New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 580739 = | 140 (0.690) | 16 (0.100) | 8/130 | NT | 11.7% | intergenic (+33/‑48) | USA300HOU_RS02805/sigH | hypothetical protein/RNA polymerase sigma‑H factor |
? | USA300TCH1516_ALE | 580788 = | 129 (0.780) | coding (2/570 nt) | sigH | RNA polymerase sigma‑H factor |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
AAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTAATGGATCTAC > USA300TCH1516_ALE/580698‑580877 | gAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTATATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGa < 2:3277606/91‑1 (MQ=255) gAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGa < 1:1069080/91‑1 (MQ=255) aaaTGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGaa < 2:2376772/91‑1 (MQ=255) aaaTGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGaa > 2:2714318/1‑91 (MQ=255) aaTGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGaaa < 2:1769880/91‑1 (MQ=255) aTGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAAt < 1:519326/91‑1 (MQ=255) aTGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAAt < 2:1873785/91‑1 (MQ=255) aTGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAAt > 1:2808312/1‑91 (MQ=255) tGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATa > 2:3734375/1‑91 (MQ=255) tGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATa < 1:3605977/91‑1 (MQ=255) gACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATAc > 1:1728181/1‑91 (MQ=255) aCATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACg < 1:2924468/91‑1 (MQ=255) aCATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACg > 1:2290495/1‑91 (MQ=255) aCATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACg > 1:224735/1‑91 (MQ=255) cATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGa > 2:1590703/1‑91 (MQ=255) aTTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTATTATTTGAAATACGAt < 2:591105/91‑1 (MQ=255) aTTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGAt < 2:2785180/91‑1 (MQ=255) tttCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGAtt > 2:2571928/1‑91 (MQ=255) tCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTg > 1:266526/1‑91 (MQ=255) cGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGAc < 1:2656612/91‑1 (MQ=255) aTCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACt > 2:1133630/1‑91 (MQ=255) tCTTGAAAATTTGAATGTAACAATAATAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTc < 2:3431116/91‑1 (MQ=255) cTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCa < 1:1906819/91‑1 (MQ=255) ttGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCaa > 2:429750/1‑91 (MQ=255) gAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGa > 1:1372840/1‑91 (MQ=255) gAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGa > 2:3589591/1‑91 (MQ=255) aaaTTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGAc < 1:977647/91‑1 (MQ=255) aaaTTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGAc > 2:2045984/1‑91 (MQ=255) ttttGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGt < 2:53751/91‑1 (MQ=255) ttttGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGt < 1:1648660/91‑1 (MQ=255) tttGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTa > 2:3952716/1‑91 (MQ=255) ttGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTAc < 1:3094712/91‑1 (MQ=255) tGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACa > 2:1744433/1‑91 (MQ=255) aaTGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAAt > 1:1181500/1‑91 (MQ=255) aaTGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAAt < 1:1922280/91‑1 (MQ=255) aaTGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGCTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAAt < 1:3160912/91‑1 (MQ=255) tatttcaaatattaaactaaccccttctatctaaaatttaaggttagtttaatattTGAAATACGATTTGACAATTCAAGACAGTACAATc > 2:3041195‑M2/57‑91 (MQ=255) aTGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATc < 1:3233326/91‑1 (MQ=255) tAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCaaa > 1:859098/1‑91 (MQ=255) aaCAATATTAAACTAAGCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAAc < 2:3786309/91‑1 (MQ=255) aaCAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAAc < 1:2171534/91‑1 (MQ=255) aCAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACg > 2:2869673/1‑91 (MQ=255) AATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTa > 2:3889890‑M1/1‑91 (MQ=255) ATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTaa < 1:1970761‑M1/91‑1 (MQ=255) ATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTaa > 1:2685793‑M1/1‑91 (MQ=255) ATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTaa < 1:2492824‑M1/91‑1 (MQ=255) ATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACATaa < 1:3065090‑M1/91‑1 (MQ=255) TATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAAc > 1:2979505‑M1/1‑91 (MQ=255) TATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAAc < 1:96337‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACa > 2:242476‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACa < 1:135071‑M1/91‑1 (MQ=255) ttaaactaaccccttctatctaaaatttaaggttagtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACaa > 1:139765‑M2/46‑91 (MQ=255) TTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACaa > 1:2548345‑M1/1‑91 (MQ=255) taaactaaccccttctatctaaaatttaaggttagtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAAcaag > 2:3927729‑M2/45‑90 (MQ=255) TAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAAt > 1:502706‑M1/1‑91 (MQ=255) aaactaaccccttctatctaaaatttaaggttagtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTTAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATg > 2:826986‑M2/44‑91 (MQ=255) aaactaaccccttctatctaaaatttaaggttagtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATg > 1:3039504‑M2/44‑91 (MQ=255) aaactaaccccttctatctaaaatttaaggttagtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATg > 1:2045403‑M2/44‑91 (MQ=255) AAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATg < 1:468727‑M1/91‑1 (MQ=255) AAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATg < 1:911386‑M1/91‑1 (MQ=255) AAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATg < 1:798881‑M1/91‑1 (MQ=255) taaccccttctatctaaaatttaaggttagtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAAt > 2:1988354‑M2/40‑91 (MQ=255) AACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATa > 2:1692105‑M1/1‑91 (MQ=255) AACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATa > 2:2126786‑M1/1‑91 (MQ=255) ACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAGTaa < 1:3553849‑M1/91‑1 (MQ=255) ccccttctatctaaaatttaaggttagtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATaaa > 1:214885‑M2/37‑91 (MQ=255) CCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATaaa > 1:3815441‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATaaa > 1:3489793‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATaaa < 1:704296‑M1/91‑1 (MQ=255) CTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAAt > 2:2450418‑M1/1‑91 (MQ=255) tAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGa < 2:2915751/91‑1 (MQ=255) aaaTTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGAt < 1:716598/91‑1 (MQ=255) aaaTTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGAt < 2:44667/91‑1 (MQ=255) aTTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATaa < 2:1468646/91‑1 (MQ=255) tagatagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGAc < 1:1168597/91‑1 (MQ=255) agatagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACt < 1:3347098/91‑1 (MQ=255) agatagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACt > 1:3530217/1‑91 (MQ=255) gatagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACtt < 2:2136007/91‑1 (MQ=255) gatagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACtt > 2:1366300/1‑91 (MQ=255) atagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTc < 1:1233703/91‑1 (MQ=255) tagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCg > 1:2453560/1‑91 (MQ=255) gaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCACGACAGTACAATCAAAAGTAACAATGCAATAAATGAAAAAGACTTCGaa > 2:1884700/1‑91 (MQ=255) aGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGaaaa < 2:2327797/91‑1 (MQ=255) aGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGaaaa > 1:2643450/1‑91 (MQ=255) aGGGGTTAGTTGAATATTTGAAAGACGATTTGACAACTCAAGACAGTACGATCAAACGTTACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGaaaa < 2:3013509/91‑1 (MQ=255) gggTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGt < 2:3238435/91‑1 (MQ=255) ggttagtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGtt > 2:853906‑M2/16‑91 (MQ=255) gttagtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTa < 2:1080492‑M2/77‑1 (MQ=255) tagtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGt < 1:2091091‑M2/79‑1 (MQ=255) gtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTaa < 1:2877276‑M2/81‑1 (MQ=255) gtttaatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTaa > 2:2648912‑M2/11‑91 (MQ=255) gtttaatattTGAAATACGATTTGACAACGCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTaa < 2:1292823‑M2/81‑1 (MQ=255) taatattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTAATgg < 1:1309558‑M2/84‑1 (MQ=255) atattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTAATGGAt > 2:1079720‑M2/6‑91 (MQ=255) tattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTAATGGATc < 1:3655341‑M2/87‑1 (MQ=255) tattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTAATGGATc > 1:442498‑M2/5‑91 (MQ=255) tattTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTAATGGATc > 1:1815921‑M2/5‑91 (MQ=255) attTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTAATGGATCt < 1:378170‑M2/88‑1 (MQ=255) ttTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTAATGGATCTa > 2:717840‑M2/3‑91 (MQ=255) tTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTAATGGATCTAc < 2:1047505‑M2/90‑1 (MQ=255) | AAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGTTAGTAATGGATCTAC > USA300TCH1516_ALE/580698‑580877 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |