) cATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATggg < 2:2683076/91‑1 (MQ=255) cttGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGt < 1:148012/90‑1 (MQ=255) tgGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATc < 2:2026805/91‑1 (MQ=255) cTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCttt < 1:2547637/91‑1 (MQ=255) tttttttATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTa < 1:1631785/91‑1 (MQ=255) ttttttATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAg < 2:440042/91‑1 (MQ=255) ttttttATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAg < 2:1881216/91‑1 (MQ=255) tttATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGaa < 1:2689601/91‑1 (MQ=255) tttATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGaa < 1:633277/91‑1 (MQ=255) | AGGTAGAACAGAAATGTAATGTCTTCTATTAAACATTTTTGATTTTAATACTATAGTAAGAAAAGTCACAGTGTAATCATTGTGGCTTTTTTTATGGTGTGGTGTGATGTACTACTTTATTTGCGGTGTGGCGGTGGTATGGTTTACCTAGTTTTACTGAGGGATGGGTAATCTTTAGGAA > USA300TCH1516_ALE/511914‑512094 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |