New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 598632 = | 108 (0.530) | 10 (0.060) | 5/124 | NT | 9.3% | intergenic (+181/+101) | tuf/yxeP_2 | Elongation factor Tu/putative hydrolase YxeP |
? | USA300TCH1516_ALE | 598687 = | 112 (0.710) | intergenic (+236/+46) | tuf/yxeP_2 | Elongation factor Tu/putative hydrolase YxeP |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
GTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTATGATTTTTAAAAA > USA300TCH1516_ALE/598598‑598777 | gTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCa < 1:73715/91‑1 (MQ=255) gTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTCTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCa < 1:3775068/91‑1 (MQ=255) tttAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCAt < 2:3625353/91‑1 (MQ=255) ttAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCAtt < 1:729834/91‑1 (MQ=255) taaatgaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTa < 2:3205963/91‑1 (MQ=255) aaataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAg > 2:1726116/1‑91 (MQ=255) aaataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAg < 1:1799851/91‑1 (MQ=255) aaataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCATTCAAAGTTTTCATTTTTTTCATTTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAg > 2:1941116/1‑91 (MQ=37) aataagATTGTTGAGTCTTGGACATGGTAAAATGCTCCCGTCAAAGTTTTCATGTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt < 1:3672537/91‑1 (MQ=37) aataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTTTATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt > 2:2416401/1‑91 (MQ=255) aataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt < 1:2489885/91‑1 (MQ=255) aataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt < 1:3303403/91‑1 (MQ=255) ataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGtt < 1:1666882/91‑1 (MQ=255) ataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGtt < 1:2746460/91‑1 (MQ=255) ataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGtt < 2:839042/91‑1 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg > 2:915619/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTCCATTAGTTTATg > 2:3286762/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTCTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg > 2:3482274/1‑91 (MQ=255) aTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGt < 1:2473879/91‑1 (MQ=255) tgttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGtct < 1:3646130/91‑1 (MQ=255) ttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCa > 2:1635237/1‑91 (MQ=255) tgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAg > 2:3935867/1‑91 (MQ=255) gTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGAtt > 1:598680/1‑91 (MQ=255) tCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTc < 1:3940347/91‑1 (MQ=255) tCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTc > 1:1036861/1‑91 (MQ=255) cTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCa < 1:3517158/91‑1 (MQ=255) cTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCa < 1:1164694/91‑1 (MQ=255) cTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCAGTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCa > 1:3684425/1‑91 (MQ=255) ttGGTCATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCat < 1:3286677/91‑1 (MQ=255) ttGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCat < 1:1538863/91‑1 (MQ=255) ggACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCCCAGATTCatat > 1:510901/1‑91 (MQ=255) ataTTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCt < 2:807891/89‑1 (MQ=255) aCATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCt > 2:3302751/1‑91 (MQ=255) cATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCtt < 2:2676322/91‑1 (MQ=255) ttGTAAATTTCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCATATTCATATCTTTc < 2:581245/91‑1 (MQ=255) ttGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCCTTTTTTCAATGTCTACTTCGAAGGGAGCATTTCATTAGTCTATGTCTCAGCTTCCTATCttcc > 2:1313805/1‑89 (MQ=21) tAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaat < 2:622804/91‑1 (MQ=255) aaaaTGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaatt > 1:313359/1‑91 (MQ=255) AAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaatta < 2:2042187‑M1/91‑1 (MQ=255) AATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaattaa > 2:92398‑M1/1‑91 (MQ=255) ATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaattaat < 1:2911464‑M1/91‑1 (MQ=255) CCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAAt < 2:1980658‑M1/91‑1 (MQ=255) CTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATg > 1:2728964‑M1/1‑91 (MQ=255) TCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTATTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTAAAATGCt > 2:3003697‑M1/1‑91 (MQ=255) aagtagacattgaaaaaatgaaaactttgaagggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTaa > 1:981805‑M2/42‑91 (MQ=255) AAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTaa > 2:2817892‑M1/1‑91 (MQ=255) agtagacattgaaaaaatgaaaactttgaagggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAt > 1:1004131‑M2/41‑91 (MQ=255) agtagacattgaaaaaatgaaaactttgaagggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAt > 1:3012572‑M2/41‑91 (MQ=255) AGTTTTCATTTTTTCAATGTCTCCTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTACATGCTTAAt < 2:294313‑M1/91‑1 (MQ=255) AGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTCTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAt < 1:3959693‑M1/91‑1 (MQ=255) gtagacattgaaaaaatgaaaactttgaagggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAtt > 1:179416‑M2/40‑91 (MQ=255) GTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTTATTCGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAtt < 2:1089442‑M1/91‑1 (MQ=255) tagacattgaaaaaatgaaaactttgaagggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAttt > 2:472485‑M2/39‑91 (MQ=255) tttCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTg > 1:2133973/1‑91 (MQ=255) ttCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGt < 2:3647284/91‑1 (MQ=255) ttCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGt > 2:754736/1‑91 (MQ=255) gacattgaaaaaatgaaaactttgaagggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGt > 1:3842045‑M2/37‑91 (MQ=255) tCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGtt > 2:1600810/1‑91 (MQ=255) cATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGttt > 2:2524587/1‑91 (MQ=255) cATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGttt > 2:2140974/1‑91 (MQ=255) aTTTTTTCTATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTAGGTCTCAGATTAATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGtttt < 2:3916432/91‑1 (MQ=255) aTTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGtttt > 1:3489441/1‑91 (MQ=255) aTTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGtttt < 1:873764/91‑1 (MQ=255) ttttttCGATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTa < 2:1203401/91‑1 (MQ=255) ttttttCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTa < 2:3346782/91‑1 (MQ=255) ttttCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTaaa > 1:803557/1‑91 (MQ=255) ttttCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTaaa < 2:396371/91‑1 (MQ=255) tttCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAAt < 1:1210148/91‑1 (MQ=255) tttCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAAt < 2:270112/91‑1 (MQ=255) cAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACt > 1:1747653/1‑91 (MQ=255) aaTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACtt < 1:3806900/91‑1 (MQ=255) aaTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACtt < 1:130769/91‑1 (MQ=255) aTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTg > 1:3869524/1‑91 (MQ=255) aTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTg > 1:2234377/1‑91 (MQ=255) aTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTg > 1:2689442/1‑91 (MQ=255) tGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGc > 1:541938/1‑91 (MQ=255) gTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTATTTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGct < 2:3887238/91‑1 (MQ=255) gTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGct < 1:646625/91‑1 (MQ=255) gTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGct < 1:2619871/91‑1 (MQ=255) gTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGct < 2:1537590/91‑1 (MQ=255) tCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGctc < 1:1294241/91‑1 (MQ=255) tCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGctc < 2:2984189/91‑1 (MQ=255) tCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGctc < 1:3397195/91‑1 (MQ=255) cTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGctct > 2:375997/1‑91 (MQ=255) cTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGctct < 2:3414948/91‑1 (MQ=255) actttgaagggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTaa < 2:2382543‑M2/73‑1 (MQ=255) ctttgaagggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACttgctctttt > 2:1883233‑M2/18‑88 (MQ=255) tttgaagggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAAtt > 1:1095248‑M2/17‑91 (MQ=255) gaagggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTa > 1:2010170‑M2/14‑91 (MQ=255) gaagggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTa > 1:958518‑M2/14‑91 (MQ=255) gggagcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACGTGCTCTAATTCTATGa > 2:3032263‑M2/11‑91 (MQ=255) agcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTATGAttt > 1:49166‑M2/8‑91 (MQ=255) agcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTATGAttt > 2:2021435‑M2/8‑91 (MQ=255) aGCATTGCATTAGCTTATGTCTCAGCTACATAACTTTCCAGTAATTTCAATGCTTAATTCGCATTAAATACTTGCTCTCATACTATgctct > 2:2293228/1‑87 (MQ=255) gcatttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCACATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTATGAtttt < 1:3179226‑M2/85‑1 (MQ=255) catttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTATGAttttt > 2:1272841‑M2/6‑91 (MQ=255) tttCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTATGATTTTTaa > 2:2185112‑M2/4‑91 (MQ=255) tCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTATGATTTTTaaaa > 2:2098653‑M2/2‑91 (MQ=255) cATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTACATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTATGATTTTTaaaaa > 1:3417418/1‑91 (MQ=255) cATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTATGATTTTTaaaaa < 2:627222/91‑1 (MQ=255) | GTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTAATTCTATGATTTTTAAAAA > USA300TCH1516_ALE/598598‑598777 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |