| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2537754 = | 71 (0.790) | 5 (0.060) | 5/250 | 13.5 | 6.9% | intergenic (+108/+46) | USA300TCH1516_02423/gpmA_2 | hypothetical protein/2,3‑bisphosphoglycerate‑dependent phosphoglycerate mutase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2537797 = | 70 (0.850) | intergenic (+151/+3) | USA300TCH1516_02423/gpmA_2 | hypothetical protein/2,3‑bisphosphoglycerate‑dependent phosphoglycerate mutase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGACTATATTGTATGTCTAACTATATTTTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATCAATGCGCGAATTGAA > USA300TCH1516_ALE/2537658‑2537935 | tGACTATATTGTATGTCTAACTATATTTTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCtttt < 1:461895/141‑1 (MQ=255) gACTATATTGTATGTCTAACTATATTGTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCttttt > 1:343504/1‑141 (MQ=255) gACTATATTGTATGTCTAAAAATATTTTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCttttt > 1:343380/1‑141 (MQ=255) aCTATATTGTATGTCTAACTATATTTTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCtttttt < 4:189813/141‑1 (MQ=255) tGTATGTCTAACTATATTTTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTCCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAagt < 1:651155/141‑1 (MQ=255) tATGTCTAACTATATTTTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAagtag < 1:452825/141‑1 (MQ=255) tGTCTAACTATATTTTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAgtagta > 1:106630/1‑141 (MQ=255) tGTCTAACTATATTTTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAgtagta > 1:689388/1‑141 (MQ=255) aCTATATTTTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATc > 2:664203/1‑141 (MQ=255) cTATATTTTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCt < 2:83059/141‑1 (MQ=255) ttttCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATTCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAAc > 2:127195/1‑141 (MQ=255) tCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTc > 1:488452/1‑141 (MQ=255) tCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTc < 3:33213/141‑1 (MQ=255) tCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTCTACATGCAGCCCTTTTTTTATACGTAGTATTTACCTATAACTTc > 2:535888/1‑141 (MQ=255) gTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTaaa < 1:625420/141‑1 (MQ=255) aTCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCACTTTTTTTATAAGTAGTATTTATATATAAATTCTAAatc > 1:78338/1‑141 (MQ=255) tCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAatca < 2:440489/141‑1 (MQ=255) tAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCg < 1:556411/141‑1 (MQ=255) gCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGtt < 2:46588/141‑1 (MQ=255) cTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTa < 4:100868/141‑1 (MQ=255) cGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATTTACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAAt > 2:701216/1‑141 (MQ=255) cGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAAt > 4:244442/1‑141 (MQ=255) ttAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTc < 4:12009/141‑1 (MQ=255) atatAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCCCATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATa > 3:184655/1‑141 (MQ=255) atatAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATa < 4:121520/141‑1 (MQ=255) tataAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATaa < 2:275320/141‑1 (MQ=255) ataAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATaaa > 2:425958/1‑141 (MQ=255) taAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTATTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAAc > 1:386136/1‑141 (MQ=255) aaCTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACaa < 2:615411/141‑1 (MQ=255) cTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCAc > 1:256105/1‑141 (MQ=255) tAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCt > 1:387756/1‑141 (MQ=255) tATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGttt < 1:263233/141‑1 (MQ=255) ttCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGTAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTaa < 2:134862/141‑1 (MQ=255) tCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAAt > 1:249156/1‑141 (MQ=255) ttACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTc < 2:106630/141‑1 (MQ=255) ttACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTc < 2:427112/141‑1 (MQ=255) ttACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTc < 2:233350/141‑1 (MQ=255) ttACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTc < 2:283744/141‑1 (MQ=255) aTTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTtaataa > 4:303929/1‑141 (MQ=255) ttACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCAtaat > 2:702219/1‑141 (MQ=255) aCTTCACATATTTAAGAGCTGAATATAAACTCACTCCCTGTGTACATGCAGCTATTTTTTTCTAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGAACCTGTTTTAATTAAAtaatta > 2:243422/1‑141 (MQ=255) caTATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGtt < 1:405379/120‑1 (MQ=255) caTATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGtt > 2:405379/1‑120 (MQ=255) caTATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGata > 2:273161/1‑141 (MQ=255) atatTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGatat > 3:239658/1‑141 (MQ=255) ttAAGAGCTGCATTTACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTc < 1:701216/141‑1 (MQ=255) ttAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTc < 1:664203/141‑1 (MQ=255) ttAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTc > 1:579882/1‑141 (MQ=255) agagCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGATCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATc < 3:77716/141‑1 (MQ=255) agCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTg > 2:297516/1‑141 (MQ=255) gCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGa < 1:140106/141‑1 (MQ=255) gCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGa > 2:185827/1‑141 (MQ=255) tGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTCTAAGTATTATTTATTTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTTTTTTAATTTCATAATTAATGATATTTTCATCTGaca > 2:424804/1‑141 (MQ=255) tGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGaca > 2:691939/1‑141 (MQ=255) cATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGAcaca > 4:87636/1‑141 (MQ=255) taCACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGATGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCtt > 1:243807/1‑141 (MQ=255) cactcactCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCa > 2:474960/1‑141 (MQ=255) actcactcCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCaa < 1:577620/141‑1 (MQ=255) ctcactcCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTGAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAg < 2:459202/141‑1 (MQ=255) tcactcCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGa > 3:184576/1‑141 (MQ=255) actcCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGata < 4:216525/141‑1 (MQ=255) ttGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTa < 1:300454/92‑1 (MQ=255) ttGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTa > 2:300454/1‑92 (MQ=255) ttGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTaa > 1:697346/1‑141 (MQ=255) ttGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAAATTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGAGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTaa > 3:229482/1‑141 (MQ=255) tgtgTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAAt < 1:22506/141‑1 (MQ=255) gtgtACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATc > 1:642144/1‑141 (MQ=255) gtgtACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATc > 2:677795/1‑141 (MQ=255) gtACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATCaa < 1:349850/141‑1 (MQ=255) aCATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATAAATg > 4:177437/1‑141 (MQ=255) aagCAGCTCTTTTTTTATAAGTAATATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCTTTAATTTATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATTATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATCAATtcg > 4:21263/3‑141 (MQ=255) aTGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATCAATgcg > 1:25517/1‑141 (MQ=255) aTGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATCAATgcg < 1:273161/141‑1 (MQ=255) tGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATCAATgcgc > 2:579560/1‑141 (MQ=255) ctctTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATCAATGCGCgaatt < 1:194047/141‑1 (MQ=255) tctTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATCAATGCGCgaattg < 1:301890/141‑1 (MQ=255) tttttttATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATCAATGCGCgaattgaa < 1:199206/141‑1 (MQ=255) | TGACTATATTGTATGTCTAACTATATTTTCGAGTATCCCTAGCTCGTTAATATAAACTCTATACTTAACTATTTCCTTACATTACTTCACATATTTAAGAGCTGCATATACACTCACTCCTTGTGTACATGCAGCTCTTTTTTTATAAGTAGTATTTATCTATAACTTCTAAATCATCCGTTAATTCATAAACAAGCGGTGCACCTGTTTTAATTTCATAATTAATGATATCTTCATCTGACACATCTTCAAGATATTTAATCAATGCGCGAATTGAA > USA300TCH1516_ALE/2537658‑2537935 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |