| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 815690 = | 214 (1.050) | 20 (0.110) | 11/138 | NT | 11.5% | intergenic (+5/+312) | yclQ/USA300HOU_RS03990 | putative ABC transporter solute‑binding protein YclQ/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 815739 = | 125 (0.710) | intergenic (+54/+263) | yclQ/USA300HOU_RS03990 | putative ABC transporter solute‑binding protein YclQ/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
TAAACAAATTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACATGTACTTGTA > USA300TCH1516_ALE/815649‑815829 | tctaggacattgattggcgacccagatttccttttttaaagAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCgcttttc > 2:2379924‑M1/42‑91 (MQ=255)tAAACAAATTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAATATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCtcttttc < 2:2656184/91‑1 (MQ=255)gagaCAAATTGAGGAACTGGATAAAGCTGTAAAATAATTTGAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCtcttttc < 1:3296853/88‑1 (MQ=255) gtttaaTTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCtcttttctt > 2:3808058/5‑91 (MQ=255) aaCAAATTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAACGGTCTTAATCATTGCTCCCCtcttttctt > 1:3171038/1‑91 (MQ=255) aaCAAATTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCtcttttctt < 2:111026/91‑1 (MQ=255) aCAAATTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCtcttttcttt > 1:2479623/1‑91 (MQ=255) cAAATTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTa < 1:2704203/91‑1 (MQ=255) aaTTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTaaa < 1:1385186/91‑1 (MQ=255) aaTTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTaaa > 1:226199/1‑91 (MQ=255) aTTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTaaaa < 2:3850080/91‑1 (MQ=255) aTTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTaaaa < 2:2322575/91‑1 (MQ=255) agaaaCTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAgg < 1:2009925/88‑1 (MQ=255) aGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAgg > 1:1447803/1‑91 (MQ=255) ggAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGa < 2:896006/91‑1 (MQ=255) ggAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGa < 1:2941162/91‑1 (MQ=255) ggAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGa > 1:670964/1‑91 (MQ=255) aCTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAAt > 1:434350/1‑91 (MQ=255) cTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATc > 2:3644046/1‑91 (MQ=255) ttGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCt > 2:2965909/1‑91 (MQ=255) tGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGCACAGTGGTTAAACGTCTTAATCATTACTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTg > 1:3158394/1‑91 (MQ=255) tGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTg < 2:1975666/91‑1 (MQ=255) aTAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTggg > 1:693362/1‑91 (MQ=255) tAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGa > 2:3253274/1‑91 (MQ=255) aaGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACg > 1:1009090/1‑91 (MQ=255) aaGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACg > 1:2486967/1‑91 (MQ=255) tGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGtcaa < 1:3582655/91‑1 (MQ=255) gTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGtcaat > 2:3331220/1‑91 (MQ=255) gTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGtcaat > 1:375410/1‑91 (MQ=255) tAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGtcaatc < 1:2631892/91‑1 (MQ=255) aaaTAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGtcaatcaa < 2:973012/91‑1 (MQ=255) aaaTAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGtcaatcaa < 2:3914769/91‑1 (MQ=255) aaaTAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGtcaatcaa < 2:2498916/91‑1 (MQ=255) aaaTAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGtcaatcaa < 2:1384896/91‑1 (MQ=255) aaaTAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGtcaatcaa < 1:151290/91‑1 (MQ=255) aataatTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTcaatcaat < 1:2563544/91‑1 (MQ=255) aataatTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTcaatcaat < 1:2563011/91‑1 (MQ=255) ataatTTTAAAATCTGGCAACAATGGTTAAAGGTCTTATTCATTGCTCCCTTCGTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCGATg < 2:3591436/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAg < 1:1863488/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAg < 1:3766854/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAg > 1:3707149/1‑91 (MQ=255) agaaaagaggggagcaatgattaagacctttaaccattgttcccctcttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAg > 1:3053812‑M2/52‑91 (MQ=255) tAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGa > 1:1166924/1‑91 (MQ=255) tAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGa > 2:486876/1‑91 (MQ=255) tAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGa < 2:3173219/91‑1 (MQ=255) gaaaagaggggagcaatgattaagacctttaaccattgttcccctcttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGa > 1:1043803‑M2/51‑91 (MQ=255) AAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGAc > 2:1033172‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAGAGGGGAACAATGGTTAGAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTGTAAAAAAGGAACTCTGGGACGTCACTCAATGTCCTCGAct < 2:3213978‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGActc > 1:940820‑M1/1‑91 (MQ=255) agaggggagcaatgattaagacctttaaccattgttcccctcttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGActct > 1:2615212‑M2/47‑91 (MQ=255) AGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTaa > 2:1178590‑M1/1‑91 (MQ=255) AGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTaa > 2:1179073‑M1/1‑91 (MQ=255) ggggagcaatgattaagacctttaaccattgttcccctcttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTaaa > 2:3795361‑M2/44‑91 (MQ=255) gggagcaatgattaagacctttaaccattgttcccctcttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTaaaa > 1:3929905‑M2/43‑91 (MQ=255) GGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTaaaa > 2:1536074‑M1/1‑91 (MQ=255) GGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAAt > 2:1468406‑M1/1‑91 (MQ=255) gagcaatgattaagacctttaaccattgttcccctcttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATg > 2:254451‑M2/41‑91 (MQ=255) AACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCCCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGt < 2:1987084‑M1/91‑1 (MQ=255) cAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTc < 1:3460343/91‑1 (MQ=255) cAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTc < 2:815083/91‑1 (MQ=255) aTGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCtg > 1:3237282/1‑91 (MQ=255) tgattaagacctttaaccattgttcccctcttttCTTTATAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCtgt > 2:254655‑M2/35‑91 (MQ=255) gattaagacctttaaccattgttcccctcttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCtgtt > 1:2864256‑M2/34‑91 (MQ=255) gTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTGTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCtgttg < 2:1056829/91‑1 (MQ=255) ttAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCtgttgt > 1:194670/1‑91 (MQ=255) ttAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCtgttgt < 2:1363276/91‑1 (MQ=255) ttAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCtgttgt < 1:34261/91‑1 (MQ=255) tAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTc > 2:858496/1‑91 (MQ=255) tAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTc < 1:2995186/91‑1 (MQ=255) tAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTc > 2:2469333/1‑91 (MQ=255) tAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTc > 1:877945/1‑91 (MQ=255) aaaGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCa < 1:2822018/91‑1 (MQ=255) gTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTct > 2:3934271/1‑90 (MQ=255) gTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCg > 1:3760314/1‑91 (MQ=255) ttAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTCAAATGTTCTGTAGTCAGTCgttg > 2:3024492/1‑91 (MQ=255) ttAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCgttg > 1:1314159/1‑91 (MQ=255) ttAATCATTGCTCCCATATTTTCATTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCgttg < 2:1298541/91‑1 (MQ=255) tAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCgttgg > 1:968210/1‑91 (MQ=255) tAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCgttgg < 1:2361076/91‑1 (MQ=255) tCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCgttggttg < 1:3096952/91‑1 (MQ=255) aTTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTtgaa < 1:2757820/91‑1 (MQ=255) aTTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTtgaa < 2:3342205/91‑1 (MQ=255) aTTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTtgaa < 1:2140455/91‑1 (MQ=255) tGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTtgaatg < 1:1033231/91‑1 (MQ=255) cTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTtgaatgaa < 2:3064879/91‑1 (MQ=255) cTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTtgaatgaa < 2:2843470/91‑1 (MQ=255) tcccctcttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAAc > 2:1936607‑M2/12‑91 (MQ=255) tcccctcttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAAc < 1:351562‑M2/80‑1 (MQ=255) cccctcttttCTTTAAAAATGGAAATCTTGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACa > 2:538589‑M2/11‑91 (MQ=255) cccctcttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACa < 1:1666084‑M2/81‑1 (MQ=255) ccctcttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACAt > 1:546591‑M2/10‑91 (MQ=255) cttttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACATGTAc > 1:1842553‑M2/6‑91 (MQ=255) tttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACATGTACtt > 2:1825352‑M2/4‑91 (MQ=255) tttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACATGTACtt > 1:1771783‑M2/4‑91 (MQ=255) tttCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACATGTACtt < 1:1733409‑M2/88‑1 (MQ=255) tCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACATGTACTTGt < 1:378023‑M2/90‑1 (MQ=255) tCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACATGTACTTGt > 1:3044489‑M2/2‑91 (MQ=255) tCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACATGTACTTGt < 1:1116523‑M2/90‑1 (MQ=255) ctttAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACATGTACTTGTa > 1:3220857/1‑91 (MQ=255) ctttAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACATGTACTTGTa > 2:587431/1‑91 (MQ=255) | TAAACAAATTGAGGAACTTGATAAAGTTGTAAAATAATTTTAAAAGAGGGGAACAATGGTTAAAGGTCTTAATCATTGCTCCCCTCTTTTCTTTAAAAAAGGAAATCTGGGACGTCAATCAATGTCCTAGACTCTAAAATGTTCTGTTGTCAGTCGTTGGTTGAATGAACATGTACTTGTA > USA300TCH1516_ALE/815649‑815829 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |