| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 668580 = | 197 (1.030) | 15 (0.080) | 9/152 | NT | 7.7% | coding (565/1011 nt) | adh | Alcohol dehydrogenase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 668601 = | 172 (0.950) | coding (586/1011 nt) | adh | Alcohol dehydrogenase | |||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
GTAAAACCTGGACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAG > USA300TCH1516_ALE/668490‑668670 | taatttcataacttctgcaactggatcaacatctttagaattaataatagcatcagcacctaattctttcgcgaatgctaatttatcatca < 2:212549‑M1/1‑1 (MQ=255) tAAAACCTGGACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAAt < 1:729454/91‑1 (MQ=255) tAAAACCTGGACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAAt < 2:536838/91‑1 (MQ=255) aatttcataacttctgcaactggatcaacatctttagaattaataatagcatcagcacctaattctttcgcgaatgctaatttatcatcat < 2:2551366‑M1/2‑1 (MQ=255) aatttcataacttctgcaactggatcaacatctttagaattaataatagcatcagcacctaattctttcgcgaatgctaatttatcatcat < 2:3470963‑M1/2‑1 (MQ=255) atttcataacttctgcaactggatcaacatctttagaattaataatagcatcagcacctaattctttcgcgaatgctaatttatcatcAtt > 1:3243693‑M1/89‑91 (MQ=255) tttcataacttctgcaactggatcaacatctttagaattaataatagcatcagcacctaattctttcgcgaatgctaatttatcatcAttg < 1:3544934‑M1/4‑1 (MQ=255) tttcataacttctgcaactggatcaacatctttagaattaataatagcatcagcacctaattctttcgcgaatgctaatttatcatcAttg > 1:2085806‑M1/88‑91 (MQ=255) aaaCCTGGACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAAttg > 1:1221069/1‑91 (MQ=255) aaCCTGGACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAAttgt < 1:3853865/91‑1 (MQ=255) aCCTGGACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAAttgtt > 2:2392364/1‑91 (MQ=255) aCCTGGACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAAttgtt < 2:2862649/91‑1 (MQ=255) aCCTGGACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAAttgtt < 1:199521/91‑1 (MQ=255) aCCTGGACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAAttgtt > 1:1772491/1‑91 (MQ=255) ccTGGACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAAttgttg < 2:2199352/91‑1 (MQ=255) ggACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCt > 1:1390030/1‑91 (MQ=255) ggACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCt > 2:1185571/1‑91 (MQ=255) gACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCtt > 1:1734234/1‑91 (MQ=255) gACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCtt > 2:2127837/1‑91 (MQ=255) gACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCtt < 1:132524/91‑1 (MQ=255) cAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCg > 2:3470352/1‑91 (MQ=255) aaTGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGa < 2:923351/91‑1 (MQ=255) aaTGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGa < 1:961996/91‑1 (MQ=255) aTGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGAc < 2:1450670/91‑1 (MQ=255) aTGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGAc < 2:700013/91‑1 (MQ=255) aTGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGAc > 1:271602/1‑91 (MQ=255) aTGGTTAGGTGTTGTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGAc < 2:1505775/91‑1 (MQ=255) tGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACa > 2:628147/1‑91 (MQ=255) ttAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCa > 2:3863682/1‑91 (MQ=255) tAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACGTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCaa > 2:3802357/1‑91 (MQ=255) tAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCaa > 2:1848865/1‑91 (MQ=255) ctggatcaacatctttagaattaataatagcatcagcacctaattctttcgcgaatgctaatttatcatcATTGTTGCCTTCGACATCAat > 1:3031147‑M1/71‑91 (MQ=255) tgtTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAatgat < 2:2047690/91‑1 (MQ=255) ttttGGTATAGGTGGATTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGACTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATgatgat > 1:3312508/1‑91 (MQ=255) ttGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATaa < 2:3025899/91‑1 (MQ=255) tGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATaaa > 2:2837783/1‑91 (MQ=255) gTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAAtt > 1:904170/1‑91 (MQ=255) tataGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTa < 2:183864/91‑1 (MQ=255) ataGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAg > 1:3058581/1‑91 (MQ=255) taGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGc > 2:592723/1‑91 (MQ=255) aGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCa > 2:1374074/1‑91 (MQ=255) gtggtTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCAtt < 1:93769/91‑1 (MQ=255) ggtTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAGAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTcg > 1:3444143/1‑91 (MQ=255) ggtTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTcg < 2:3269118/91‑1 (MQ=255) gtTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTcgc > 2:2934306/1‑91 (MQ=255) gtTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTcgc > 1:1351187/1‑91 (MQ=255) gtTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTcgc > 1:2577152/1‑91 (MQ=255) tttAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTcgcg < 2:618924/91‑1 (MQ=255) tttAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTcgcg > 1:2411955/1‑91 (MQ=255) ttAGGTAACCTAGCTTTACAATACGCTAATGACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGCCACCCATGCTGGTAAATTAGCATTcgcgc > 2:2519539/1‑90 (MQ=255) tAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGaa > 2:1964082/1‑91 (MQ=255) aGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGaaa > 2:423418/1‑91 (MQ=255) ggTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAg < 2:2662615/91‑1 (MQ=255) gTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGATAGa > 1:3009093/1‑91 (MQ=255) tAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGGGAAAGaa > 2:3444701/1‑91 (MQ=255) tAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGaa < 2:3851158/91‑1 (MQ=255) aCCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAAtt > 1:575280/1‑91 (MQ=255) cTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAg < 1:2730/91‑1 (MQ=255) tAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAgg < 1:1441937/91‑1 (MQ=255) gCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTg > 1:2495203/1‑91 (MQ=255) gCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTg < 2:734133/91‑1 (MQ=255) cTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGc > 2:482765/1‑91 (MQ=255) cTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATGCGCGAAAGAATTAGGTGc > 1:1019463/1‑91 (MQ=255) ttACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTg > 2:2853345/1‑91 (MQ=255) ttACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTg < 1:3121163/91‑1 (MQ=255) tACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGa > 1:295084/1‑91 (MQ=255) tACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTACTGa < 2:2224568/91‑1 (MQ=255) aCAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGAt > 2:1269430/1‑91 (MQ=255) aCAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGAt < 1:2013912/91‑1 (MQ=255) aCAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGAt > 2:1425777/1‑91 (MQ=255) tatGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCta > 2:3081461/1‑91 (MQ=255) tatGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCta < 2:3315719/91‑1 (MQ=255) atGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCtat > 1:513168/1‑91 (MQ=255) tGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCtaat > 1:2512814/1‑89 (MQ=255) ttcgcgaatgctaatttatcatcATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCtattat > 1:1623831‑M1/24‑91 (MQ=255) ttcgcgaatgctaatttatcatcATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCtattat > 1:29942‑M1/24‑91 (MQ=255) tAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTattatt < 2:1930017/91‑1 (MQ=255) tAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTattatt < 2:3755476/91‑1 (MQ=255) aaaCGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAAt < 2:3637892/91‑1 (MQ=255) aCGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTattatt < 2:3152174/86‑1 (MQ=255) aCGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTattatt > 1:3154946/1‑86 (MQ=255) aCGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTc < 2:2469031/91‑1 (MQ=255) aCGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTc < 2:2299267/91‑1 (MQ=255) cGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCt < 2:3572298/91‑1 (MQ=255) gTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTa > 1:3675647/1‑91 (MQ=255) tATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTaaa < 2:1644952/91‑1 (MQ=255) tATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTaaa > 1:1849816/1‑91 (MQ=255) aTGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAg < 1:3081461/91‑1 (MQ=255) aTGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAg > 2:1479235/1‑91 (MQ=255) ggggCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATg > 1:868902/1‑91 (MQ=255) gggCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGt > 1:3421241/1‑91 (MQ=255) gCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTg < 1:2178411/91‑1 (MQ=255) cTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGa > 1:1140133/1‑91 (MQ=255) cTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGa > 1:164875/1‑91 (MQ=255) aaaaTTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATc > 1:2299453/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCa > 1:3292901/1‑91 (MQ=255) ATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAg < 1:3218733‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAg < 1:1252814‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAg < 2:2023434‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATCATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAg < 1:2303603‑M1/91‑1 (MQ=255) | GTAAAACCTGGACAATGGTTAGGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAG > USA300TCH1516_ALE/668490‑668670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |