New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1747135 | 151 (0.790) | 16 (0.100) | 11/132 | NT | 10.2% | intergenic (‑169/+34) | recJ/USA300HOU_RS08710 | Single‑stranded‑DNA‑specific exonuclease RecJ/Heme uptake protein MmpL11 |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1747146 | 157 (1.000) | intergenic (‑180/+23) | recJ/USA300HOU_RS08710 | Single‑stranded‑DNA‑specific exonuclease RecJ/Heme uptake protein MmpL11 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/1747032‑1747135 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagcggtatgtgaaACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAAAATG < USA300TCH1516_ALE/1747146‑1747058 CTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAA > 1:3583050/1‑91 TAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAA > 1:3789281/1‑91 TAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAA < 1:961790/91‑1 AAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAG > 2:539699/1‑91 AAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAG > 1:3391272/1‑91 AATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGC > 2:2617158/1‑91 AATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGC > 2:2257373/1‑91 AATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGC > 1:1917712/1‑91 AATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGC > 1:1915528/1‑91 AATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGC > 1:1226549/1‑91 AATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGC > 2:2616062/1‑91 AATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGC > 1:314309/1‑91 ATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCG < 1:1753293/91‑1 ATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCG > 2:3675966/1‑91 ATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCG < 2:2916167/91‑1 ATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCG < 2:2915929/91‑1 TAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAGTGACTGCGGGAACTTATTTAT‑ATATCTTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGG > 1:3094348/1‑91 TAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATAATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCG > 1:1774758/1‑91 TAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGG < 2:3652133/91‑1 TAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAA < 2:1593503/87‑1 TAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAA > 1:1593503/1‑87 TAAACAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTATAAAGCGG > 2:3444075/1‑91 ATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTA > 2:2590478/1‑91 ATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTA > 1:3756455/1‑91 ATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTA < 2:1551893/91‑1 ATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTA > 2:3083103/1‑91 ATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTA < 2:3778393/91‑1 TCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTAT > 2:1485169/1‑91 CAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATG > 1:2570698/1‑91 CAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATG < 1:1371709/91‑1 CAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATG < 1:2874422/91‑1 AAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑GTATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGT < 2:3194062/91‑1 AAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGT > 2:217174/1‑91 AAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGT < 2:1484688/91‑1 AAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGT > 1:1055649/1‑91 AGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAATTGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTAGGTG > 2:1600236/1‑91 AGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTG > 1:1207184/1‑91 AGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTG > 1:1207249/1‑91 AGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTG > 1:967850/1‑91 AGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTG > 1:1659124/1‑91 AGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTG < 2:2538407/91‑1 AGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTG > 1:2455151/1‑91 GACTTTAATTATGCCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATATGA > 1:3004931/1‑91 GACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGA < 1:856483/91‑1 ACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAA < 2:2756070/91‑1 ACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAA > 2:1342564/1‑91 ACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAA > 1:2619465/1‑91 ACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAG < 1:364815/91‑1 ACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAG < 1:1289030/91‑1 ACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAG < 1:363868/91‑1 CATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTT < 1:47025/91‑1 CATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTT < 1:2828205/91‑1 ATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTC < 1:2594384/91‑1 TTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCAC < 1:232683/91‑1 TTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATA < 1:3241049/91‑1 TTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATA < 1:3238863/91‑1 TAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATAC < 1:2886191/91‑1 TAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATAC < 1:2507999/91‑1 AAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGC < 2:1584559/91‑1 GGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTA < 1:992783/91‑1 AACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATT < 2:157595/91‑1 ttAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCA > 2:1707526/3‑91 AAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCAT > 1:1298606/1‑91 AGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATT < 2:2269405/91‑1 AGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATT > 1:1126556/1‑91 AGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATT > 1:1126567/1‑91 AGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTCTATTTAAATTAAACAAAATCTATATAAATAAGTTCCCGCATTCATc > 1:144583/1‑90 GCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTT > 2:141611/1‑91 GCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTT > 2:1069749/1‑91 GCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTT < 2:2090700/91‑1 GCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTT < 1:1785398/91‑1 aGGTATGAGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTT < 2:3336249/90‑1 CGGTATGTGAAGCAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAGATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTT < 2:2963478/91‑1 CGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTTCTTTTTTTTAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCTCGCATTCATTTT > 2:1617518/1‑91 CGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTT < 1:2114817/91‑1 CGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTT > 1:3869726/1‑91 CGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTT < 1:3806982/91‑1 CGGTACGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTT < 2:3575333/91‑1 GGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTT < 1:2441029/91‑1 GTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTA < 2:2978630/91‑1 GTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTA > 1:328266/1‑91 GTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTA > 1:328794/1‑91 TATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTta < 1:3830359/91‑3 TATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAA > 2:2455151/1‑91 TATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAA < 1:1210627/91‑1 TATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAA < 1:1210349/91‑1 ATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAA < 2:3520454/91‑1 ATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAA > 1:3042861/1‑91 ATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAA < 1:2963628/91‑1 ATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAA > 2:1489863/1‑91 ATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAA > 1:79111/1‑91 ATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTATACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCAATCAATTTTAAA < 2:3521130/91‑1 TGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAA > 2:3307808/1‑91 TGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAA > 2:1443528/1‑91 TGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAAAA > 1:1802892/1‑91 TGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAAAA > 1:1693781/1‑91 GAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAAAAT > 1:3831355/1‑91 GAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAAAAT > 2:1973071/1‑91 AAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAAAATG < 2:2266490/91‑1 AAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAAAATG < 2:2266400/91‑1 CTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTAT‑ATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/1747032‑1747135 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagcggtatgtgaaACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAAAATG < USA300TCH1516_ALE/1747146‑1747058 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |