| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 598632 = | 200 (1.050) | 12 (0.080) | 8/124 | NT | 8.4% | intergenic (+181/+101) | tuf/yxeP_2 | Elongation factor Tu/putative hydrolase YxeP |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 598687 = | 107 (0.730) | intergenic (+236/+46) | tuf/yxeP_2 | Elongation factor Tu/putative hydrolase YxeP | |||||
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
TAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTA > USA300TCH1516_ALE/598542‑598722 | tttaaaaatcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgaa > 2:306249‑M1/90‑91 (MQ=255) ttaaaaatcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgaaa > 2:1334180‑M1/89‑91 (MQ=255) ttaaaaatcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgaaa > 2:3176737‑M1/89‑91 (MQ=255) ttaaaaatcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgaaa > 2:1378214‑M1/89‑91 (MQ=255) gaagaaCAATAATTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTaaaa < 2:2422168/91‑1 (MQ=255) taaaaatcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAAt > 2:2732548‑M1/88‑91 (MQ=255) aagaaCAATAATTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAAt < 2:1602719/91‑1 (MQ=255) aaaaatcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATg < 1:1977760‑M1/5‑1 (MQ=255) aaaaatcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATg > 2:2643505‑M1/87‑91 (MQ=255) aaaatcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGc < 2:2335363‑M1/6‑1 (MQ=255) aaatcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCt > 1:2251127‑M1/85‑91 (MQ=255) aaCAATAATTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCt < 1:1483435/91‑1 (MQ=255) aatcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTc > 1:1842782‑M1/84‑91 (MQ=255) aCAATAATTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTc < 1:131217/91‑1 (MQ=255) atcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatcagagacataaactaatgAAATGCTcc < 1:3599261‑M1/9‑1 (MQ=255) tcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTccc > 2:3578565‑M1/82‑91 (MQ=255) tcatagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTccc < 1:3539861‑M1/10‑1 (MQ=255) ataatTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCt < 2:1951754/91‑1 (MQ=255) ataatTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCt < 2:1952764/91‑1 (MQ=255) ataatTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCt > 1:2963726/1‑91 (MQ=255) taatTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCtt < 2:3223308/91‑1 (MQ=255) tagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTc > 2:753984‑M1/79‑91 (MQ=255) tagaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTc < 1:2302490‑M1/13‑1 (MQ=255) aatTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTc < 2:309424/91‑1 (MQ=255) agaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCa < 1:565575‑M1/14‑1 (MQ=255) agaattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCa < 1:3158887‑M1/14‑1 (MQ=255) tgatgaAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCaaa > 1:1213763/1‑91 (MQ=255) aattagagcaagtatttaaaacaaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCaaa > 2:3347865‑M1/76‑91 (MQ=255) tgaAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGtt > 2:1666980/1‑91 (MQ=255) tgaAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGtt < 2:49384/91‑1 (MQ=255) tgaAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGtt < 1:2894599/91‑1 (MQ=255) gaAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGttt < 1:2078461/91‑1 (MQ=255) gaAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGttt < 1:2925365/91‑1 (MQ=255) gaAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGttt > 1:3384239/1‑91 (MQ=255) gaAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGttt < 2:3024179/91‑1 (MQ=255) aaaGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGtttt < 1:2874279/91‑1 (MQ=255) aaaGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGtttt > 2:565575/1‑91 (MQ=255) aaGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAACTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCACTTCAAAGTTTTc > 1:3877852/1‑91 (MQ=255) aGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAAGAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCa > 1:3367326/1‑91 (MQ=255) gactgactAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCAt < 2:3321072/91‑1 (MQ=255) gactgactAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCAt < 2:723849/91‑1 (MQ=255) gactgactAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCAt < 2:2807155/91‑1 (MQ=255) actgactAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCAtt < 1:2230005/91‑1 (MQ=255) aataaAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCaa < 2:1112002/91‑1 (MQ=255) ataaAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAAt > 2:2572141/1‑91 (MQ=255) ataaAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAAt < 1:2148419/91‑1 (MQ=255) aaaCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTc < 1:1691122/91‑1 (MQ=255) aaaCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTc < 1:1280581/91‑1 (MQ=255) caaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCt > 1:1777395‑M1/55‑91 (MQ=255) caaattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCt > 2:2119436‑M1/55‑91 (MQ=255) aaCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCt < 1:1332584/91‑1 (MQ=255) aCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTa > 1:1182440/1‑91 (MQ=255) aattaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTAc > 2:889780‑M1/53‑91 (MQ=255) ttATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACt < 1:2705917/91‑1 (MQ=255) ttaagcatttaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACtt > 1:1852772‑M1/51‑91 (MQ=255) tataACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACtt < 1:3332579/91‑1 (MQ=255) ataACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACttt > 1:211477/1‑91 (MQ=255) ataACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACttt < 2:1475008/91‑1 (MQ=255) ataACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACttt < 2:2311077/91‑1 (MQ=255) ataACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTATTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATCTCTACttt > 2:3374218/1‑91 (MQ=255) taACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTg > 1:65334/1‑91 (MQ=255) taACTGATAATACAGTTTAAATAAAATTATTGAGCCTTGGACATTGTAAAATGCTCCTCTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTg < 1:3703266/91‑1 (MQ=37) gcattgaaattaattgaaagatatgaatctgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGaa > 2:3138491‑M1/47‑91 (MQ=255) aCTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGaa < 1:1541126/91‑1 (MQ=255) cTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAg > 1:712029/1‑91 (MQ=255) gATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAggg < 1:763626/91‑1 (MQ=255) ataataCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGa > 2:3211580/1‑91 (MQ=255) ataataCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGa > 2:3210974/1‑91 (MQ=255) ataataCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGa < 2:237874/91‑1 (MQ=255) ataCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCa < 1:1515219/91‑1 (MQ=255) taCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCAt > 1:1638101/1‑91 (MQ=255) taCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACAGTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCAt < 1:3440615/91‑1 (MQ=255) aCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCAtt < 2:2686468/91‑1 (MQ=255) cTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCAttt > 1:1830548/1‑91 (MQ=255) cTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCAttt > 1:981212/1‑91 (MQ=255) cTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCAttt < 1:928180/91‑1 (MQ=255) gTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCa < 2:1482889/91‑1 (MQ=255) tttAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCAt > 2:1799855/1‑91 (MQ=255) tttAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCAt > 1:836577/1‑91 (MQ=255) tttAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCAt > 1:1913388/1‑91 (MQ=255) aataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt < 2:3647971/91‑1 (MQ=255) aataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt > 1:2589792/1‑91 (MQ=255) aataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt > 1:2624717/1‑91 (MQ=255) ataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGtt > 1:2784210/1‑91 (MQ=255) aaaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTAt > 1:2483467/1‑91 (MQ=255) aaaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTAt < 1:1052710/91‑1 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCTTTTTCTATTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg > 2:3700818/1‑91 (MQ=37) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg < 2:831981/91‑1 (MQ=255) ttgttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGtc < 2:65334/91‑1 (MQ=255) gttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGtctc > 2:3264844/1‑91 (MQ=255) gttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGtctc > 1:206621/1‑91 (MQ=255) ttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCa < 1:2630878/91‑1 (MQ=255) tgagacataaactaatgAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGa > 1:1069543‑M1/18‑91 (MQ=255) aGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGAt < 1:1112592/91‑1 (MQ=255) ttGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCat < 2:1842651/91‑1 (MQ=255) ttGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCat < 2:954687/91‑1 (MQ=255) aCATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCt < 2:353976/91‑1 (MQ=255) ttGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTc > 2:430395/1‑91 (MQ=255) ttGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTc < 1:462993/91‑1 (MQ=255) aaaaTGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaatt < 1:2528387/91‑1 (MQ=255) | TAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTA > USA300TCH1516_ALE/598542‑598722 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |