| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1134027 | 174 (0.850) | 9 (0.050) | 6/132 | NT | 5.7% | intergenic (+21/+41) | coaD/USA300HOU_RS05620 | Phosphopantetheine adenylyltransferase/Nicotinamide‑nucleotide adenylyltransferase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1134045 | 154 (0.920) | intergenic (+39/+23) | coaD/USA300HOU_RS05620 | Phosphopantetheine adenylyltransferase/Nicotinamide‑nucleotide adenylyltransferase | |||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
TGAATTCGTTCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGCATTGTATA > USA300TCH1516_ALE/1133955‑1134135 | tGAATTCGTTCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAAt > 1:1802523/1‑91 (MQ=255)tGAATTCGTTCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAAt > 1:15199/1‑91 (MQ=255) gcaacaacaaacagatttcaacacgcctgtcatacagcaatatcgttaacaaatgaaAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcc > 2:2537140‑M1/58‑91 (MQ=255) tCGTTCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaa < 2:1244876‑M2/91‑6 (MQ=255) tCGTTCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaa > 2:664408‑M2/1‑86 (MQ=255) caacaaacagatttcaacacgcctgtcatacagcaatatcgttaacaaatgaaAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTaaa > 2:3238965‑M1/54‑91 (MQ=255) cGTTCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaa < 2:2274312‑M2/91‑7 (MQ=255) gTTCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaa < 2:1831890‑M2/91‑8 (MQ=255) aacaaacagatttcaacacgcctgtcatacagcaatatcgttaacaaatgaaAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTaaaa > 2:3452031‑M1/53‑91 (MQ=255) aacaaacagatttcaacacgcctgtcatacagcaatatcgttaacaaatgaaAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTaaaa > 2:2048422‑M1/53‑91 (MQ=255) ttCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaat > 1:1922491‑M2/1‑83 (MQ=255) ttCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaat < 1:3758378‑M2/91‑9 (MQ=255) tCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaata < 1:1676054‑M2/91‑10 (MQ=255) tCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaata < 1:3111073‑M2/91‑10 (MQ=255) ccACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaatac > 2:2170982‑M2/1‑81 (MQ=255) ccACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaatac > 2:176907‑M2/1‑81 (MQ=255) ccACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaatac > 2:806426‑M2/1‑81 (MQ=255) ccACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaatac > 2:2978457‑M2/1‑81 (MQ=255) aaacagatttcaacacgcctgtcatacagcaatatcgttaacaaatgaaAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATAc > 2:3312199‑M1/50‑91 (MQ=255) cACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaatact < 1:3023031‑M2/91‑12 (MQ=255) aCCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaatactg > 2:563668‑M2/1‑79 (MQ=255) ccTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaatactgt < 1:3263061‑M2/91‑14 (MQ=255) ccTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaatactgt > 1:3494123‑M2/1‑78 (MQ=255) cTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaatactgtt > 1:2151892‑M2/1‑77 (MQ=255) cTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaatactgtt > 2:1707979‑M2/1‑77 (MQ=255) ctATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGttt < 1:2507641/90‑1 (MQ=255) tATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGtttt > 2:1495147/1‑91 (MQ=255) aTGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTc < 1:101169/91‑1 (MQ=255) ttGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCAtt < 1:1785294/91‑1 (MQ=255) tGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCAttt > 2:1595873/1‑91 (MQ=255) tGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCAttt > 1:1786856/1‑91 (MQ=255) tGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCAttt > 1:628887/1‑91 (MQ=255) gAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTg > 1:2314977/1‑91 (MQ=255) gAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTCACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTg < 2:765266/91‑1 (MQ=255) aaaGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGtt > 1:530492/1‑91 (MQ=255) aaGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTa < 2:1070017/91‑1 (MQ=255) aGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTaa < 1:1387828/91‑1 (MQ=255) aGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTaa < 1:2830865/91‑1 (MQ=255) ggCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAAc < 2:702793/91‑1 (MQ=255) gCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACg > 1:1717603/1‑91 (MQ=255) cATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATACAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGa < 1:3672248/91‑1 (MQ=255) cATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGa < 1:1231368/91‑1 (MQ=255) cATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGa > 1:1673934/1‑91 (MQ=255) ttGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGata < 2:3592176/91‑1 (MQ=255) ttGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGata > 2:2625169/1‑91 (MQ=255) tGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGatat > 2:1344486/1‑91 (MQ=255) gaagaagaaATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATAtt < 1:1901257/91‑1 (MQ=255) gaagaagaaATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATAtt < 2:520967/91‑1 (MQ=255) aagaagaaATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTg < 2:2476903/91‑1 (MQ=255) gaagaaATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCt > 2:3143918/1‑91 (MQ=255) gaaATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTa > 2:1361949/1‑91 (MQ=255) aaTTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATg < 2:965444/91‑1 (MQ=255) aaTTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATg < 1:750589/91‑1 (MQ=255) aTTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGa < 2:3858594/91‑1 (MQ=255) ttAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACa > 2:458650/1‑91 (MQ=255) tAAGTGATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAg < 2:3207566/91‑1 (MQ=255) aGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGc > 1:958850/1‑91 (MQ=255) aGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGc < 1:3927004/91‑1 (MQ=255) aGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGc > 1:2631076/1‑91 (MQ=255) gTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCg > 1:1512557/1‑91 (MQ=255) aataaAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTTTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCgtg > 2:607811/1‑91 (MQ=255) taaAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGtt < 1:453344/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAGATGCTGTGTTCATTTGTTAATGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTg < 2:1222966/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAAACCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTg > 1:3329931/1‑91 (MQ=255) aaaaTAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGa < 1:1334221/91‑1 (MQ=255) aaaaTAACAGGATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGCTGa < 1:3840962/91‑1 (MQ=255) aaaTAACAGTATTTTAGGTCTATCATGGTTTACAATACTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACTGGAGTGTTgca > 2:3656794/1‑89 (MQ=255) aaTAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGaaa < 1:3225920/91‑1 (MQ=255) aaTAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGaaa < 1:3226092/91‑1 (MQ=255) aaTAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGGATGACAGGCGTGTTGaaa < 1:3096504/91‑1 (MQ=255) ACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCtg < 1:1031714‑M1/91‑1 (MQ=255) ACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCtg > 1:268697‑M1/1‑91 (MQ=255) CAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTAATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCtgt < 2:2708366‑M1/91‑1 (MQ=255) AGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCtgtt > 1:3548851‑M1/1‑91 (MQ=255) GTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCtgttt < 1:1303074‑M1/91‑1 (MQ=255) TATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCtgtttg < 2:1291777‑M1/91‑1 (MQ=255) TATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCtgtttg < 2:3708830‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTttgttg > 1:1445254‑M1/1‑91 (MQ=255) aGGTTTATCATGGTTTACAATcctaaaatactgttatttttattacttaaatttcttcttcaatgccttttcaacataaggtggaacgaat < 2:2320866‑M2/91‑71 (MQ=255) GGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGc < 1:220431‑M1/91‑1 (MQ=255) GGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGc > 2:270575‑M1/1‑91 (MQ=255) tttATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGccc < 1:895204/91‑1 (MQ=255) tATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGc > 2:3752302/1‑91 (MQ=255) aTCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCt < 1:2381272/91‑1 (MQ=255) aTGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTAt < 1:1172803/91‑1 (MQ=255) aTGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTAt < 2:2888714/91‑1 (MQ=255) tGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTAtt < 2:1812515/91‑1 (MQ=255) ggTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTg > 2:1047826/1‑91 (MQ=255) gTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGc > 2:3329648/1‑91 (MQ=255) gTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTCGTTGCCCGCTTATTGc > 2:3778050/1‑91 (MQ=255) gTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTAGTTGCCCGCTTATTGc > 2:3773853/1‑91 (MQ=255) ttACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGCAt < 2:888697/91‑1 (MQ=255) ttACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGCAt < 2:194337/91‑1 (MQ=255) aCAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGCATTg > 2:2294966/1‑91 (MQ=255) aCAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGCATTg > 1:3879591/1‑91 (MQ=255) cAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGCATTGt > 1:2969703/1‑91 (MQ=255) aaTCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGCATTGta < 2:2676296/91‑1 (MQ=255) aaTCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGCATTGta > 2:939382/1‑91 (MQ=255) aTCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGCATTGtat > 1:1562580/1‑91 (MQ=255) tCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGCATTGtata < 2:3934903/91‑1 (MQ=255) | TGAATTCGTTCCACCTTATGTTGAAAAGGCATTGAAGAAGAAATTTAAGTAATAAAAATAACAGTATTTTAGGTTTATCATGGTTTACAATCCTAAAATACTGTTTTCATTTGTTAACGATATTGCTGTATGACAGGCGTGTTGAAATCTGTTTGTTGTTGCCCGCTTATTGCATTGTATA > USA300TCH1516_ALE/1133955‑1134135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |