New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 745527 | 220 (1.080) | 20 (0.100) | 12/154 | NT | 8.0% | intergenic (+13/‑177) | sarX/USA300HOU_RS03615 | HTH‑type transcriptional regulator SarX/putative transcriptional regulatory protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 745553 | 251 (1.280) | intergenic (+39/‑151) | sarX/USA300HOU_RS03615 | HTH‑type transcriptional regulator SarX/putative transcriptional regulatory protein |
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
ATCTAAATTTAATGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGTATATAAACAT > USA300TCH1516_ALE/745463‑745645 | tCTAAATTTAATGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGc > 1:656676‑M2/1‑90 (MQ=255) tAAATTTAATGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGcac > 2:3539240‑M2/1‑88 (MQ=255) tAAATTTAATGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGcac > 1:2678667‑M2/1‑88 (MQ=255) aTTTAATGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACAtt < 2:927122/91‑1 (MQ=255) aTTTAATGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACAtt < 1:1376995/91‑1 (MQ=255) ttAATGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACAtttt > 2:2918500/1‑91 (MQ=255) ttAATGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACAtttt < 2:3292236/91‑1 (MQ=255) tAATGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACAttttt < 2:1040951/91‑1 (MQ=255) tAATGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACAttttt > 1:2074962/1‑91 (MQ=255) aTGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTaa > 1:275407/1‑91 (MQ=255) aTGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTaa > 1:3623249/1‑91 (MQ=255) aTGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTaa > 1:3133610/1‑91 (MQ=255) tGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAAt > 2:338317/1‑91 (MQ=255) tGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAAt > 1:151824/1‑91 (MQ=255) tGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAAt > 1:2986406/1‑91 (MQ=255) gCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAATGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAAtt < 2:2455358/91‑1 (MQ=255) gCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAAtt < 2:1069804/91‑1 (MQ=255) tATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTtata < 1:861963/91‑1 (MQ=255) tttGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGGGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACa < 1:3139319/91‑1 (MQ=255) ttGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATCTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACat < 2:3788821/91‑1 (MQ=255) gAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACatat > 2:1744940/1‑91 (MQ=255) acattGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATAtt > 1:1423278/5‑91 (MQ=255) aaGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATAtt > 2:551584/1‑91 (MQ=255) aaGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATAtt > 1:1742536/1‑91 (MQ=255) aGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATAttt < 1:2908903/91‑1 (MQ=255) aGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATAttt < 1:410790/91‑1 (MQ=255) gATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATAtttt > 2:194205/1‑91 (MQ=255) aTGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTa < 1:742207/91‑1 (MQ=255) tGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTaa > 2:1144746/1‑91 (MQ=255) tGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTaa > 1:3947071/1‑91 (MQ=255) tGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCATATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTaa > 1:3235890/1‑91 (MQ=255) gTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTaaa > 1:3368301/1‑91 (MQ=255) gAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACt > 2:1794577/1‑91 (MQ=255) aCAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTaa < 1:3764289/91‑1 (MQ=255) cAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAg < 1:2464060/91‑1 (MQ=255) aaTTTTTAAATATTTTATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGt > 2:1439008/1‑91 (MQ=255) aaTTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGt < 2:1237986/91‑1 (MQ=255) aTTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTa > 1:511204/1‑91 (MQ=255) tttttAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTaa > 1:1111888/1‑91 (MQ=255) tttttAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTaa > 1:2349424/1‑91 (MQ=255) ttttAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTaaa > 2:2489104/1‑90 (MQ=255) ttttAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAAc > 1:1935388/1‑91 (MQ=255) tttAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACa > 1:1145342/1‑91 (MQ=255) tAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGt > 1:250854/1‑91 (MQ=255) tAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAAAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGt < 2:1471181/91‑1 (MQ=255) atatTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTg < 1:3210350/91‑1 (MQ=255) atTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTgaa < 1:621544/91‑1 (MQ=255) atTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTgaa > 2:486932/1‑91 (MQ=255) ttAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTgaaga < 1:3045307/91‑1 (MQ=255) tAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTgaagaa < 1:3537439/91‑1 (MQ=255) tAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTgaagaa < 2:449905/91‑1 (MQ=255) aattgaaattgaGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGaaa < 1:3438027/91‑1 (MQ=255) ttgaaattgaGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTAGCGGCACATTTTTAATATATAGATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATc < 2:2780700/91‑1 (MQ=255) gaaattgaGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGt < 1:800202/91‑1 (MQ=255) aaattgaGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTa < 2:1569501/91‑1 (MQ=255) aGTGTCGAACGCATAGAATTTGCTTATCGGcactcaatttcaattaaatatttaaaaatcgttctacatcgccaaataaagcattaaattt < 2:3088523‑M2/91‑62 (MQ=255) gtgtCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCaat < 2:2703760/91‑1 (MQ=255) gtgtCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCaat > 1:382688/1‑91 (MQ=255) tgtCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTGAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCaata < 2:3117493/91‑1 (MQ=255) gtCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCaataa > 2:868514/1‑91 (MQ=255) gtCGAAAGCATAGAATTTGCTT‑TCGAcactcaatttcaattaaatatttaaaaattgttctacatcttcaaataaagcattaaatttagat < 1:1246909‑M2/91‑66 (MQ=255) tCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCaataat < 2:616952/91‑1 (MQ=255) cGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATg > 2:1761599/1‑91 (MQ=255) cGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATg < 1:3694406/91‑1 (MQ=255) gAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGt < 2:1332132/91‑1 (MQ=255) aaaGCATAGAATTTGCTTATCGGcactcaatttcaattaaatatttaaaaattgttctacatcttcaaataaagcattaaatttagatata < 1:89308‑M2/91‑69 (MQ=255) aaaGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGtt < 1:2152608/91‑1 (MQ=255) aaaGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGtt < 1:1452760/91‑1 (MQ=255) aaGCATAGAATTTGCTTATCGGcactcaatttcaattaaatatttaaaaattgttctacatcttcaaataaagcattaaatttagatatat < 2:496459‑M2/91‑70 (MQ=255) aaGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTa > 1:181326/1‑91 (MQ=255) aGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTaa > 1:10693/1‑91 (MQ=255) gCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAAt < 2:294508/91‑1 (MQ=255) cATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAAtt < 2:3919388/91‑1 (MQ=255) aTAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATtg < 1:422725/91‑1 (MQ=255) aTAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATtg < 2:2112782/91‑1 (MQ=255) aTAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATtg < 2:3633507/91‑1 (MQ=255) tAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAGATCGTAGTTCAATAATGTTAATtgt < 2:3828734/91‑1 (MQ=255) tAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATtgt < 1:535358/91‑1 (MQ=255) tAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATtgt > 2:3490414/1‑91 (MQ=255) gAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGa > 2:1382253/1‑91 (MQ=255) aaTTTGCTTATCGGcactcaatttcaattaaatatttaaacattgttctacatcttcaaataaagcattaaatttagatatatcatcatta < 1:1025651‑M2/91‑78 (MQ=255) aaTTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGaa < 1:2184962/91‑1 (MQ=255) aaTTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGaa > 2:3343778/1‑91 (MQ=255) ttGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAAt < 1:1481096/91‑1 (MQ=255) ttGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAAt < 2:3013329/91‑1 (MQ=255) tGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATg < 2:263657/91‑1 (MQ=255) tGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATg > 2:3255415/1‑91 (MQ=255) tGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATg < 2:1557178/91‑1 (MQ=255) tGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATg < 2:2006984/91‑1 (MQ=255) gCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGt > 2:2869665/1‑91 (MQ=255) gCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGt > 1:3483177/1‑91 (MQ=255) cTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGta < 1:987081/91‑1 (MQ=255) cTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGta > 1:604662/1‑91 (MQ=255) cTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGta < 2:394642/91‑1 (MQ=255) ttATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGtat > 1:3177090/1‑91 (MQ=255) tATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGtata < 2:260245/91‑1 (MQ=255) aaTCGGCACATTTTTAATATATACATATTTTAAAACGAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGtata < 2:2804338/90‑1 (MQ=255) aTCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGtatat > 1:2778449/1‑91 (MQ=255) aTCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGtatat > 2:2291257/1‑91 (MQ=255) tCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGtatata < 2:2371926/91‑1 (MQ=255) | ATCTAAATTTAATGCTTTATTTGAAGATGTAGAACAATTTTTAAATATTTAATTGAAATTGAGTGTCGAAAGCATAGAATTTGCTTATCGGCACATTTTTAATTTATACATATTTTAAAACTAAGTAACAGTTTGAAGAAATCGTAGTTCAATAATGTTAATTGTGAAAATGTATATAAACAT > USA300TCH1516_ALE/745463‑745645 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |