New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1044649 = | 217 (1.070) | 23 (0.140) | 12/132 | NT | 12.1% | coding (958/960 nt) | yfmC_1 | Fe(3+)‑citrate‑binding protein YfmC |
? | USA300TCH1516_ALE | 1044700 = | 156 (0.930) | coding (114/117 nt) | USA300HOU_RS05165 | hypothetical protein |
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
ATGGCAGAAGATTTAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGATTGTTTTAACA > USA300TCH1516_ALE/1044610‑1044790 | aTGGCAGAAGATTTAGAAAAAATTGCAGAAAAATCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGAGCTGTATTTTTaa > 2:734624/1‑91 (MQ=255) tGGCAGAAGATTTAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAAt > 2:940228/1‑91 (MQ=255) cAGAAGATTTAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATAGAAGAGTGGCGATGTATTTTTAATTAt > 2:3419288/1‑91 (MQ=255) aaaaagaTTTAGAAAAAATTGCATGAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTGCTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTAt < 2:3676214/88‑1 (MQ=39) agaagaTTTAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATg < 1:3191628/91‑1 (MQ=255) gaagaTTTAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGt < 1:2287469/91‑1 (MQ=255) agaTTTAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGttt > 1:3841984/1‑91 (MQ=255) agaATTAGAAAAAATTGCAAAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCGTCTCGTAAATCATATAAGGGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGttt < 2:142461/91‑1 (MQ=38) gaTTTAGAAAAAATTGCGGAAAAAGCAAAATGAAAATAGAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTtta < 2:3524872/91‑1 (MQ=255) ttAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTGAATTATGAttatta > 2:2739191/1‑91 (MQ=255) tAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTtattat > 1:1054097/1‑91 (MQ=255) tAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTtattat < 1:734823/91‑1 (MQ=255) tAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTtattat > 2:1040178/1‑91 (MQ=255) tAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTtattat > 2:2039221/1‑91 (MQ=255) tAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTtattat < 2:3223768/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTg > 1:1734019/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTg > 1:1620056/1‑91 (MQ=255) aaaaaTTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGt < 2:2066743/91‑1 (MQ=255) aaaaaTTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGt < 1:698286/91‑1 (MQ=255) aaaTTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCg < 1:890117/91‑1 (MQ=255) aaaTTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCg < 2:525847/91‑1 (MQ=255) aTTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACATCGTTACTCTTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGa < 2:1099159/91‑1 (MQ=255) aTTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGa < 1:1011184/91‑1 (MQ=255) ttGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGAt > 1:2920323/1‑91 (MQ=255) tGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGAtg > 1:2074797/1‑91 (MQ=255) tGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGAtg > 1:1835139/1‑91 (MQ=255) tGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGAtg > 2:3799890/1‑91 (MQ=255) tGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGAtg > 1:413590/1‑91 (MQ=255) tGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGAtg < 2:1617745/91‑1 (MQ=255) gCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGAtgt > 1:1727769/1‑91 (MQ=255) cAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGAtgtg < 2:1742553/91‑1 (MQ=255) gAAAAAGCAAAATAAAAGTACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGGGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGtgat < 1:1698031/91‑1 (MQ=255) aaaaGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGtgatga > 1:3285836/1‑91 (MQ=255) aaaaGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTAGCTGTCGGATGtgatga < 2:1812730/91‑1 (MQ=255) aaaataaaaataCAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTAcc > 1:122474/1‑91 (MQ=255) aaaataaaaataCAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTAcc > 2:129864/1‑91 (MQ=255) aaataaaaataCAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCt > 2:857799/1‑91 (MQ=255) aataaaaataCAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTg < 2:666786/91‑1 (MQ=255) ataaaaataCAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGa < 1:865996/91‑1 (MQ=255) TAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGaa > 1:2362306‑M1/1‑91 (MQ=255) TAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGaa > 1:3632796‑M1/1‑91 (MQ=255) TAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGaa > 1:2324571‑M1/1‑91 (MQ=255) TAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGaa > 2:868162‑M1/1‑91 (MQ=255) TAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGaa < 2:2081869‑M1/91‑1 (MQ=255) TAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGaa > 2:579470‑M1/1‑91 (MQ=255) TAAAAATACAGCGCTACACGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGaa > 2:2924129‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGaaa < 1:3905037‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGaaa > 2:3581245‑M1/1‑91 (MQ=255) AAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGt > 1:2592016‑M1/1‑91 (MQ=255) TACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTa < 1:1856505‑M1/91‑1 (MQ=255) ACAGCGCCACTCTTATATGATTTACGAGTAGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTAt < 2:3293274‑M1/91‑1 (MQ=255) CAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTAtt < 2:432082‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTAttt < 2:2385788‑M1/91‑1 (MQ=255) gcgccactcttatatgatttacgagtagcgctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTc > 1:496890‑M2/42‑91 (MQ=255) gcgccactcttatatgatttacgagtagcgctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTc > 2:3774889‑M2/42‑91 (MQ=255) GCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTc < 1:3373278‑M1/91‑1 (MQ=255) CGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCg < 1:1182247‑M1/91‑1 (MQ=255) gccactcttatatgatttacgagtagcgctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGa > 1:3275616‑M2/40‑91 (MQ=255) gccactcttatatgatttacgagtagcgctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGa > 1:2757590‑M2/40‑91 (MQ=255) gccactcttatatgatttacgagtagcgctgtatttttaATCATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGa > 2:1706414‑M2/40‑91 (MQ=255) GCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGa < 2:1930371‑M1/91‑1 (MQ=255) CTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGTATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGaa > 2:3884653‑M1/1‑91 (MQ=255) CTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGaa > 2:3074002‑M1/1‑91 (MQ=255) tACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAAt < 1:624167/91‑1 (MQ=255) cttatatgatttacgagtagcgctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAAt > 2:2642031‑M2/34‑91 (MQ=255) cttatatgatttacgagtagcgctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAAt > 1:953967‑M2/34‑91 (MQ=255) cGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAAt < 2:1677389/91‑1 (MQ=255) cATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTa > 1:1593200/1‑91 (MQ=255) atatAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCTAATAAATTTTATTAc > 2:3131889/1‑91 (MQ=255) atatAAGAGGGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTAGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTAc < 2:2577753/91‑1 (MQ=255) tatgagagTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACa < 2:2990955/87‑1 (MQ=255) ataAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACAt < 1:2215/91‑1 (MQ=255) ataAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACAt > 1:1938153/1‑91 (MQ=255) ataAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACAt < 2:1189703/91‑1 (MQ=255) taAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACaat < 1:3462113/91‑3 (MQ=255) agagTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAAc > 1:1529460/1‑91 (MQ=255) gagTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAAcc > 1:2958500/1‑91 (MQ=255) gagTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAAcc > 1:801107/1‑91 (MQ=255) agTGGCTCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCg < 2:1446708/91‑1 (MQ=255) agTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCg < 1:2518035/91‑1 (MQ=255) agTGGCGCTGTATTGTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCg > 2:3361839/1‑91 (MQ=255) ggCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACa < 2:1234489/91‑1 (MQ=255) ggCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACa < 2:2866239/91‑1 (MQ=255) ggCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACa > 2:692993/1‑91 (MQ=255) ggCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACa < 1:3124861/91‑1 (MQ=255) ggCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACa < 2:1480217/91‑1 (MQ=255) gcgctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACaa < 2:1348386‑M2/77‑1 (MQ=255) gcgctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACaa > 1:2113571‑M2/15‑91 (MQ=255) cgctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAg > 2:971232‑M2/14‑91 (MQ=255) ctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGa < 2:1406142‑M2/80‑1 (MQ=255) ctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGa < 1:1338565‑M2/80‑1 (MQ=255) ctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGa < 2:1995505‑M2/80‑1 (MQ=255) ctgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGa < 1:2616891‑M2/80‑1 (MQ=255) tgtatttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGAt < 1:2896367‑M2/81‑1 (MQ=255) atttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGATTGt > 2:2439488‑M2/8‑91 (MQ=255) atttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGATTGt > 2:1292033‑M2/8‑91 (MQ=255) tttttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGATTGtt < 1:2452204‑M2/85‑1 (MQ=255) tttaATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGATTGtttt < 1:3062529‑M2/87‑1 (MQ=255) aTTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGATTGTTTTAACa > 1:1437149/1‑91 (MQ=255) aTTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGATTGTTTTAACa > 1:928679/1‑91 (MQ=255) | ATGGCAGAAGATTTAGAAAAAATTGCAGAAAAAGCAAAATAAAAATACAGCGCTACTCGTAAATCATATAAGAGTGGCGCTGTATTTTTAATTATGTTTATTATCTGTCGGATGTGATGATTTACCTGAAAGTTTATTTCGAATAAATTTAATTACATAACCGACAAGGATTGTTTTAACA > USA300TCH1516_ALE/1044610‑1044790 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |