| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 646665 | 171 (0.840) | 17 (0.100) | 9/140 | NT | 10.0% | intergenic (+19/‑568) | lipL/galK | Octanoyl‑[GcvH]:protein N‑octanoyltransferase/Galactokinase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 646681 | 158 (0.890) | intergenic (+35/‑552) | lipL/galK | Octanoyl‑[GcvH]:protein N‑octanoyltransferase/Galactokinase | |||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
CGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCATTAAATTAAAAGTAATG > USA300TCH1516_ALE/646591‑646771 | cgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGttt > 1:1402264/1‑91 (MQ=255)cgTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGttt > 1:169120/1‑91 (MQ=255) tgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTgg > 1:864389‑M1/64‑91 (MQ=255) tgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTgg > 1:1326755‑M1/64‑91 (MQ=255) tgatgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTgg > 1:2857909‑M1/64‑91 (MQ=255) aTTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggg < 2:1216871‑M2/91‑4 (MQ=255) atgttcaatttaaatattaggtcaaaaacatatttatgctttttatggatactctcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTgggg > 1:3328602‑M1/62‑91 (MQ=255) tttGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggggc < 1:1027022‑M2/91‑6 (MQ=255) tttGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggggc < 2:1816884‑M2/91‑6 (MQ=255) tgttcaatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGc > 1:195270‑M1/61‑91 (MQ=255) tgttcaatttaaatattaggtcaataacagatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGc > 2:3764499‑M1/61‑91 (MQ=255) ttGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggggct > 1:3896662‑M2/1‑85 (MQ=255) ttGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggggct > 1:234916‑M2/1‑85 (MQ=255) gttcaatttaaagattaggtcaataacatatgtatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCt > 2:1587190‑M1/60‑91 (MQ=255) ttcaatttaaatattaggtcaataacatctttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTg > 2:268040‑M1/59‑91 (MQ=255) gATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggggctgt > 1:732561‑M2/1‑83 (MQ=255) caatttaaatattaggtcaataacatatttatgctttttatggatactttcaaaaaTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGtt > 1:2553327‑M1/57‑91 (MQ=255) tAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggggctgtta < 1:2088212‑M2/91‑11 (MQ=255) tAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggggctgtta > 2:1688486‑M2/1‑81 (MQ=255) tAAAATCATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggggctatta < 1:3068846‑M2/91‑11 (MQ=255) aaaaTGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTAt > 1:2420882/1‑91 (MQ=255) aaTGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTAttt > 2:3795829/1‑91 (MQ=255) aTGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCATTAGTTAAATACTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTAtttt > 2:1628176/1‑91 (MQ=255) aTGATTAAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTAtttt > 2:3317605/1‑91 (MQ=255) tGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTAttttt < 2:2748792/91‑1 (MQ=255) gATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTCTCGTTCGGGGCTGTTATTTTTg > 2:1491831/1‑91 (MQ=255) gATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTg < 2:3022539/91‑1 (MQ=255) ttGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGaa > 1:630165/1‑91 (MQ=255) aggaaaCAAGAAGATGATATATCAAATGCAGTAGTTAAGTATGTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGTGGCTGTTATTTTTGAAAGTa < 2:2575665/89‑1 (MQ=255) agaaaCAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTAt > 1:1563051/1‑91 (MQ=255) aaaCAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATcc < 1:2999085/91‑1 (MQ=255) aaCAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCa < 1:1751841/91‑1 (MQ=255) aCAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCAt > 1:753318/1‑91 (MQ=255) cAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATa > 2:2806679/1‑91 (MQ=255) aGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATaaa > 2:2718449/1‑91 (MQ=255) aGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATaaa > 2:1715780/1‑91 (MQ=255) gAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATaaaa < 1:1207931/91‑1 (MQ=255) gAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATaaaa > 1:1903570/1‑91 (MQ=255) aaaaTGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATaaaaa > 2:3866876/1‑91 (MQ=255) aaTGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCGATAAAAAGc < 1:1979481/91‑1 (MQ=255) aaTGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGc > 1:541023/1‑91 (MQ=255) aaTGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGc < 1:275242/91‑1 (MQ=255) aTAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATaa > 2:1667604/1‑91 (MQ=255) aTAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATaa > 2:2849528/1‑91 (MQ=255) tAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATaaa < 2:2047978/91‑1 (MQ=255) aGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAat > 1:2881883/1‑91 (MQ=255) gATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAata < 1:3100228/91‑1 (MQ=255) aTCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAatat < 2:1118588/91‑1 (MQ=255) aTCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAatat < 1:1080458/91‑1 (MQ=255) tCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATg > 2:2452970/1‑91 (MQ=255) ctaaTGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGt < 2:138418/89‑1 (MQ=255) aaTAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGAc > 2:655006/1‑91 (MQ=255) aTAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGAcc > 2:1422725/1‑91 (MQ=255) aTAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTAATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATACAGCTGTTATTGAcc > 2:1485542/1‑91 (MQ=255) tAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCt > 2:829614/1‑91 (MQ=255) tAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCt > 2:2535817/1‑91 (MQ=255) aGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggggctgttaaatatttaactattgcatttgatctatcattttcttgtttcttt < 1:2190483‑M2/91‑55 (MQ=255) aGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTa > 1:230856/1‑91 (MQ=255) gTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTaa < 2:2427775/91‑1 (MQ=255) tAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAata < 1:1370385/91‑1 (MQ=255) agtgtttAACAGCCCGGTTCAAGTTATGGTTGGGGGCGGGTATGTTTGAGGGTATCCATAAAGAGCATGAAGATGTTATTGACCTAATAtt < 2:1558049/87‑1 (MQ=255) aaTATTTAACAGCCCGTTTCAAGTTGTCGTTTGGGGCTG‑TATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATAttt < 2:3423899/91‑1 (MQ=255) aaTATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATAtt < 2:418903/91‑1 (MQ=255) atatTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATAttt < 1:872178/91‑1 (MQ=255) ttAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAAt > 1:416577/1‑91 (MQ=255) ttAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAAt > 1:2659734/1‑91 (MQ=255) TAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTACAtt < 1:3559149‑M1/91‑1 (MQ=255) aaCAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTggggctgttaaatatttaactattgcatttgatctatcattttcttgtttctttcaatcattttat < 2:1790967‑M2/91‑67 (MQ=255) ACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGa < 2:2936813‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATATTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAAca > 1:3362152‑M1/1‑91 (MQ=255) cccTTTCAAGTTATCGTTTggggctgttaaatatttaactattgcatttgatctatcattttcttgtttctttcaatcattttatcaaaat < 1:1619810‑M2/91‑73 (MQ=255) CCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAAcatc < 2:90329‑M1/91‑1 (MQ=255) CCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAAcatc < 1:3460397‑M1/91‑1 (MQ=255) ccTTTCAAGTTATCGTTTggggctgttaaatatttaactattgcatttgatctatcattttcttgtttctttcaatcattttatcaaaata < 1:3760113‑M2/91‑74 (MQ=255) CCTTTCAAGTTATCGTTTTTGTCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAAcatca > 1:1174704‑M1/1‑91 (MQ=255) CTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAAcatcat > 1:4417‑M1/1‑91 (MQ=255) CTTTCAAGTTATCGAATAGGGATGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTgaacataaa > 2:1402060‑M1/1‑88 (MQ=255) tttCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCatt > 1:577860/1‑91 (MQ=255) tttCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCatt > 1:2574501/1‑91 (MQ=255) ttCAAGTTATCGTTTggggctgttaaatatttaactattgcatttgatctatcattttcttgtttctttcaatcattttatcaaaatacgt < 2:2238998‑M2/91‑77 (MQ=255) ttCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCatta < 1:3612355/91‑1 (MQ=255) ttCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCatta > 2:3180480/1‑91 (MQ=255) tCAAGTTATCGTTTggggctgttaaatntttaactattgcatttgatctatcattttcttgtttctttcaatcattttatcaaaatacgta < 1:3223818‑M2/91‑78 (MQ=255) tCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCattaa > 1:3655682/1‑91 (MQ=255) cAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCattaaa > 1:3829547/1‑91 (MQ=255) cAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCattaaa > 2:860844/1‑91 (MQ=255) cAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCattaaa > 1:1241550/1‑91 (MQ=255) aGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCattaaatt > 1:2815415/1‑91 (MQ=255) aGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCattaaatt < 1:2593188/91‑1 (MQ=255) aGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTATTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCattaaatt > 2:3578326/1‑91 (MQ=255) tATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCAttaaattaaa > 2:1287015/1‑91 (MQ=255) tATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCAttaaattaaa > 2:2570386/1‑91 (MQ=255) attgTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCATTAAATTaaaa > 2:1241676/4‑91 (MQ=255) tttGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCATTAAATTAAAAGTaa > 2:2206942/1‑91 (MQ=255) tttGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCATTAAATTAAAAGTaa > 1:2154359/1‑91 (MQ=255) tttGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCATTAAATTAAAAGTaa > 1:977094/1‑91 (MQ=255) ttGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCATTAAATTAAAAGTAat < 2:2307087/91‑1 (MQ=255) ttGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCATTAAATTAAAAGTAat > 1:1155823/1‑91 (MQ=255) tGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCATTAAATTAAAAGTAatg > 2:552391/1‑91 (MQ=255) tGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATGTAAATTGAACATCATTACATTAAAAGTAatg > 2:303351/1‑91 (MQ=255) | CGTATTTTGATAAAATGATTGAAAGAAACAAGAAAATGATAGATCAAATGCAATAGTTAAATATTTAACAGCCCCTTTCAAGTTATCGTTTGGGGCTGTTATTTTTGAAAGTATCCATAAAAAGCATAAATATGTTATTGACCTAATATTTAAATTGAACATCATTAAATTAAAAGTAATG > USA300TCH1516_ALE/646591‑646771 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |