| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 729265 | 170 (0.830) | 23 (0.130) | 8/136 | NT | 13.6% | intergenic (+66/‑85) | USA300HOU_RS03535/aes | hypothetical protein/Acetyl esterase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 729282 | 147 (0.850) | intergenic (+83/‑68) | USA300HOU_RS03535/aes | hypothetical protein/Acetyl esterase | |||||
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
TTGCTTAATATCATATGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGAC > USA300TCH1516_ALE/729192‑729372 | tattcattacatcgtacctctctatttgttagacgctcatattaatagactgaataaatataAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCggg > 1:3168423‑M1/63‑91 (MQ=255) gCTTAATATCATATGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGcg < 1:3840970‑M2/91‑3 (MQ=255) gCTTAATATCATATGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGcg > 2:867257‑M2/1‑89 (MQ=255) gCTTAATATCATATGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGcg > 1:2997506‑M2/1‑89 (MQ=255) cattacatcgtacctctctatttgttagacgctcatattaatagactgaataaatataAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGaa > 1:1151961‑M1/59‑91 (MQ=255) acatcgtacctctctatttgttagacgctcatattaatagactgaataaatataAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGc > 2:805216‑M1/55‑91 (MQ=255) atCATATGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGcgaattgct > 1:1746341‑M2/1‑82 (MQ=255) tCATATGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGcgaattgctt > 1:1130299‑M2/1‑81 (MQ=255) atcgtacctctctatttgttagacgctcatattaatagactgaataaatataAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCtt > 1:1560596‑M1/53‑91 (MQ=255) cATATGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGcgaattgcttt < 2:1725307‑M2/91‑12 (MQ=255) atatGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGcgaattgctttt < 2:1987315‑M2/91‑13 (MQ=255) atGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTta > 1:1048343/1‑91 (MQ=255) atGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTta < 1:521797/91‑1 (MQ=255) atGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTta < 1:2528450/91‑1 (MQ=255) tGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTtat < 1:904254/91‑1 (MQ=255) tGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTtat > 1:2639152/1‑91 (MQ=255) aGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTatat > 2:1498105/1‑91 (MQ=255) gggATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTAtatt > 1:1261055/1‑91 (MQ=255) ggATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTAtattt < 1:100177/91‑1 (MQ=255) gATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTAtattta < 2:327541/91‑1 (MQ=255) atatCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTAtatttat < 1:3769056/91‑1 (MQ=255) atatCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTAtatttat < 1:2263606/91‑1 (MQ=255) tatCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTAtatttatt < 1:1942579/91‑1 (MQ=255) atCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTc > 1:1354757/1‑91 (MQ=255) atCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTc < 2:2363463/91‑1 (MQ=255) atCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTc < 1:533685/91‑1 (MQ=255) atCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTc < 1:1457974/91‑1 (MQ=255) atCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTc < 1:2437334/91‑1 (MQ=255) tCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCa > 2:3587470/1‑91 (MQ=255) ccGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAg < 1:815077/91‑1 (MQ=255) ccGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAg < 2:1210559/91‑1 (MQ=255) ccGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTATGTACCTTAATACCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAg < 1:1454620/91‑1 (MQ=255) cGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGt > 2:1199609/1‑91 (MQ=255) gAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTc < 1:2102270/91‑1 (MQ=255) aaaCTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCt > 2:3074290/1‑91 (MQ=255) aaaCTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCt < 2:760920/91‑1 (MQ=255) aaCTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTa > 2:2967006/1‑91 (MQ=255) aaCTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTa > 2:269237/1‑91 (MQ=255) aCTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTAt > 1:2425310/1‑91 (MQ=255) cTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTAtt < 2:1454239/91‑1 (MQ=255) cTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTAtt < 2:770314/91‑1 (MQ=255) ttACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTaa > 1:1432572/1‑91 (MQ=255) tACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAat < 1:3407557/91‑1 (MQ=255) tACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAat < 1:3416767/91‑1 (MQ=255) tACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAat > 2:2914367/1‑91 (MQ=255) aCAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAata < 1:968908/91‑1 (MQ=255) cAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAatat < 2:127941/91‑1 (MQ=255) tGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGc > 2:1873183/1‑91 (MQ=255) tGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTATACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGc > 1:3333389/1‑91 (MQ=255) gAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCg < 1:281315/91‑1 (MQ=255) aTCACTTTGTTTTGACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTAGCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTc < 1:3963039/91‑1 (MQ=255) aTCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTc > 2:3265210/1‑91 (MQ=255) tCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCt < 2:914394/91‑1 (MQ=255) aCTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTaa > 2:1531671/1‑91 (MQ=255) aCTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTaa > 2:1785811/1‑91 (MQ=255) cTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAAc > 2:2092308/1‑91 (MQ=255) cTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAAc < 1:2582669/91‑1 (MQ=255) tttGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACa < 1:2758241/91‑1 (MQ=255) tttAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATag < 1:73519/91‑1 (MQ=255) tttAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATag > 1:2718914/1‑91 (MQ=255) ttAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATaga > 2:3568005/1‑91 (MQ=255) tAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATagag < 1:2102876/91‑1 (MQ=255) aaCCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGACTTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATagaga > 2:3080439/1‑91 (MQ=255) aaCCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCAAACAAATagaga < 1:3026035/91‑1 (MQ=255) aCCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATCCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATagagag > 1:2015209/1‑91 (MQ=255) cTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGt < 2:294130/91‑1 (MQ=255) cTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGt < 2:3327142/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGCGAGGTa < 1:3077074/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTa < 2:1150340/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTa < 2:2688971/91‑1 (MQ=255) AAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGa > 1:3650599‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGa < 1:3609119‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGa > 1:1872956‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATg < 2:838251‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGt < 1:1085523‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGt > 2:3212394‑M1/1‑91 (MQ=255) cAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGcgaattgcttttaaggttaaaacaaagtgattcaattgtaaagtttcggatatccctcatatgatat < 2:2810344‑M2/91‑68 (MQ=255) AATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTaa < 1:289052‑M1/91‑1 (MQ=255) AATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTaa > 2:3146615‑M1/1‑91 (MQ=255) aTTCGTCTCTACTCTTATCGGGcgaattgcttttaaggttaaaacaaagtgattcaattgtaaagtttcggatatccctcatatgatatta < 1:671483‑M2/91‑70 (MQ=255) ATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAAt < 1:2228504‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAAt > 1:293215‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAAt < 1:3310099‑M1/91‑1 (MQ=255) cGTCTCTACTCTTATCGGGcgaattgcttttaaggttaaaacaaagtgattcaattgtaaagtttcggatatccctcatatgatattaagc < 1:3238377‑M2/91‑73 (MQ=255) gactctacTCTTATCGGGcgaattgcttttaaggttaaaacaatgtgattcacttgtaaagtctcggatatccctcatatgatatttagca < 2:980855‑M2/89‑74 (MQ=255) gTCTCTACTCTTATCGGGcgaattgcttttaaggttaaaacaaagtgattcaattgtaaagtttcggatatccctcatatgatattaagca < 1:3801498‑M2/91‑74 (MQ=255) gTCTCTACTCTTATCGGGcgaattgcttttaaggttaaaacaaagtgattcaattgtaaagtttcggatatccctcatatgatattaagca < 1:3628791‑M2/91‑74 (MQ=255) gTCTCTACTCTTATCGGGcgaattgcttttaaggttaaaacaaagtgattcaattgtaaagtttcggatatccctcatatgatattaagca < 1:1722701‑M2/91‑74 (MQ=255) GTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAAt < 1:3748149‑M1/91‑1 (MQ=255) tctcTACTCTTATCGGGcgaattgcttttaaggttaaaacaaagtgattcaattgtaaagtttcggatatccctcatatgatattaagcaa < 2:3475425‑M2/91‑75 (MQ=255) tctcTACTCTTATCGGGcgaattgcttttaaggttaaaacaaagtgattcaattgtaaagtttcggatatccctcatatgatattaagcaa < 2:2675339‑M2/91‑75 (MQ=255) ctctACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGatcat < 1:3481871/91‑5 (MQ=255) ctctACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATaa > 2:423919/1‑91 (MQ=255) tACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGa > 2:365801/1‑91 (MQ=255) ctTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGataat > 2:3883454/1‑91 (MQ=255) tATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGAtaataa < 2:3790657/91‑1 (MQ=255) tATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGAtaataa < 1:598255/91‑1 (MQ=255) aTCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATaaa > 2:1718381/1‑91 (MQ=255) tCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAAt > 2:642804/1‑91 (MQ=255) cGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATg > 1:683665/1‑91 (MQ=255) | TTGCTTAATATCATATGAGGGATATCCGAAACTTTACAATTGAATCACTTTGTTTTAACCTTAAAAGCAATTCGTCTCTACTCTTATCGGGCGAATTGCTTTTTATATTTATTCAGTCTATTAATATGAGCGTCTAACAAATAGAGAGGTACGATGTAATGAATAAAGATAATAAATGGAC > USA300TCH1516_ALE/729192‑729372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |