New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 782414 = | 191 (0.940) | 13 (0.070) | 7/140 | NT | 6.6% | intergenic (‑209/+133) | USA300HOU_RS03820/USA300HOU_RS03825 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 782453 = | 202 (1.140) | intergenic (‑248/+94) | USA300HOU_RS03820/USA300HOU_RS03825 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
CTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAAT > USA300TCH1516_ALE/782363‑782543 | ctctGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACg > 2:797416/1‑91 (MQ=255) ctctGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACg < 1:1425320/91‑1 (MQ=255) ctcgGCAAACTTATGGGATTTAATAGTTGTATAAATATAAAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACg < 2:3143329/91‑1 (MQ=255) tctGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGc < 2:1928000/91‑1 (MQ=255) ctGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCt < 2:844928/91‑1 (MQ=255) ctGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCt < 1:900417/91‑1 (MQ=255) gCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCttt > 2:1901570/1‑91 (MQ=255) gCAATCGTATGGGATTTATTAGTTGGAAAAAAAAAGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCttt < 2:1991245/91‑1 (MQ=255) aTCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCa < 2:1120097/91‑1 (MQ=255) cTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCAtt < 1:3465154/91‑1 (MQ=255) ttATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTg > 1:3222566/1‑91 (MQ=255) ttATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTg < 1:3820057/91‑1 (MQ=255) ttATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTg < 2:3788036/91‑1 (MQ=255) ttATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTg > 2:3102948/1‑91 (MQ=255) tATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGa < 1:1104870/91‑1 (MQ=255) tATGGGATTTAATAGTTGTAAATAAAATGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGa < 2:3892048/91‑1 (MQ=255) aggggATGTAATAGTTGTATATAAAATGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAg < 2:3808226/89‑1 (MQ=255) aTGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAg > 2:2799251/1‑91 (MQ=255) aTGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAg < 1:2393749/91‑1 (MQ=255) gggATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTa > 2:1795756/1‑91 (MQ=255) ggATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTaa > 1:1767503/1‑91 (MQ=255) gATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAAt > 1:2694893/1‑91 (MQ=255) gATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAAt > 1:1992667/1‑91 (MQ=255) aTAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAgtgt < 2:1100500/91‑1 (MQ=255) aTAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAgtgt > 2:3738994/1‑91 (MQ=255) aTAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAgtgt < 1:3132935/91‑1 (MQ=255) tAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTa > 1:2539126/1‑91 (MQ=255) aGTCGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTaa < 1:3191525/91‑1 (MQ=255) ttGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATg > 1:2446032/1‑91 (MQ=255) tGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGt > 2:3255411/1‑91 (MQ=255) atatatatTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGtata > 2:1423579/1‑91 (MQ=255) atatatatTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGtata > 1:3374637/1‑91 (MQ=255) atatatatTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGCAATGAGTGTACTGtata > 1:3390857/1‑91 (MQ=255) atatatatTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGATAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTACATTGAGTAATGAGTGTAATGtata > 2:982817/1‑91 (MQ=255) tatatatTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTatat > 2:89606/1‑91 (MQ=255) tatatTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATAttt < 1:1877942/91‑1 (MQ=255) tatatTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATAttt < 2:1731288/91‑1 (MQ=255) ttGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTaaa < 1:1518810/91‑1 (MQ=255) ttGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTaaa < 2:136366/91‑1 (MQ=255) aaaaaGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAAtt > 2:2335584/1‑91 (MQ=255) aaaGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTg > 1:1151534/1‑91 (MQ=255) aaaGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTg < 2:2606613/91‑1 (MQ=255) aaaGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTg > 1:836348/1‑91 (MQ=255) aaGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAGAATTTGt > 1:1957877/1‑91 (MQ=255) aaGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGt < 2:2893075/91‑1 (MQ=255) aaGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGt < 2:1633905/91‑1 (MQ=255) aGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTa > 1:1572009/1‑91 (MQ=255) ggAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTaa > 1:3013943/1‑91 (MQ=255) ggAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTaa > 1:1244036/1‑91 (MQ=255) ggAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTaa > 2:2078825/1‑91 (MQ=255) ggAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTaa > 1:3635240/1‑91 (MQ=255) aaaGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATg < 1:1157862/91‑1 (MQ=255) aaaGTATGATTTCTACAAACTAGGGGGGCTGTGAAATCATATGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATg < 2:279381/91‑1 (MQ=255) aaaGTATCATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAGTTTGTAATg < 1:1972736/91‑1 (MQ=255) aaGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGt < 1:3088772/91‑1 (MQ=255) aaGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGt > 2:80876/1‑91 (MQ=255) aaGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGt > 2:722936/1‑91 (MQ=255) aaGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGt > 1:745901/1‑91 (MQ=255) aGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAACTTTGTAATGta > 1:3583345/1‑91 (MQ=255) aGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGta > 1:2965915/1‑91 (MQ=255) cgtatgatttcacagcccccctagcttgtagaaatcata‑CTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGtata > 1:2786185‑M2/40‑91 (MQ=255) GTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGtat < 1:662941‑M1/91‑1 (MQ=255) TGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTatagt > 1:2876640‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTatagtaa < 2:3062149‑M1/91‑1 (MQ=255) ttcacagcccccctagcttgtagaaatcatacGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTatagtaata > 2:3770384‑M2/33‑91 (MQ=255) TTCAACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTATCCATTGAGTGATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTatagtaata > 2:2945256‑M1/1‑91 (MQ=255) tcacagcccccctagcttgtagaaatcatacGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTatagtaatag > 2:2542844‑M2/32‑91 (MQ=255) TCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTatagtaatag > 2:1315123‑M1/1‑91 (MQ=255) acagcccccctagcttgtagaaatcatacGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTACAAATTTGTAATGTatagtaatagta > 1:2093526‑M2/30‑91 (MQ=255) aCAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTAt < 1:165581/91‑1 (MQ=255) aCAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTAt < 1:597707/91‑1 (MQ=255) aaGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTAtgt > 2:2562169/1‑91 (MQ=255) aGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTAtgtt < 1:484126/91‑1 (MQ=255) aGCTAGGGGGGCTATAAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTatagtaatagtaaaaa < 2:731776/91‑5 (MQ=255) ggggggCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGtaaa < 2:1157045/91‑1 (MQ=255) ggggggCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGtaaa > 1:3732047/1‑91 (MQ=255) gggggCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGtaaat < 2:3094032/91‑1 (MQ=255) ggggCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGtaaata < 1:1188413/91‑1 (MQ=255) ggggCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGtaaata < 1:281657/91‑1 (MQ=255) ggggCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGtaaata > 2:2231206/1‑91 (MQ=255) ggggCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGtaaata < 2:1021445/91‑1 (MQ=255) gggtgtgAAATCAGACGGTTTCCATTGAGTAATGAGGGTAACGTATATTTTAAAAAGTTGTTATGTATAGTAATAGTATGTTGtaaataaa < 2:2837585/88‑1 (MQ=255) cTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAg < 1:2230511/91‑1 (MQ=255) tgtgAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGt < 2:3219957/91‑1 (MQ=255) tgtgAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGt > 2:3129373/1‑91 (MQ=255) tgtgAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGt > 2:1505352/1‑91 (MQ=255) gtgAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGtt > 2:693651/1‑91 (MQ=255) tgAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGttt > 2:2690737/1‑91 (MQ=255) aaatcatacGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTaa > 2:3391859‑M2/10‑91 (MQ=255) aatcatacGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAAc < 2:1049025‑M2/83‑1 (MQ=255) atcatacGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACt > 2:2510285‑M2/8‑91 (MQ=255) tcatacGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTc < 1:217791‑M2/85‑1 (MQ=255) tcatacGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTc > 1:2329634‑M2/7‑91 (MQ=255) catacGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCa < 2:2552244‑M2/86‑1 (MQ=255) atacGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAg < 1:939183‑M2/87‑1 (MQ=255) atacGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAg < 2:197735‑M2/87‑1 (MQ=255) cGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGaaa > 2:558509‑M2/2‑91 (MQ=255) cGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGaaa > 1:1391948‑M2/2‑91 (MQ=255) gCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAAt > 1:2617026/1‑91 (MQ=255) gCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAAt < 2:524695/91‑1 (MQ=255) | CTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAAT > USA300TCH1516_ALE/782363‑782543 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |