| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1265511 | 171 (0.900) | 21 (0.140) | 14/130 | NT | 12.3% | intergenic (+19/‑154) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1265527 | 160 (1.040) | intergenic (+35/‑138) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA | |||||
CACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/1265407‑1265511‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaagtatgttggaaaGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTTTG < USA300TCH1516_ALE/1265527‑1265438 CACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATA > 1:3799474/1‑91CACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATA > 1:754897/1‑91 ACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAA > 2:3785914/1‑91 ACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAA > 2:457009/1‑91 ATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAG > 2:2123536/1‑91 ATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAG > 2:2123309/1‑91 GTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTA > 1:2908352/1‑91 GTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTA > 1:2409100/1‑91 GTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGATTAATTATAAAGTA > 2:3278414/1‑91 TTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTAT > 2:1222779/1‑91 TTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTAT < 2:1942702/91‑1 TGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATG < 1:2657009/91‑1 TGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATG < 1:3732906/91‑1 TGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATG > 2:1456420/1‑91 GAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGT > 1:1751671/1‑91 GAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGT > 1:2651736/1‑91 GAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGT < 1:3657107/91‑1 AAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTT > 1:3628027/1‑91 AGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTG > 2:2539460/1‑91 AGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTG > 1:1862333/1‑91 AGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTG > 2:1101922/1‑91 GAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCGATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGG < 2:1279942/91‑1 GAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGG < 1:295734/91‑1 AATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGA > 2:376117/1‑91 AATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGA > 2:2735265/1‑91 AATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGA > 1:3432487/1‑91 AATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGA < 2:3473100/91‑1 AATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGA > 1:2687153/1‑91 ATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAA < 2:1602413/91‑1 TTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAA > 2:1492075/1‑91 TTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAA > 1:3391612/1‑91 TTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAA > 2:766898/1‑91 TTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAA > 1:2832651/1‑91 TTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAA > 2:301008/1‑91 TTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAA > 2:1492580/1‑91 GTGATTTCAACAAACCAGTAAGAGCAATTCTATAAAAATATGCAAAAAATATTTAGAAGGATTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTA < 2:1370572/91‑1 ATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAA < 1:1995247/91‑1 TTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATG > 2:859549/1‑73 TTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATG < 1:859549/73‑1 ACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTC < 2:2505570/91‑1 CCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCC < 2:754897/91‑1 CCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCC < 2:1495908/91‑1 GTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAAC < 2:2559403/91‑1 GTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAAC < 2:2587079/91‑1 GTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAAC < 1:2252638/91‑1 TAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACA < 1:2398500/91‑1 AAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACAT < 1:3795344/91‑1 AAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACAT < 2:1348914/91‑1 AAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACAT < 2:1247166/91‑1 AGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATA < 1:2610296/91‑1 AGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATA < 2:49068/91‑1 GACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATAC < 2:1964362/91‑1 ATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTAT < 2:891806/91‑1 ATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTAT < 1:1514740/91‑1 TTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATA < 1:3398319/91‑1 TCTATATAGATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAA < 2:263677/91‑1 TATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATT < 1:1721846/91‑1 ATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAA < 1:3785914/91‑1 AAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTG > 2:3441810/1‑91 AAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTG > 1:2234820/1‑91 AAAGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTG > 1:535846/1‑91 AGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGT > 2:275761/1‑91 AGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGT < 1:391291/91‑1 AGTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGT < 2:3489556/91‑1 GTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTC < 1:2715917/91‑1 GTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTC < 2:3161728/91‑1 GTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTC < 1:2275517/91‑1 GTATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTC < 1:1056998/91‑1 ATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTT < 1:118366/91‑1 ATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTT > 1:261248/1‑91 ATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTT < 1:2278520/91‑1 ATGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTT < 1:2192914/91‑1 TGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTA > 2:966027/1‑91 TGTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTA > 1:414811/1‑91 GTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTAC < 2:3792419/91‑1 GTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTAC < 2:3458928/91‑1 GTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTAC < 2:1908514/91‑1 GTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTAC < 2:1908556/91‑1 GTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTAC < 2:2709162/91‑1 GTTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTAC < 2:2045249/91‑1 TTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACT < 2:3182940/91‑1 TTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACT > 2:1980723/1‑91 TTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACT > 1:2177731/1‑91 TTGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACT > 2:3756836/1‑91 TGGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTG > 2:3008356/1‑91 GGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGG < 2:3129039/91‑1 GGAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGG > 2:1547727/1‑91 GAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGT < 1:2139977/91‑1 GAAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGT > 1:3000201/1‑91 AAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATTAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTT > 2:2262178/1‑91 AAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTT < 1:1217833/91‑1 AAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTT < 1:3658640/91‑1 AAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTT < 1:3244822/91‑1 AAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTT > 2:3391612/1‑91 AAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTT > 2:2045672/1‑91 AAAGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTT > 2:2046219/1‑91 AGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTTTG < 1:3036173/91‑1 AGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTTTG < 1:319880/91‑1 AGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTTTG < 2:2644407/91‑1 CACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/1265407‑1265511‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaagtatgttggaaaGAATTTAAAATTTCAATTTCCAACATACTTTATAATTAAACCTTATAAATAAGTTTTGCAAATTTATATAGAATTGGTCTTACTGGTTTG < USA300TCH1516_ALE/1265527‑1265438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |