New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1149421 = | 217 (1.070) | 11 (0.060) | 5/138 | NT | 5.7% | intergenic (+7/+164) | pheT_1/rnhC | Phenylalanine‑‑tRNA ligase beta subunit/Ribonuclease HIII |
? | USA300TCH1516_ALE | 1149475 = | 179 (1.020) | intergenic (+61/+110) | pheT_1/rnhC | Phenylalanine‑‑tRNA ligase beta subunit/Ribonuclease HIII |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
TTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAA > USA300TCH1516_ALE/1149385‑1149565 | ttAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGtttt > 1:1741429/1‑91 (MQ=255) tAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTa > 2:3742148/1‑91 (MQ=255) aTTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAtt < 2:1104668/91‑1 (MQ=255) ttGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAttt < 1:120472/91‑1 (MQ=255) ttGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAttt < 1:955911/91‑1 (MQ=255) tGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAGACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAtttt < 2:263783/91‑1 (MQ=255) tGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAtttt > 2:648284/1‑91 (MQ=255) tGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAtttt < 2:319678/91‑1 (MQ=255) gAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAttttt > 1:3315574/1‑91 (MQ=255) gAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAttttt > 1:2267338/1‑91 (MQ=255) aaCAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTg < 2:2271620/91‑1 (MQ=255) aaCAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTg > 2:2559413/1‑91 (MQ=255) aCAAGGTGCTGCTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATACCTAACATGGGGTCTTATTTCTgg > 2:753135/1‑91 (MQ=255) cAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTggg < 1:803150/91‑1 (MQ=255) aGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGtt > 1:1828961/1‑91 (MQ=255) ggTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGttt > 2:3933124/1‑90 (MQ=255) ggTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTc < 1:3916562/91‑1 (MQ=255) ggTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTc > 1:2872488/1‑91 (MQ=255) ggTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTc < 2:3909704/91‑1 (MQ=255) ggTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTc > 1:380268/1‑91 (MQ=255) ggTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTc > 1:3577581/1‑91 (MQ=255) ggTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTc > 2:3654648/1‑91 (MQ=255) gTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCa > 1:2589544/1‑91 (MQ=255) gCTGTTATTAGATAATGATTTACCCCCCATGTATAAGGATATCCGAAGTAGATTGATATCCCTAGCATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCAcc < 2:1863723/91‑1 (MQ=255) cTGTTATTAGATAATGATTTATACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCa < 2:2446981/91‑1 (MQ=255) cTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCa < 2:594335/91‑1 (MQ=255) tGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCaa > 2:2160457/1‑91 (MQ=255) tGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTCGGGTTCACCaa > 2:675684/1‑91 (MQ=255) tattaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAAttt < 1:3582830/91‑1 (MQ=255) attaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTg > 2:852651/1‑91 (MQ=255) attaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTg > 2:3534835/1‑91 (MQ=255) ttaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGCTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTgg > 1:509475/1‑91 (MQ=255) aGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGtt > 2:2730005/1‑91 (MQ=255) aTAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTcc > 2:1014992/1‑91 (MQ=255) tAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAAAATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCa > 2:194262/1‑91 (MQ=255) aaTGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCaa > 2:3151852/1‑91 (MQ=255) aaTGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCaa > 2:2395657/1‑91 (MQ=255) gATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGc > 1:1559036/1‑91 (MQ=255) aTTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGGAGTAGGTTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCa < 1:1401640/91‑1 (MQ=255) ttAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGGTATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt > 2:2476749/1‑91 (MQ=255) ttAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt < 2:2834269/91‑1 (MQ=255) ttAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt < 2:3866923/91‑1 (MQ=255) tAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAttt > 2:1066849/1‑91 (MQ=255) AACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaa > 1:3456789‑M1/1‑91 (MQ=255) AACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaa < 2:1927876‑M1/91‑1 (MQ=255) AACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaa < 2:3369146‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaaa < 1:2430500‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaaa < 1:28124‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaaa < 2:1930491‑M1/91‑1 (MQ=255) CCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaaaaa > 2:2682636‑M1/1‑91 (MQ=255) CCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCCATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAg < 2:395218‑M1/91‑1 (MQ=255) CCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAg < 1:1080514‑M1/91‑1 (MQ=255) catgttagggatatcaatctacttcagatatccttatacatggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGt > 2:584969‑M2/49‑91 (MQ=255) CATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGt < 1:57643‑M1/91‑1 (MQ=255) catgttagggatatcaatctacttcagatatccttaacatggggtttTATTTTTTGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTc > 2:3804508‑M2/48‑91 (MQ=255) ATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTc < 2:1259304‑M1/91‑1 (MQ=255) GTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCaa < 2:1358615‑M1/91‑1 (MQ=255) ttagggatatcaatctacttcagatatccttatacatggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCaaa > 2:1791118‑M2/45‑91 (MQ=255) TATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCaaa < 2:1758023‑M1/91‑1 (MQ=255) taAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCACTGCACTTAAAAAGTCAAtga > 2:2291185/1‑91 (MQ=255) taAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAaga < 1:2316180/91‑1 (MQ=255) aaGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAagag < 2:2913921/91‑1 (MQ=255) aaGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAagag < 1:3486558/91‑1 (MQ=255) aGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAgg > 2:3562905/1‑91 (MQ=255) aGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAgg > 2:2886491/1‑91 (MQ=255) ggATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAATAGGa < 1:3122668/91‑1 (MQ=255) ggATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGa > 2:48745/1‑91 (MQ=255) tatCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACa > 1:2970046/1‑91 (MQ=255) tatCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACa > 2:1582522/1‑91 (MQ=255) tCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGc > 1:984336/1‑91 (MQ=255) tCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGc > 1:1204348/1‑91 (MQ=255) tGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCgg < 2:2122382/91‑1 (MQ=255) tGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCgg > 1:268052/1‑91 (MQ=255) tGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCgg > 1:631776/1‑91 (MQ=255) tGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCgg > 1:1987119/1‑91 (MQ=255) gAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTT‑AAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGaa > 2:1309823/1‑91 (MQ=255) aaGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGaa > 1:2718534/1‑91 (MQ=255) gTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATa < 1:2007272/91‑1 (MQ=255) gTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATa > 1:118849/1‑91 (MQ=255) gTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATa < 2:115169/91‑1 (MQ=255) aGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACa > 1:448277/1‑91 (MQ=255) gATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAg > 1:2353545/1‑91 (MQ=255) aTTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATATAga > 1:3191047/1‑91 (MQ=255) aTTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAga < 1:1099822/91‑1 (MQ=255) aTTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAga < 2:1438552/91‑1 (MQ=255) ttGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAgat > 1:223754/1‑91 (MQ=255) atCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGc > 1:1688095/1‑91 (MQ=255) tCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCt < 1:408688/91‑1 (MQ=255) acatggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGcac < 1:3359718‑M2/80‑1 (MQ=255) catggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGcaca > 2:2048170‑M2/11‑91 (MQ=255) atggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACaa > 2:3773329‑M2/10‑91 (MQ=255) atggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACaa > 1:3641030‑M2/10‑91 (MQ=255) atggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACaa > 2:3726978‑M2/10‑91 (MQ=255) ggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACt > 2:3338207‑M2/8‑91 (MQ=255) gggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTg > 1:67035‑M2/7‑91 (MQ=255) gggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTg > 1:1257915‑M2/7‑91 (MQ=255) ggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGc < 1:2487906‑M2/86‑1 (MQ=255) gtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCCTTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCa < 2:3120874‑M2/87‑1 (MQ=255) gtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCa > 2:3861417‑M2/5‑91 (MQ=255) tttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCAt < 1:3734601‑M2/88‑1 (MQ=255) | TTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCATAAA > USA300TCH1516_ALE/1149385‑1149565 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |