| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 598649 | 110 (0.540) | 7 (0.040) | 4/124 | NT | 6.6% | intergenic (+198/+84) | tuf/yxeP_2 | Elongation factor Tu/putative hydrolase YxeP |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 598668 | 112 (0.710) | intergenic (+217/+65) | tuf/yxeP_2 | Elongation factor Tu/putative hydrolase YxeP | |||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
AACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTA > USA300TCH1516_ALE/598578‑598758 | aaCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCt < 2:2213053/91‑1 (MQ=255) aCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTa < 1:762116‑M2/91‑2 (MQ=255) aCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTa < 1:3434915‑M2/91‑2 (MQ=255) aCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTa < 1:183505‑M2/91‑2 (MQ=255) aCTTACAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTa > 2:3634835‑M2/1‑90 (MQ=255) cTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAACATTGTTGAGTCTTGGACATTGTACAATGCTGCCTCCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTac > 2:3026915‑M2/1‑89 (MQ=255) aattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTAc > 1:179627‑M1/53‑91 (MQ=255) attaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACt > 1:1004131‑M1/52‑91 (MQ=255) attaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACt > 1:3012572‑M1/52‑91 (MQ=255) ttaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACtt > 1:981328‑M1/51‑91 (MQ=255) ataACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTacttt < 2:2900839‑M2/91‑6 (MQ=255) taACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttg < 1:1632233‑M2/91‑7 (MQ=255) aaCTGATAATACTGTGTAAATAAAATGGTTGAGTCTTGGACAGTGTAAAAGGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttga > 1:177362‑M2/1‑84 (MQ=255) aCTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTTCAATGTCTcctttga < 2:3174815‑M2/91‑8 (MQ=255) aCTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaa > 1:615077‑M2/1‑83 (MQ=255) cTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGTCATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaag < 1:3329191‑M2/91‑10 (MQ=255) cTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaag < 1:2388254‑M2/91‑10 (MQ=255) cTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaag < 1:1645563‑M2/91‑10 (MQ=255) tGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaagg > 2:583145‑M2/1‑81 (MQ=255) ataataCTGCTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaaggga < 1:1980859‑M2/91‑13 (MQ=255) aataCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaagggagc > 1:1332385‑M2/1‑77 (MQ=255) ataCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaagggagca > 2:3624055‑M2/1‑76 (MQ=255) taCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaagggagcat > 2:619330‑M2/1‑75 (MQ=255) taCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaagggagcat < 2:2128247‑M2/91‑17 (MQ=255) taCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaagggagcat > 1:1097482‑M2/1‑75 (MQ=255) cTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaagggagcattt < 2:2599575‑M2/91‑19 (MQ=255) gTTTAAATGAAATTGGTGAGTCTTGGTCATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCa < 2:3426369/91‑1 (MQ=25) gTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTCTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCa < 1:3775068/91‑1 (MQ=255) atttAAATAAAATTGTTGAGTCTTAGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑AAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCa < 2:2347087/90‑1 (MQ=255) tttAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCAt < 1:2012470/91‑1 (MQ=255) aaataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAg < 1:732066/91‑1 (MQ=255) aaataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCATTCAAAGTTTTCATTTTTT‑TCATTTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAg > 2:1941116/1‑91 (MQ=37) aataagATTGTTGAGTCTTGGACATCGTAAAATGCTCCCGTCAAAGTTTTCATGTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt < 1:3673451/91‑1 (MQ=37) aataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt < 1:2486953/91‑1 (MQ=255) aataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt < 1:536138/91‑1 (MQ=255) ataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGtt < 1:2746460/91‑1 (MQ=255) aaaaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTa < 1:3816870/91‑1 (MQ=255) aaaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAGGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTAt > 2:3244805/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg > 2:916099/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg > 1:490561/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg < 1:598573/91‑1 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg < 1:3145887/91‑1 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTACATTAGTTTATg > 2:3286984/1‑91 (MQ=255) tgttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGtct < 1:3646130/91‑1 (MQ=255) tgttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGtct < 1:3294694/91‑1 (MQ=255) ttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCa < 2:2980581/91‑1 (MQ=255) ttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCa > 2:3487092/1‑91 (MQ=255) ttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCa > 2:1635237/1‑91 (MQ=255) gtgAGTCTTGGACATTGTAAGATGCTCCCTTCAAAGATTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCa < 2:3912059/90‑1 (MQ=255) tCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTc < 2:3366106/91‑1 (MQ=255) tCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTc > 1:1036861/1‑91 (MQ=255) cTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCa < 1:1164694/91‑1 (MQ=255) cTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCa < 1:3517158/91‑1 (MQ=255) ggACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCatat < 1:2501571/91‑1 (MQ=255) aCATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCt > 2:3302751/1‑91 (MQ=255) cATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCtt < 2:2676322/91‑1 (MQ=255) aTTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACGTCGAAGGGAGCATTTCAATAGTTTATGTCTCAGCTTCATATCttt > 2:1724576/1‑91 (MQ=21) ttGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCCTTTTTT‑CAATGTCTACTTCGAAGGGAGCATTTCATTAGTCTATGTCTCAGCTTCCTATCttcc > 2:1313805/1‑89 (MQ=21) ttGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGCAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTc > 2:363305/1‑91 (MQ=255) tGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCa < 1:3485945/91‑1 (MQ=255) gTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaa > 2:472366/1‑91 (MQ=255) tAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaat < 2:3845369/91‑1 (MQ=255) tAAAATGCGCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTGATGTCTCAGATTCATATCTTTCgat < 2:622903/91‑1 (MQ=255) aaaaTGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTATACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaatt < 2:880776/91‑1 (MQ=255) AAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaatta < 2:2042187‑M1/91‑1 (MQ=255) ATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaattaat < 1:2911464‑M1/91‑1 (MQ=255) ATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaattaat > 2:827513‑M1/1‑91 (MQ=255) CCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTaaa < 2:2888638‑M1/91‑1 (MQ=255) CCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAAt < 2:1980658‑M1/91‑1 (MQ=255) CTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATg > 1:2728964‑M1/1‑91 (MQ=255) CTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATg > 1:3923518‑M1/1‑91 (MQ=255) TTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGc > 2:1257063‑M1/1‑91 (MQ=255) TCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTATTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTAAAATGCt > 2:3003697‑M1/1‑91 (MQ=255) TCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCt < 2:529454‑M1/91‑1 (MQ=255) cgAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCtt > 2:3962848‑M1/3‑91 (MQ=255) cAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaagggagcattttacaatgtccaagactcaacaattttatttaaacagtattatcagcta < 2:304732‑M2/91‑67 (MQ=255) AAAGTCTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTa > 2:3648582‑M1/1‑91 (MQ=255) gTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTactttgaagggagcattttacaatgtccaagactcaacaattttatttaaacagtattatcagttataag < 2:139557‑M2/91‑71 (MQ=255) tttCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTg > 1:2133973/1‑91 (MQ=255) tttCATTGTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTGGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTg < 2:2789126/91‑1 (MQ=255) ttCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGt > 2:754736/1‑91 (MQ=255) ttCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGt < 1:1303041/91‑1 (MQ=255) ttCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGt < 2:1010108/91‑1 (MQ=255) ttCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGt < 1:3784991/91‑1 (MQ=255) tCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGtt > 2:1600810/1‑91 (MQ=255) cATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGttt < 2:1176416/91‑1 (MQ=255) cATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGttt > 2:2140974/1‑91 (MQ=255) aTTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGtttt < 2:3916522/91‑1 (MQ=255) aTTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGtttt > 1:311711/1‑91 (MQ=255) aTTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGtttt > 1:799290/1‑91 (MQ=255) cAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACt > 1:1747653/1‑91 (MQ=255) aTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTg < 1:833770/91‑1 (MQ=255) aTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTg > 1:2234377/1‑91 (MQ=255) aTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTg > 1:2689442/1‑91 (MQ=255) tGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGc < 1:1293050/91‑1 (MQ=255) gTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGct < 1:646625/91‑1 (MQ=255) gTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGct < 2:1537590/91‑1 (MQ=255) tCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACGTGctc < 2:2490447/91‑1 (MQ=255) tACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTa > 1:1623267/1‑91 (MQ=255) tACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTa > 1:3940907/1‑91 (MQ=255) | AACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTT‑CAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCTCTA > USA300TCH1516_ALE/598578‑598758 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |