| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2256409 | 114 (0.600) | 28 (0.180) | 13/132 | NT | 21.1% | intergenic (+62/+59) | deoD1/dps | Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1/General stress protein 20U |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2256428 | 116 (0.740) | intergenic (+81/+40) | deoD1/dps | Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1/General stress protein 20U | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2256306‑2256409‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaagccaacacatAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGC < USA300TCH1516_ALE/2256428‑2256339 TTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAA > 1:3655832/1‑91TTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAA > 1:2739018/1‑91 TTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAA > 1:1205006/1‑91 TTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAA > 1:1744601/1‑91 ACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAA > 2:1266555/1‑91 ACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAA < 1:1181183/91‑1 CACAAATGATGGAAATCGCTTTAGATATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGATCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAG < 2:3384864/91‑1 CACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAG > 1:3798597/1‑91 CACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAG > 2:696710/1‑91 ACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGC < 1:594535/91‑1 CAAATGATTGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCC < 2:3397186/91‑1 CAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCC < 2:2807250/91‑1 CAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCC < 2:884364/91‑1 AAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCA < 1:1568350/91‑1 AAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCA > 1:3853986/1‑91 AATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAA > 2:692001/1‑91 AATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAA > 2:2287878/1‑91 AATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAA > 2:2287865/1‑91 AATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAA > 2:2287461/1‑91 ATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAAC < 1:3567463/91‑1 ATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAAC > 1:1743794/1‑91 ATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAAC < 2:607048/91‑1 TGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAATGCCAACA > 1:1938299/1‑91 TGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAACGCCAACA > 1:1939348/1‑91 TGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACA < 1:1058382/91‑1 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 2:3266791/91‑1 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 2:3266206/91‑1 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC > 2:3527046/1‑91 GATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 1:3340059/91‑1 ATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA > 1:2490316/1‑91 ATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA > 1:1415528/1‑91 ATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA > 1:3330915/1‑91 TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT > 2:1961441/1‑91 TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT < 2:1759541/91‑1 TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT < 2:1759362/91‑1 TGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT < 1:2929002/91‑1 TAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATAC < 2:1642772/91‑1 TAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATAC < 1:3800926/91‑1 TCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAG < 1:3561013/91‑1 CGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGA < 2:3199958/91‑1 GCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAA < 2:2844996/91‑1 GCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAA < 1:2154108/91‑1 CAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAAT < 1:359889/91‑1 AGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATG < 1:3773723/91‑1 AGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATG < 1:1039431/91‑1 AGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATG < 1:1961441/91‑1 AGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATG < 1:909605/91‑1 GAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGT < 1:345851/91‑1 GAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGT < 1:2390836/91‑1 GAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGT < 1:660932/91‑1 GAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGT < 2:2725117/91‑1 GAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGT < 1:345600/91‑1 GAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCGTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGTATACGCCCAGAATGT < 1:3304479/91‑1 GAGTAACTTATGTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAAGGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGT < 2:3347627/91‑1 GAGTAACGTATTTAAATTGACTGTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGT < 1:1931279/91‑1 GTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGT < 2:91054/91‑1 GTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGT < 2:2381634/91‑1 TAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTT < 1:2640423/91‑1 TAACTTATTTAAATTAACTTTAATTGTTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTT < 2:3359549/91‑1 AACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTG < 2:1492559/91‑1 AACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTG < 2:2165854/91‑1 ACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGG < 1:110543/91‑1 CTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGC < 1:1238091/91‑1 TTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACA < 1:826137/55‑1 TTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACA > 2:826137/1‑55 AATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAG < 1:124537/91‑1 TTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC > 2:493247/1‑50 TTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 1:493247/50‑1 ACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAAT < 1:2094921/91‑1 AAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAA < 1:3195869/91‑1 AAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAAT > 2:1308630/1‑91 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAA > 2:2556297/1‑91 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAA < 1:121628/91‑1 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAA < 2:1121460/91‑1 GCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAG < 1:2768254/91‑1 CCAACACATAGATGGGGATACGCAGAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAGTCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGT < 2:3603066/91‑1 CCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGT > 1:1065352/1‑91 CCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAAAGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTAAAATAAGT > 2:3375233/1‑91 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTT > 1:544789/1‑91 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTT < 1:647639/91‑1 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTT > 2:3291761/1‑91 AACACATAGGTGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTGATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTA < 2:1251181/91‑1 AACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTA < 1:1919631/91‑1 AACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTA > 2:1302677/1‑91 AACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTA < 1:2849071/91‑1 AACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTA < 1:2849137/91‑1 AACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTA > 2:1931734/1‑91 ACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTAC > 2:2864704/1‑91 ACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTAC > 1:747903/1‑91 CACATAAATGGGGATACGCCCAGCATGTGATGGCTTTTTGAGATTAAGCGCATTGTGAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACT > 2:3568375/1‑91 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACT < 2:1320419/91‑1 ACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTC < 2:2882122/91‑1 ACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTC < 2:2882089/91‑1 ACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTC < 1:428159/91‑1 ACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTC < 2:1803115/91‑1 ACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGGGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTCAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATCAGTTACTC > 2:2876440/1‑91 CATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCT < 2:2905364/91‑1 TAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGC > 1:1969870/1‑91 TAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGC < 2:3078842/91‑1 TAAATGGGGAGACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGC < 1:3342767/91‑1 TTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2256306‑2256409‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaagccaacacatAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGC < USA300TCH1516_ALE/2256428‑2256339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |