New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 729254 = | 166 (0.810) | 22 (0.130) | 11/136 | NT | 13.3% | intergenic (+55/‑96) | USA300HOU_RS03535/aes | hypothetical protein/Acetyl esterase |
? | USA300TCH1516_ALE | 729295 = | 147 (0.850) | intergenic (+96/‑55) | USA300HOU_RS03535/aes | hypothetical protein/Acetyl esterase |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
TATGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACGATGATAACTGC > USA300TCH1516_ALE/729205‑729384 | tatGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCttttt < 2:2668181/91‑1 (MQ=255) atGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTta < 1:521797/91‑1 (MQ=255) tGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTtat > 2:1342922/1‑91 (MQ=255) tGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTtat < 1:904028/91‑1 (MQ=255) gAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTtata < 2:976227/91‑1 (MQ=255) gAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTtata < 1:3531479/91‑1 (MQ=255) gAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTtata > 2:3503141/1‑91 (MQ=255) aGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTatat > 2:1498125/1‑91 (MQ=255) ggATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTAtattt < 1:2790790/91‑1 (MQ=255) ggATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTAtattt < 1:100177/91‑1 (MQ=255) ggATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTAtattt > 2:457114/1‑91 (MQ=255) atatCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTAtatttat < 1:2263606/91‑1 (MQ=255) atatCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTAtatttat < 2:3579975/91‑1 (MQ=255) atCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTc < 1:1457766/91‑1 (MQ=255) atCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTc < 1:533685/91‑1 (MQ=255) atCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTc > 1:2292215/1‑91 (MQ=255) ccGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAg < 2:3228999/91‑1 (MQ=255) ccGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTATGTACCTTAATACCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAg < 1:1454620/91‑1 (MQ=255) cGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGt > 2:1199609/1‑91 (MQ=255) gAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTc < 1:98957/91‑1 (MQ=255) aaaCTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCt < 2:760920/91‑1 (MQ=255) aaaCTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCt > 2:3074290/1‑91 (MQ=255) aaCTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTa > 2:269237/1‑91 (MQ=255) ttACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTaa > 1:1432572/1‑91 (MQ=255) tACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAat < 1:3407557/91‑1 (MQ=255) aCAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAata < 2:2146973/91‑1 (MQ=255) aaTTCAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAACATg > 1:3118830/1‑91 (MQ=255) ttGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAg < 1:2157782/91‑1 (MQ=255) tGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGc > 2:1873183/1‑91 (MQ=255) tGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTATACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGc > 1:3333389/1‑91 (MQ=255) gAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCTATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTACTATGAGCg > 2:3649313/1‑91 (MQ=255) tCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCt < 2:1723831/91‑1 (MQ=255) aCTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTaa > 2:1785811/1‑91 (MQ=255) aCTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTaa > 2:1531671/1‑91 (MQ=255) aCTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTaa > 1:197174/1‑91 (MQ=255) cTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAAc < 1:2582669/91‑1 (MQ=255) tttGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACa < 1:2758241/91‑1 (MQ=255) ttGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACaa < 2:3745088/91‑1 (MQ=255) gTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAAt > 2:1992309/1‑91 (MQ=255) gTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAAt > 1:3793922/1‑91 (MQ=255) tttAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATag < 1:73546/91‑1 (MQ=255) tttAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATag > 1:2718914/1‑91 (MQ=255) aaCCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGACTTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATagaga > 2:3080439/1‑91 (MQ=255) aCCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATCCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATagagag > 1:2015209/1‑91 (MQ=255) cTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGt < 2:294130/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGCGAGGTa < 1:3077074/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTa < 1:2433076/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTa < 2:1150340/91‑1 (MQ=255) tAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTAc > 2:3393996/1‑91 (MQ=255) AAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACg > 2:773209‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGa > 1:3650599‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGa < 1:3609119‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGa > 1:1872956‑M1/1‑91 (MQ=255) aagcaattcgcccgataagagtagagacgaattgcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGAt > 1:1560596‑M2/40‑91 (MQ=255) AGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATg > 1:392678‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATg < 2:838251‑M1/91‑1 (MQ=255) gcaattcgcccgataagagtagagacgaattgcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGt > 2:805216‑M2/38‑91 (MQ=255) gcaattcgcccgataagagtagagacgaattgcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGt > 1:3025799‑M2/38‑91 (MQ=255) CAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTa > 2:1494404‑M1/1‑91 (MQ=255) AATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTaa > 2:3146615‑M1/1‑91 (MQ=255) AATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTaa < 1:289052‑M1/91‑1 (MQ=255) attcgcccgataagagtagagacgaattgcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAAt > 1:1784779‑M2/35‑91 (MQ=255) ATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAAt < 1:721891‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAAt < 1:2228504‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAAt > 1:2903073‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAAt > 1:293215‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAAt < 1:3310099‑M1/91‑1 (MQ=255) ttcgcccgataagagtagagacgaattgcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATg > 1:1151961‑M2/34‑91 (MQ=255) ttcgcccgataagagtagagacgaattgcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATg > 1:2471215‑M2/34‑91 (MQ=255) CGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTAAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGaa < 1:3426910‑M1/91‑1 (MQ=255) gcccgataagagcagagacgaattgcttatTATCTTTATTCAGTCTATCAATATGAGCGACTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAAt > 2:3272989‑M2/31‑91 (MQ=255) GTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAAt < 1:1222683‑M1/91‑1 (MQ=255) tctcTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATa > 1:3751655/1‑91 (MQ=255) ctctACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATaa < 2:2839905/91‑1 (MQ=255) ccgataagagtagagacgaattgcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGAACGATGTAATGAATaa > 2:554954‑M2/29‑91 (MQ=255) cgataagagtagagacgaattgcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATaaa > 1:952849‑M2/28‑91 (MQ=255) tACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGa > 1:1059348/1‑91 (MQ=255) tACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGa > 2:365801/1‑91 (MQ=255) ctTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGataat > 2:3883454/1‑91 (MQ=255) tATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGAtaataa < 1:598255/91‑1 (MQ=255) aTCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATaaa > 2:1718319/1‑91 (MQ=255) tCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAAt > 2:642804/1‑91 (MQ=255) cGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGCGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATg > 2:2688860/1‑91 (MQ=255) cGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATg > 1:683665/1‑91 (MQ=255) ggCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGa > 2:2950000/1‑91 (MQ=255) gCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGAc > 2:3312398/1‑91 (MQ=255) gCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGAc > 1:2546892/1‑91 (MQ=255) gcattgcttttTATATTTATGCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGACAGGTACGACTTAATGAATAAAGATAACAAATGGACga > 2:3866999‑M2/12‑91 (MQ=255) gaattgcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACga > 1:363551‑M2/12‑91 (MQ=255) ttgcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACgatga > 1:3259563‑M2/9‑91 (MQ=255) ttgcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACgatga < 1:885516‑M2/83‑1 (MQ=255) gcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACGATGATa > 1:2091802‑M2/7‑91 (MQ=255) gcttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACGATGATa > 1:776272‑M2/7‑91 (MQ=255) cttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACGATGATaa < 2:127909‑M2/86‑1 (MQ=255) cttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACGATGATaa < 1:400892‑M2/86‑1 (MQ=255) ttttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACGATGATAAc < 2:3209764‑M2/87‑1 (MQ=255) tttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACGATGATAACt > 2:195835‑M2/4‑91 (MQ=255) tttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACGATGATAACt < 1:1885968‑M2/88‑1 (MQ=255) tttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACGATGATAACt > 1:1316243‑M2/4‑91 (MQ=255) ttTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACGATGATAACTg < 1:2634020‑M2/89‑1 (MQ=255) | TATGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGACGATGATAACTGC > USA300TCH1516_ALE/729205‑729384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |